1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
second leaf,natural sun/80% shade
third leaf,2-year-old,no treatment
third leaf,2-year-old,shade treatment
fourth leaf,10-year-old,no treatment
fourth leaf,10-year-old,shading treatment
two leaves and a bud,blue light 15d
two leaves and a bud,blue/red (1:1) light 15d
two leaves and a bud,red light 15d
two leaves and a bud,white light 15d
second leaf,missing,no treatment
leaf,missing,no treatment
two leaves and a bud,missing,no treatment
tender leaf,red/white (2:3) light 10d
tender leaf,white light 10d
0.29 0.62 0.0 0.0 0.34 0.74 0.46 0.57 1.0 0.0 0.46 0.1 0.08 0.07
0.27 0.28 0.17 0.07 0.15 0.39 0.6 1.0 0.94 0.11 0.0 0.36 0.12 0.08
0.27 0.29 0.1 0.66 0.3 1.0 0.0 0.0 0.96 0.4 0.0 0.0 0.22 0.39
0.02 0.12 0.14 0.0 0.0 0.21 0.16 0.12 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.39 0.0 0.33 0.48 0.77 0.25 1.0 0.11 0.23 0.0 0.0 0.25
0.24 0.0 0.1 0.0 1.0 0.3 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.24 0.48 0.67 0.81 0.41 0.34 1.0 0.68 0.28 0.23 0.0 0.69 0.09
0.11 0.44 1.0 0.46 0.38 0.27 0.95 0.61 0.65 0.44 0.21 0.0 0.33 0.2
0.29 0.16 0.22 0.57 0.0 1.0 0.74 0.86 0.53 0.8 0.8 0.0 0.49 0.35
0.22 0.43 0.28 0.9 0.7 0.0 0.36 0.35 0.71 0.29 1.0 0.0 0.21 0.52
0.13 0.32 0.19 1.0 0.31 0.15 0.8 0.32 0.32 0.2 0.52 0.36 0.84 0.48
0.18 0.0 0.0 0.31 0.0 0.48 1.0 0.0 0.5 0.11 0.0 0.0 0.8 0.24
0.23 0.18 0.23 0.0 0.0 0.96 0.5 0.25 0.25 0.0 0.45 0.67 1.0 0.63
0.39 0.26 0.21 0.45 0.15 0.55 0.43 0.4 1.0 0.21 0.75 0.06 0.48 0.66
0.77 0.17 0.56 1.0 0.58 0.0 0.44 0.0 0.87 0.41 0.39 0.46 0.5 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 1.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.25 0.0 0.05 0.14 0.02 0.13 0.46 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.35 0.36 0.05 0.54 0.29 0.61 0.16 0.56 0.84 0.0 0.42 0.69 1.0
0.19 0.0 0.2 0.0 0.45 0.64 0.0 0.0 0.67 0.55 0.0 0.0 0.77 1.0
0.46 0.0 0.41 0.51 0.94 0.38 0.61 0.2 1.0 0.16 0.38 0.55 0.58 0.3
0.74 0.62 0.86 0.65 0.49 0.71 0.0 0.24 0.95 0.34 1.0 0.61 0.72 0.61
0.22 0.08 0.25 0.0 0.0 0.3 0.45 0.48 1.0 0.18 0.0 0.0 0.1 0.05
0.1 0.07 0.15 0.1 0.0 0.14 0.38 0.53 1.0 0.2 0.22 0.0 0.16 0.35
0.58 0.15 0.19 0.34 0.52 0.83 0.66 0.72 1.0 0.38 0.26 0.17 0.27 0.25
0.2 0.07 0.39 0.1 0.12 0.5 0.45 0.35 1.0 0.14 0.17 0.11 0.28 0.56
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.33 1.0 0.2 0.16 0.21 0.75 0.35
0.14 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 1.0 0.18 0.68 0.59
