1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
second leaf,natural sun/80% shade
third leaf,2-year-old,no treatment
third leaf,2-year-old,shade treatment
fourth leaf,10-year-old,no treatment
fourth leaf,10-year-old,shading treatment
two leaves and a bud,blue light 15d
two leaves and a bud,blue/red (1:1) light 15d
two leaves and a bud,red light 15d
two leaves and a bud,white light 15d
second leaf,missing,no treatment
leaf,missing,no treatment
two leaves and a bud,missing,no treatment
tender leaf,red/white (2:3) light 10d
tender leaf,white light 10d
0.04 0.08 0.0 0.0 0.05 0.1 0.06 0.07 0.13 0.0 0.06 0.01 0.01 0.01
0.29 0.31 0.19 0.08 0.16 0.42 0.65 1.09 1.02 0.12 0.0 0.39 0.14 0.08
0.11 0.11 0.04 0.26 0.12 0.39 0.0 0.0 0.38 0.15 0.0 0.0 0.09 0.15
0.05 0.33 0.38 0.0 0.0 0.57 0.43 0.31 2.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.21 0.0 0.18 0.25 0.41 0.13 0.53 0.06 0.12 0.0 0.0 0.13
0.05 0.0 0.02 0.0 0.2 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.1 0.2 0.27 0.33 0.16 0.14 0.4 0.27 0.11 0.09 0.0 0.28 0.04
0.09 0.35 0.81 0.37 0.31 0.22 0.77 0.49 0.52 0.36 0.17 0.0 0.27 0.16
0.92 0.5 0.72 1.83 0.0 3.22 2.38 2.76 1.7 2.57 2.58 0.0 1.58 1.14
0.07 0.14 0.09 0.29 0.23 0.0 0.12 0.11 0.23 0.1 0.32 0.0 0.07 0.17
0.14 0.34 0.2 1.05 0.32 0.16 0.83 0.33 0.33 0.21 0.55 0.38 0.88 0.5
0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.09 0.19 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.15 0.05
0.12 0.1 0.12 0.0 0.0 0.53 0.28 0.14 0.14 0.0 0.25 0.37 0.55 0.35
0.44 0.29 0.24 0.51 0.17 0.62 0.49 0.45 1.13 0.24 0.85 0.07 0.55 0.75
0.48 0.11 0.35 0.62 0.36 0.0 0.28 0.0 0.54 0.25 0.24 0.28 0.31 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.59 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.2 0.0 0.04 0.11 0.01 0.1 0.37 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.72 0.72 0.1 1.09 0.58 1.24 0.32 1.14 1.7 0.0 0.85 1.4 2.03
0.03 0.0 0.04 0.0 0.08 0.11 0.0 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.14 0.18
0.25 0.0 0.22 0.28 0.51 0.21 0.33 0.11 0.54 0.09 0.21 0.3 0.31 0.16
0.82 0.69 0.96 0.73 0.55 0.79 0.0 0.27 1.06 0.38 1.12 0.68 0.81 0.68
0.33 0.12 0.38 0.0 0.0 0.46 0.68 0.72 1.5 0.27 0.0 0.0 0.15 0.07
0.07 0.06 0.11 0.07 0.0 0.11 0.28 0.39 0.74 0.14 0.16 0.0 0.12 0.26
2.51 0.67 0.83 1.46 2.24 3.58 2.85 3.11 4.33 1.66 1.13 0.75 1.17 1.07
0.18 0.06 0.35 0.09 0.1 0.44 0.4 0.31 0.89 0.12 0.15 0.1 0.24 0.49
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.22 0.66 0.13 0.11 0.14 0.5 0.24
