1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_262 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
flower bud,missing,no treatment
flower,missing,no treatment
root,missing,no treatment
seed,missing,no treatment
seedling,missing,no treatment
stem,missing,no treatment
tender shoot,missing,no treatment
young leaf,missing,no treatment
leaf,1-year-old,nitrogen deficiency
leaf,1-year-old,nitrate treatment
leaf,1-year-old,ammonia treatment
leaf,1-year-old,nitric oxide treatment
bud,missing,missing
second leaf,missing,no treatment
shoot,3-year-old,moderate drought
shoot,3-year-old,mild drought
shoot,3-year-old,sever drought
shoot,3-year-old,optimum water content
root,missing,missing
flower,missing,missing
leaf,missing,missing
leaf,5-year-old,missing
two leaves and a bud,missing,missing
leaf,10-year-old,missing
CSA000212.1 (CSA000212)
 83.49 11.29 4.5 18.23 6.51 10.22 40.15 47.46 21.31 19.46 21.86 20.53 16.75 21.56 50.28 36.48 49.76 38.55 6.66 5.22 35.77 29.98 36.97 24.2
CSA000213.1 (CSA000213)
 18.98 5.82 1.27 8.01 4.52 5.39 15.89 18.76 11.83 11.04 12.45 12.84 8.89 14.58 28.05 21.61 24.99 19.65 2.43 3.42 19.11 16.52 19.37 11.47
CSA000540.1 (CSA000540)
 4.89 0.96 0.0 1.86 2.87 1.9 0.73 3.15 1.0 1.4 0.76 0.36 0.84 1.03 2.55 2.77 2.84 2.81 1.25 0.08 0.8 1.11 1.92 1.81
CSA000846.1 (CSA000846)
 25.65 5.4 8.33 6.83 5.52 8.31 12.83 18.76 9.5 9.11 8.77 8.55 11.41 8.34 11.96 12.38 11.95 12.36 6.53 5.68 6.12 6.42 13.25 7.79
CSA001474.1 (CSA001474)
 0.58 0.09 0.09 0.0 0.18 0.09 0.21 0.29 0.1 0.13 0.19 0.21 0.46 0.19 0.48 0.31 0.53 0.33 0.11 0.36 0.31 0.35 0.96 0.25
CSA003577.1 (CSA003577)
 1.39 3.55 0.0 0.0 0.0 0.0 5.8 8.3 0.96 0.36 0.18 0.0 5.15 1.15 5.84 6.14 6.4 5.26 0.29 0.27 1.75 0.83 10.36 4.64
CSA003687.1 (CSA003687)
 24.62 6.76 3.83 13.66 2.86 7.75 7.5 24.05 13.38 9.53 8.67 6.36 6.44 8.76 14.7 13.93 12.4 13.81 4.07 12.37 10.39 6.93 18.68 7.13
CSA004263.1 (CSA004263)
 30.52 18.76 4.26 1.83 3.96 4.57 12.27 11.64 15.77 18.38 13.91 16.58 15.46 13.14 31.81 31.28 31.29 28.5 5.56 8.11 22.43 22.4 20.57 20.21
CSA004354.1 (CSA004354)
 11.05 5.65 4.16 2.78 2.11 2.22 7.76 6.89 3.18 3.66 3.07 2.94 6.37 2.94 5.44 5.0 5.55 5.0 0.86 1.96 3.77 3.66 8.25 3.14
CSA005139.1 (CSA005139)
 0.82 0.2 0.0 0.62 0.42 0.4 0.62 1.89 0.49 0.81 0.28 0.4 1.47 0.33 0.82 1.03 0.86 0.62 0.1 0.42 0.58 0.23 1.54 0.24
CSA005535.1 (CSA005535)
 0.66 0.33 0.42 0.1 0.0 0.1 0.26 0.48 0.0 0.29 0.0 0.04 0.91 0.13 0.22 0.36 0.46 0.52 0.0 0.14 0.21 0.19 1.07 0.18
CSA005757.1 (IDD4)
 19.39 6.47 2.41 9.44 1.6 4.28 22.27 53.57 16.23 13.77 15.42 14.28 7.04 19.27 26.73 24.79 22.73 24.81 0.72 2.2 17.76 18.37 22.14 11.79
CSA006023.1 (DDB2)
 12.84 2.92 13.45 2.24 9.14 13.42 12.27 11.62 9.45 10.44 9.65 9.93 7.25 8.99 15.36 15.64 14.56 15.16 5.77 3.37 13.31 10.77 21.02 15.09
CSA006410.1 (CSA006410)