0.11 0.0 0.42 0.15 0.33 0.0 0.51 0.0 1.0 0.26 0.21 0.0 0.3 0.51
0.26 0.32 0.49 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.36 0.4 0.0 1.0 0.0
0.14 0.15 0.17 0.0 0.08 0.0 0.31 0.41 1.0 0.4 0.0 0.2 0.69 0.26
0.02 0.17 0.14 0.0 0.0 0.1 0.36 0.61 1.0 0.06 0.12 0.0 0.03 0.0
0.47 0.23 1.0 0.64 0.78 0.56 0.39 0.32 0.37 0.45 0.74 0.1 0.32 0.45
0.21 0.62 0.57 0.04 0.27 0.83 0.48 0.74 1.0 0.54 0.52 0.0 0.08 0.23
0.18 0.49 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.22 0.0 0.0 0.59 0.5
0.21 0.0 0.22 0.0 0.17 0.65 0.0 0.12 1.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
0.04 0.28 0.0 0.24 1.0 0.0 0.0 0.38 0.75 0.07 0.7 0.78 0.21 0.0
0.17 0.11 0.22 0.22 0.08 0.38 0.43 0.67 0.99 0.42 0.11 0.06 1.0 0.24
0.63 0.63 0.66 0.44 0.23 0.72 0.59 0.52 0.72 1.0 0.4 0.05 0.46 0.35
0.43 0.39 0.36 0.18 0.51 1.0 0.52 0.3 0.76 0.28 0.3 0.0 0.12 0.12
0.38 0.12 0.6 0.3 0.31 1.0 0.47 0.24 0.27 0.61 0.52 0.28 0.5 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.31
0.15 0.3 0.53 0.38 0.22 0.53 1.0 0.16 0.76 0.3 0.32 0.0 0.16 0.07
0.12 0.06 0.16 0.03 0.02 0.29 0.05 0.07 1.0 0.11 0.07 0.01 0.01 0.03
0.25 0.0 0.36 0.0 0.0 0.58 0.31 0.15 0.15 0.38 0.0 0.0 0.0 1.0
0.26 0.17 0.11 0.22 0.0 0.0 0.68 0.67 1.0 0.07 0.32 0.45 0.38 0.47
0.11 0.0 0.19 0.0 0.22 0.36 0.33 0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.19 0.19
0.14 0.0 1.0 0.0 0.57 0.0 0.89 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0
0.11 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.5
0.46 0.35 0.21 0.26 0.27 0.64 0.36 0.0 0.0 0.22 1.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.68 0.08 0.27 1.0 0.13 0.21
0.21 0.12 0.32 0.29 0.24 0.09 0.65 0.55 1.0 0.6 0.0 0.28 0.28 0.28
0.17 0.21 0.28 0.22 0.38 0.23 0.35 0.24 1.0 0.07 0.38 0.32 0.13 0.07
0.77 0.46 0.98 0.39 0.79 0.0 0.95 0.39 0.77 0.76 0.63 0.13 1.0 0.97
0.11 0.13 0.17 0.04 0.0 0.14 0.07 0.12 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.3 0.46 0.34 0.23 0.53 1.0 0.15 0.3 0.37 0.11 0.12 0.49 0.18 0.11
0.07 0.12 0.17 0.0 0.26 0.74 0.55 0.3 1.0 0.23 0.0 0.0 0.45 0.0
0.22 0.05 0.21 0.28 1.0 0.14 0.4 0.37 0.78 0.53 0.54 0.31 1.0 0.5
0.16 0.22 0.43 0.04 0.06 0.04 0.78 0.36 1.0 0.14 0.0 0.0 0.02 0.0
0.34 0.42 0.49 0.11 0.29 0.86 0.6 0.19 1.0 0.33 0.08 0.0 0.36 0.33
0.15 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.82 0.09 0.8 0.3 0.0 0.11 0.75 1.0
0.62 0.56 1.0 0.47 0.46 0.68 0.25 0.0 0.23 0.23 0.0 0.41 0.13 0.37