0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.23 0.04 0.16 0.14
0.07 0.0 0.26 0.1 0.21 0.0 0.32 0.0 0.62 0.16 0.13 0.0 0.19 0.32
0.07 0.09 0.13 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.1 0.11 0.0 0.27 0.0
0.16 0.18 0.2 0.0 0.09 0.0 0.37 0.48 1.18 0.47 0.0 0.24 0.81 0.3
0.03 0.32 0.26 0.0 0.0 0.19 0.69 1.16 1.9 0.12 0.23 0.0 0.05 0.0
0.17 0.08 0.35 0.22 0.28 0.2 0.14 0.11 0.13 0.16 0.26 0.04 0.11 0.16
0.32 0.92 0.86 0.07 0.4 1.24 0.71 1.1 1.49 0.8 0.78 0.0 0.11 0.34
0.04 0.12 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.05 0.0 0.0 0.14 0.12
0.17 0.0 0.18 0.0 0.14 0.52 0.0 0.1 0.8 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
0.01 0.09 0.0 0.07 0.32 0.0 0.0 0.12 0.24 0.02 0.22 0.25 0.07 0.0
0.23 0.15 0.31 0.31 0.11 0.53 0.59 0.93 1.36 0.58 0.15 0.09 1.38 0.33
0.79 0.79 0.84 0.56 0.29 0.91 0.74 0.66 0.9 1.26 0.5 0.06 0.58 0.45
0.09 0.08 0.07 0.04 0.1 0.2 0.1 0.06 0.15 0.06 0.06 0.0 0.02 0.02
0.14 0.04 0.22 0.11 0.11 0.36 0.17 0.09 0.1 0.22 0.19 0.1 0.18 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08
0.28 0.57 1.0 0.72 0.41 1.0 1.9 0.31 1.44 0.56 0.61 0.0 0.3 0.13
0.33 0.15 0.44 0.08 0.04 0.8 0.13 0.2 2.73 0.29 0.19 0.03 0.03 0.07
0.17 0.0 0.25 0.0 0.0 0.39 0.21 0.1 0.1 0.26 0.0 0.0 0.0 0.68
0.17 0.11 0.08 0.15 0.0 0.0 0.46 0.45 0.68 0.05 0.21 0.3 0.26 0.32
0.05 0.0 0.1 0.0 0.11 0.18 0.16 0.0 0.49 0.04 0.0 0.0 0.1 0.09
0.03 0.0 0.21 0.0 0.12 0.0 0.18 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0
0.02 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09
0.24 0.18 0.11 0.13 0.14 0.33 0.19 0.0 0.0 0.12 0.52 0.0 0.0 0.0
0.15 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 1.46 0.18 0.59 2.15 0.27 0.44
0.18 0.1 0.28 0.25 0.21 0.07 0.55 0.47 0.86 0.51 0.0 0.24 0.24 0.24
0.26 0.32 0.43 0.33 0.58 0.34 0.53 0.36 1.52 0.11 0.57 0.48 0.2 0.11
0.6 0.36 0.76 0.3 0.61 0.0 0.74 0.3 0.6 0.59 0.49 0.11 0.78 0.75
0.32 0.39 0.51 0.11 0.0 0.42 0.21 0.35 2.99 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.71 1.11 0.82 0.55 1.28 2.41 0.37 0.72 0.9 0.26 0.29 1.19 0.42 0.27
0.04 0.06 0.09 0.0 0.14 0.4 0.29 0.16 0.53 0.12 0.0 0.0 0.24 0.0
0.53 0.13 0.5 0.66 2.41 0.34 0.97 0.9 1.87 1.27 1.29 0.74 2.41 1.2
0.4 0.57 1.08 0.11 0.15 0.1 1.97 0.91 2.54 0.36 0.0 0.0 0.04 0.0
0.59 0.74 0.86 0.2 0.51 1.51 1.06 0.34 1.75 0.59 0.14 0.0 0.63 0.58
0.11 0.05 0.0 0.0 0.07 0.0 0.6 0.07 0.59 0.22 0.0 0.08 0.55 0.73
0.24 0.21 0.38 0.18 0.18 0.26 0.09 0.0 0.09 0.09 0.0 0.16 0.05 0.14