 1.87 0.34 1.31 0.67 0.6 0.68 0.78 1.1 0.83 0.8 0.63 0.77 1.44 0.56 0.91 0.78 0.83 0.98 0.31 0.18 0.52 0.79 1.72 0.6
CSA006436.1 (CSA006436)
 15.03 2.33 7.83 1.03 7.32 5.64 3.93 15.19 5.44 4.68 6.24 4.29 2.96 5.11 7.51 7.44 7.39 7.03 2.86 2.03 5.24 5.49 7.62 5.18
CSA007974.1 (CSA007974)
 2.79 9.13 0.0 0.0 0.0 0.0 3.31 2.77 0.0 0.0 0.41 0.0 8.88 1.68 3.29 3.14 4.82 3.17 0.0 1.02 0.0 0.77 8.83 1.98
CSA008696.1 (PAP10)
 35.33 9.85 2.9 2.32 4.41 5.46 10.53 14.94 12.47 12.28 12.39 10.08 8.05 13.76 16.89 16.4 16.13 16.58 2.12 1.83 11.87 22.41 20.22 15.57
CSA008900.1 (SCO2)
 9.7 10.81 1.94 1.28 2.07 2.29 5.15 5.46 4.84 3.57 3.87 3.83 5.47 6.17 8.82 9.32 9.12 8.78 1.57 1.66 7.67 9.77 10.04 8.15
CSA009527.1 (CSA009527)
 4.73 1.3 1.27 0.74 2.89 0.61 1.21 3.8 1.19 1.54 1.59 0.66 2.61 1.01 3.03 2.63 3.1 3.14 1.82 0.94 1.77 0.78 3.25 2.46
CSA010095.1 (CSA010095)
 1.42 0.85 0.27 0.26 0.41 0.45 1.69 1.61 0.46 0.41 0.52 0.47 1.06 0.41 0.76 0.63 0.63 0.67 0.19 0.28 0.45 0.39 1.06 0.39
CSA010227.1 (CSA010227)
 1.61 0.06 0.34 0.32 0.21 0.16 0.25 1.27 0.45 0.2 0.47 0.33 0.46 0.13 0.47 0.39 0.63 0.47 0.09 0.16 0.4 0.21 0.69 0.33
CSA011601.1 (CSA011601)
 38.9 7.93 32.81 5.88 29.39 37.21 21.44 52.1 23.41 24.15 20.89 25.49 16.69 18.62 30.42 34.04 28.24 36.97 10.76 13.23 24.87 22.36 33.02 27.3
CSA011892.1 (CSA011892)
 1.85 1.46 1.2 1.13 0.0 0.76 1.33 3.17 1.05 0.95 1.03 0.63 4.85 1.27 3.13 2.54 3.26 2.65 0.62 1.22 1.77 0.8 5.86 2.63
CSA012290.1 (CSA012290)
 17.8 12.68 24.69 10.69 24.41 23.04 26.22 31.64 22.42 22.14 20.67 21.48 9.62 11.3 28.07 30.14 27.05 29.4 15.78 13.01 21.64 16.94 23.07 23.95
CSA013058.1 (XI-I)
 18.83 7.58 8.02 7.18 11.07 9.52 22.73 19.45 10.5 9.94 9.64 7.52 19.94 8.46 14.17 15.27 14.86 15.08 5.59 10.27 10.57 9.22 19.16 12.29
CSA014021.1 (AFB2)
 70.41 12.4 58.86 12.25 53.23 35.02 18.55 62.52 24.66 23.02 24.22 21.68 22.66 30.39 32.17 31.4 30.08 33.95 17.59 18.25 23.38 30.12 50.45 27.7
CSA014249.1 (WAV2)
 32.24 18.29 17.03 17.05 16.6 20.87 30.19 43.13 19.01 18.7 17.16 16.46 18.45 18.06 27.86 31.42 28.0 31.37 13.77 16.5 23.23 20.64 30.8 28.12
CSA015098.1 (CSA015098)
 8.72 1.28 2.39 4.99 2.03 2.29 2.72 7.73 2.66 3.28 2.81 2.15 2.43 2.73 3.7 4.29 3.94 3.68 1.38 0.69 2.26 2.08 3.81 3.04
CSA015219.1 (CSA015219)
 19.02 6.81 10.51 4.68 8.52 8.19 6.39 20.08 9.11 9.33 9.0 7.05 7.86 10.74 10.82 11.21 11.13 11.12 9.28 9.09 10.38 8.56 10.2 9.36
CSA015999.1 (CSA015999)
 2.47 1.37 2.65 0.79 2.58 2.43 2.81 1.97 1.87 1.46 1.46 1.29 2.46 1.98 2.88 3.26 2.69 2.6 1.27 2.2 2.86 1.91 4.63 2.34
CSA016714.1 (CSA016714)
 2.37 0.42 1.07 0.1 0.12 0.71 0.59 2.44 0.37 0.3 1.08 0.33 0.98 0.39 0.5 0.73 0.83 0.56 0.26 0.22 0.37 0.45 0.97 0.43
CSA017278.1 (SDD1)
 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.06 0.06 0.04 0.01 0.0 0.02 0.02 0.1 0.03
CSA017424.1 (TAF11)