0.02 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.13
0.02 0.03 0.0 0.08 0.38 1.0 0.51 0.0 0.66 0.11 0.33 0.21 0.26 0.18
0.66 0.27 0.78 0.2 0.61 0.15 0.63 0.47 1.0 0.33 0.53 0.0 0.19 0.19
0.29 0.57 0.96 0.52 0.27 0.38 0.93 0.55 1.0 0.41 0.93 0.26 0.35 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.3 0.36 0.0 0.0 0.15 0.6 0.2 1.0 0.27 0.17 0.07 0.0 0.03
0.04 0.03 0.19 0.2 0.47 1.0 0.63 0.49 0.95 0.46 0.0 0.0 0.23 0.18
0.15 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 1.0 0.13 0.3 0.72 0.26
0.13 0.23 0.15 0.04 0.09 0.1 0.25 0.24 1.0 0.52 0.0 0.01 0.03 0.04
0.41 0.22 0.47 0.0 0.31 1.0 0.5 0.15 0.48 0.34 0.28 0.18 0.1 0.1
HUANGJINYA32741 (NAC058)
 0.07 0.0 0.19 0.0 0.27 0.0 0.54 0.13 0.54 0.06 0.15 0.0 1.0 0.24
0.2 0.99 0.0 0.0 0.0 0.21 0.44 0.0 1.0 0.05 0.57 0.39 0.0 0.12
0.16 0.12 0.16 0.1 0.2 0.23 0.3 0.55 1.0 0.13 0.18 0.07 0.01 0.01
0.23 0.33 0.31 0.42 0.3 0.65 0.8 0.68 1.0 0.14 0.0 0.0 0.13 0.23
0.14 0.0 0.33 0.09 0.0 0.0 0.41 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.52 0.29 0.47 0.82 0.96 0.25 0.0 1.0 0.47 0.41 0.17 0.15 0.0
0.39 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.4 0.0 0.3 0.0
0.3 0.32 0.0 0.61 0.65 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.56 1.0
0.37 0.12 0.21 0.07 0.09 1.0 0.44 0.11 0.14 0.26 0.17 0.14 0.11 0.05
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.58 0.3 1.0 0.47 0.0 0.2 0.82 0.0
0.0 0.14 0.33 0.19 0.0 0.3 0.63 0.0 0.32 0.35 0.28 0.0 1.0 0.58
HUANGJINYA36691 (ORF240B)
 0.02 0.0 0.44 0.0 0.51 0.66 0.0 0.68 1.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0
0.05 0.0 0.13 0.31 0.0 0.48 0.5 0.0 1.0 0.32 0.0 0.0 0.56 0.28
0.07 0.12 0.46 0.19 0.09 0.18 0.18 0.21 1.0 0.17 0.75 0.0 0.12 0.24
0.14 0.23 0.19 0.0 0.65 0.24 0.5 0.0 1.0 0.05 0.0 0.16 0.15 0.0
0.27 0.74 0.5 0.0 0.66 0.12 0.05 0.33 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.12 0.09 0.0 0.22 0.3 0.38 0.12 1.0 0.12 0.5 0.0 0.03 0.16
0.02 0.0 0.0 0.14 0.2 0.0 0.2 0.68 1.0 0.0 0.13 0.0 0.09 0.08
0.43 0.2 0.27 0.13 0.13 0.12 0.33 0.49 0.24 0.42 0.55 0.31 1.0 0.59
0.17 0.0 0.58 0.16 0.0 0.52 0.0 0.0 1.0 0.38 0.22 0.0 0.15 0.75
0.39 0.84 0.56 0.58 0.59 0.63 1.0 0.77 0.85 0.33 0.57 0.02 0.18 0.22
0.16 0.57 0.59 0.58 0.54 0.39 0.83 0.75 0.73 0.25 1.0 0.04 0.0 0.08
0.0 0.0 0.13 0.13 0.53 0.1 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.84 0.0 0.21
0.1 0.04 0.0 0.37 0.07 0.16 0.0 1.0 0.95 0.24 0.0 0.0 0.14 0.03