0.02 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.9 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12
0.01 0.01 0.0 0.04 0.2 0.53 0.27 0.0 0.35 0.06 0.17 0.11 0.14 0.1
0.7 0.29 0.83 0.21 0.65 0.16 0.67 0.5 1.06 0.35 0.56 0.0 0.2 0.2
0.36 0.71 1.2 0.65 0.33 0.47 1.16 0.68 1.25 0.51 1.16 0.33 0.44 0.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.3 0.36 0.0 0.0 0.15 0.6 0.2 1.0 0.27 0.17 0.07 0.0 0.03
0.03 0.02 0.12 0.12 0.29 0.63 0.4 0.31 0.6 0.29 0.0 0.0 0.14 0.12
0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.43 0.05 0.13 0.31 0.11
0.27 0.49 0.31 0.08 0.2 0.21 0.54 0.52 2.14 1.12 0.0 0.03 0.06 0.08
0.34 0.18 0.39 0.0 0.25 0.83 0.42 0.12 0.4 0.28 0.23 0.15 0.08 0.08
HUANGJINYA32741 (NAC058)
 0.02 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.19 0.05 0.19 0.02 0.05 0.0 0.35 0.08
0.13 0.66 0.0 0.0 0.0 0.14 0.29 0.0 0.66 0.03 0.38 0.26 0.0 0.08
0.38 0.3 0.39 0.24 0.48 0.55 0.74 1.34 2.44 0.32 0.44 0.16 0.03 0.03
0.12 0.18 0.16 0.23 0.16 0.35 0.43 0.37 0.54 0.08 0.0 0.0 0.07 0.12
0.07 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0 0.19 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.35 0.2 0.32 0.55 0.65 0.17 0.0 0.68 0.32 0.28 0.11 0.1 0.0
0.14 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.04 0.14 0.0 0.11 0.0
0.04 0.05 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15
1.42 0.47 0.81 0.28 0.33 3.82 1.7 0.42 0.53 1.01 0.64 0.52 0.43 0.19
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.05 0.18 0.08 0.0 0.04 0.15 0.0
0.0 0.07 0.15 0.09 0.0 0.14 0.29 0.0 0.15 0.16 0.13 0.0 0.46 0.27
HUANGJINYA36691 (ORF240B)
 0.01 0.0 0.11 0.0 0.13 0.16 0.0 0.17 0.25 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
0.01 0.0 0.04 0.08 0.0 0.13 0.14 0.0 0.27 0.09 0.0 0.0 0.15 0.08
0.05 0.08 0.3 0.13 0.06 0.12 0.12 0.14 0.66 0.11 0.49 0.0 0.08 0.16
0.09 0.15 0.12 0.0 0.42 0.15 0.32 0.0 0.64 0.04 0.0 0.1 0.1 0.0
0.27 0.75 0.5 0.0 0.66 0.12 0.05 0.33 1.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.3 0.21 0.0 0.52 0.71 0.9 0.3 2.4 0.28 1.21 0.0 0.07 0.38
0.03 0.0 0.0 0.24 0.35 0.0 0.34 1.16 1.71 0.01 0.22 0.0 0.15 0.13
1.97 0.91 1.23 0.58 0.6 0.53 1.5 2.23 1.11 1.9 2.48 1.42 4.53 2.69
0.09 0.0 0.32 0.09 0.0 0.29 0.0 0.0 0.55 0.21 0.12 0.0 0.08 0.42
7.2 15.64 10.54 10.81 11.09 11.68 18.66 14.34 15.9 6.11 10.65 0.31 3.44 4.2
0.44 1.58 1.64 1.61 1.5 1.09 2.29 2.07 2.01 0.69 2.76 0.11 0.0 0.23
0.0 0.0 0.1 0.1 0.42 0.08 0.0 0.0 0.78 0.03 0.0 0.66 0.0 0.17
0.08 0.03 0.0 0.28 0.05 0.12 0.0 0.75 0.71 0.18 0.0 0.0 0.11 0.02
0.55 0.84 0.53 0.14 0.17 0.84 1.52 2.38 3.11 1.13 3.94 0.14 0.39 0.06
0.13 0.09 0.12 0.06 0.32 0.11 0.14 0.08 0.15 0.09 0.02 0.05 0.04 0.11
0.07 0.0 0.0 0.2 0.6 0.0 0.46 0.46 1.22 0.06 0.13 0.0 0.0 0.08
0.42 0.3 0.31 0.24 0.17 0.24 0.13 0.13 0.63 0.21 0.12 0.08 0.29 0.07
HUANGJINYA42309 (ORF240B)
 0.06 0.05 0.34 0.0 0.09 0.0 0.14 0.14 0.27 0.04 0.24 0.0 0.0 0.0
0.27 0.0 0.39 0.2 0.0 0.0 0.17 0.16 0.49 0.24 0.96 0.09 0.39 0.25
0.4 0.23 0.27 0.4 0.63 0.45 0.29 0.0 0.51 0.16 0.77 0.21 0.57 0.51
0.32 0.0 0.07 0.11 0.68 0.45 1.84 0.52 3.21 0.27 0.15 0.0 0.21 0.35
0.51 0.1 0.44 0.4 0.99 1.55 0.25 0.23 0.34 0.13 0.0 0.48 0.24 0.07
0.17 0.2 0.15 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 0.0 0.07 0.2 0.06
0.48 0.0 0.05 0.0 0.0 0.85 0.61 0.78 1.78 0.03 0.12 0.16 0.07 0.0
0.06 0.02 0.06 0.12 0.08 0.06 0.16 0.09 0.28 0.0 0.08 0.03 0.19 0.18
0.08 0.03 0.15 0.05 0.43 0.24 0.28 0.0 0.21 0.0 0.08 0.0 0.13 0.27
0.12 0.1 0.43 0.0 0.0 0.14 0.39 0.47 1.61 0.51 0.0 0.0 0.25 0.15
0.7 1.57 1.6 1.98 2.08 1.51 1.51 1.82 2.77 0.97 1.47 0.62 1.15 0.88
0.28 0.25 0.32 0.31 0.4 0.12 0.49 0.12 0.85 0.2 0.45 0.0 0.14 0.13
1.14 2.9 1.39 1.84 1.31 2.56 5.69 7.48 5.76 0.02 0.0 0.97 1.12 0.26
0.45 0.31 0.88 0.39 0.08 0.12 0.0 0.39 1.0 0.47 0.23 0.58 0.07 0.49
0.08 0.18 0.2 0.05 0.27 0.06 0.1 0.15 0.11 0.15 0.0 0.05 0.11 0.07
0.16 0.24 0.05 0.31 0.18 0.0 0.05 0.05 0.16 0.07 0.17 0.22 0.1 0.16
0.17 0.02 0.07 0.04 0.36 0.19 0.1 0.1 0.17 0.09 0.11 0.0 0.06 0.18
0.18 0.28 0.15 0.14 0.58 0.0 0.0 0.0 0.5 0.31 1.04 0.95 0.21 0.32
0.18 0.05 0.51 0.29 0.1 0.29 0.16 0.0 0.0 0.09 0.54 0.2 0.36 0.0
0.08 0.14 0.53 0.16 0.17 0.35 0.19 0.19 0.21 0.2 0.21 0.51 0.42 0.28
0.24 0.08 0.0 0.09 0.0 0.42 0.0 0.18 0.61 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0
0.12 0.12 0.13 0.17 0.09 0.56 0.51 0.28 0.59 0.12 0.07 0.0 0.64 0.4
0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.64 0.06 0.19 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.12 0.19 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0
0.07 0.05 0.12 0.06 0.27 0.07 0.21 0.08 0.07 0.04 0.14 0.07 0.2 0.2
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.02 0.0 0.06 0.33 0.15
0.33 0.25 0.12 0.51 0.0 0.76 0.51 0.95 0.34 0.8 1.89 0.19 1.09 0.98
0.62 1.0 0.32 0.75 1.17 1.76 1.16 0.89 3.49 0.45 0.29 1.17 0.68 0.87
2.18 1.38 1.1 1.07 1.02 1.29 0.97 1.64 2.94 0.62 0.66 0.19 1.33 1.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)