0.14 0.21 0.13 0.04 0.04 0.21 0.39 0.6 0.79 0.29 1.0 0.04 0.1 0.01
0.39 0.29 0.38 0.2 1.0 0.34 0.42 0.24 0.48 0.29 0.07 0.15 0.13 0.34
0.06 0.0 0.0 0.17 0.49 0.0 0.38 0.38 1.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.06
0.66 0.48 0.49 0.38 0.27 0.38 0.2 0.2 1.0 0.33 0.18 0.12 0.46 0.11
HUANGJINYA42309 (ORF240B)
 0.17 0.13 1.0 0.0 0.26 0.0 0.4 0.39 0.79 0.12 0.7 0.0 0.0 0.0
0.28 0.0 0.41 0.21 0.0 0.0 0.18 0.17 0.52 0.26 1.0 0.1 0.4 0.27
0.52 0.29 0.36 0.52 0.83 0.58 0.38 0.0 0.67 0.21 1.0 0.27 0.74 0.66
0.1 0.0 0.02 0.04 0.21 0.14 0.57 0.16 1.0 0.08 0.05 0.0 0.06 0.11
0.33 0.07 0.28 0.26 0.64 1.0 0.16 0.15 0.22 0.08 0.0 0.31 0.15 0.05
0.82 0.99 0.74 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.58 0.0 0.35 1.0 0.29
0.27 0.0 0.03 0.0 0.0 0.48 0.34 0.44 1.0 0.01 0.07 0.09 0.04 0.0
0.21 0.09 0.21 0.42 0.3 0.22 0.58 0.33 1.0 0.0 0.3 0.1 0.67 0.64
0.19 0.07 0.34 0.11 1.0 0.55 0.63 0.0 0.47 0.0 0.17 0.0 0.29 0.63
0.07 0.06 0.26 0.0 0.0 0.09 0.24 0.29 1.0 0.32 0.0 0.0 0.15 0.09
0.25 0.57 0.58 0.71 0.75 0.54 0.54 0.66 1.0 0.35 0.53 0.23 0.41 0.32
0.33 0.3 0.38 0.36 0.48 0.14 0.58 0.14 1.0 0.24 0.53 0.0 0.16 0.15
0.15 0.39 0.19 0.25 0.18 0.34 0.76 1.0 0.77 0.0 0.0 0.13 0.15 0.03
0.45 0.31 0.88 0.39 0.08 0.12 0.0 0.39 1.0 0.47 0.22 0.58 0.07 0.49
0.28 0.65 0.73 0.18 1.0 0.21 0.39 0.56 0.4 0.57 0.0 0.19 0.42 0.27
0.52 0.77 0.16 1.0 0.57 0.0 0.17 0.17 0.51 0.22 0.56 0.71 0.33 0.52
0.48 0.06 0.19 0.12 1.0 0.54 0.28 0.28 0.47 0.24 0.32 0.0 0.17 0.5
0.18 0.27 0.14 0.13 0.56 0.0 0.0 0.0 0.48 0.3 1.0 0.91 0.2 0.31
0.33 0.09 0.95 0.53 0.19 0.54 0.29 0.0 0.0 0.17 1.0 0.37 0.67 0.0
0.16 0.26 1.0 0.31 0.33 0.67 0.36 0.35 0.39 0.37 0.4 0.97 0.8 0.53
0.39 0.12 0.0 0.14 0.0 0.68 0.0 0.3 1.0 0.09 0.0 0.09 0.0 0.0
0.19 0.19 0.21 0.27 0.13 0.86 0.8 0.44 0.91 0.18 0.11 0.0 1.0 0.62
0.06 0.0 0.12 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 1.0 0.1 0.29 0.0 0.0 0.0
0.12 0.12 0.0 0.0 0.0 0.31 0.5 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.24 0.21 0.45 0.24 1.0 0.27 0.78 0.29 0.25 0.17 0.54 0.26 0.73 0.75
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.3 0.0 0.07 0.0 0.19 1.0 0.46
0.17 0.13 0.07 0.27 0.0 0.4 0.27 0.5 0.18 0.43 1.0 0.1 0.58 0.52
0.18 0.29 0.09 0.21 0.33 0.5 0.33 0.26 1.0 0.13 0.08 0.34 0.19 0.25
0.74 0.47 0.38 0.36 0.35 0.44 0.33 0.56 1.0 0.21 0.22 0.06 0.45 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)