 14.7 7.72 8.31 5.64 10.17 6.56 10.69 24.17 12.44 9.97 12.66 12.66 10.88 10.56 16.06 16.28 15.18 15.58 4.88 10.51 9.12 11.83 13.28 13.47
CSA017582.1 (CSA017582)
 2.28 0.0 0.14 0.0 0.0 0.06 0.3 0.73 0.36 0.35 0.12 0.15 0.71 0.44 1.0 0.76 0.83 0.72 0.01 0.06 0.14 0.23 0.86 0.44
CSA018380.1 (CSA018380)
 0.66 0.78 0.61 0.5 0.72 0.69 2.19 2.9 0.33 0.63 0.31 0.54 1.34 0.83 2.1 1.84 2.32 1.8 0.73 0.34 0.97 0.64 2.62 1.05
CSA019840.1 (CSA019840)
 18.09 11.37 4.49 6.9 3.51 4.78 10.83 15.44 5.07 5.94 5.25 4.82 14.39 9.16 12.48 10.18 14.54 13.95 3.03 5.79 6.35 6.49 26.27 7.94
CSA019957.1 (CSA019957)
 20.37 6.39 5.7 5.9 4.84 7.42 7.44 13.34 7.73 6.85 7.87 6.39 14.17 8.13 9.96 10.25 10.43 9.39 4.09 5.16 4.75 7.12 10.78 4.86
CSA020356.1 (CSA020356)
 1.42 0.43 0.21 0.07 0.07 0.2 0.82 1.19 0.45 0.37 0.2 0.19 1.22 0.26 0.56 0.92 0.85 0.73 0.05 0.17 0.26 0.49 1.18 0.43
CSA020545.1 (CSA020545)
 1.88 0.35 0.62 0.12 0.17 0.12 1.2 0.93 0.25 0.48 0.39 0.15 0.37 0.28 0.43 0.47 0.45 0.5 0.02 0.14 0.46 0.16 1.0 0.21
CSA021337.1 (CSA021337)
 47.37 10.16 25.01 23.21 17.87 20.35 22.36 43.47 15.87 15.59 15.77 11.98 18.38 14.07 19.5 17.63 18.87 19.01 14.53 13.31 15.09 14.75 24.81 14.97
CSA021699.1 (CSA021699)
 13.68 1.83 1.54 7.48 1.57 5.86 3.54 10.39 2.14 2.9 3.39 1.61 7.52 4.18 8.02 5.97 8.47 6.16 1.5 6.75 3.89 3.75 10.08 7.81
CSA021810.1 (CSA021810)
 10.53 0.53 1.82 0.02 1.24 2.7 2.01 7.12 2.21 3.25 2.52 1.86 2.53 2.37 5.01 5.78 4.78 5.93 0.34 0.19 3.45 2.91 5.41 5.97
CSA021991.1 (CSA021991)
 3.28 0.42 0.0 0.0 0.55 0.0 2.31 7.18 1.29 2.03 0.33 1.54 3.1 0.87 0.75 1.89 1.09 2.36 0.31 1.49 0.85 0.23 4.14 0.44
203.5 80.36 20.95 8.94 13.17 25.99 61.91 101.35 61.39 80.35 68.91 74.09 64.31 64.52 123.45 109.14 114.85 118.39 8.05 47.51 81.83 78.09 95.13 97.81
CSA022885.1 (CDC2)
 1.37 0.26 0.55 0.36 0.47 0.32 0.65 1.73 0.44 0.57 0.54 0.42 0.99 0.47 1.17 1.19 1.29 1.24 0.23 0.72 0.52 0.45 1.59 0.72
CSA023193.1 (CSA023193)
 9.23 4.78 2.23 2.52 3.41 1.65 9.6 10.09 3.27 3.82 2.9 3.28 5.53 4.23 6.04 6.5 6.12 6.28 1.95 2.68 4.19 4.86 10.32 3.37
CSA025047.1 (CSA025047)
 14.2 6.75 5.93 3.46 8.93 6.79 6.82 18.49 5.44 5.89 6.62 3.66 7.13 5.3 10.3 9.9 9.51 9.85 2.88 4.05 6.41 7.07 10.7 8.24
CSA025255.1 (CSA025255)
 18.26 0.0 1.59 0.0 0.0 0.0 1.04 16.5 3.23 0.0 0.0 0.0 2.88 0.0 6.71 7.69 7.81 6.62 0.0 0.31 3.46 1.5 8.79 3.2
CSA025564.1 (VPS33)
 22.26 3.5 16.16 12.44 15.74 14.08 10.38 29.76 14.95 15.97 15.05 17.76 13.33 17.64 22.0 22.73 21.8 23.3 6.73 7.0 25.84 19.86 26.13 18.52
CSA025652.1 (CRK8)
 3.22 1.14 1.1 0.84 1.0 0.66 1.2 5.1 1.31 1.58 1.09 1.27 2.6 1.42 2.69 3.09 2.64 2.89 0.31 1.23 1.4 1.47 3.96 1.29
CSA025868.1 (CSA025868)
 13.1 9.32 8.4 11.78 11.24 9.3 16.51 23.0 9.57 11.09 7.41 8.03 16.97 8.37 17.33 19.63 17.46 17.12 4.8 3.46 11.76 9.67 19.76 14.8
CSA026251.1 (ORF240B)
 1.71 0.79 1.84 0.0 0.0 0.77 1.26 1.67 2.06 0.81 0.0 0.0 1.33 0.43 2.09 2.37 2.35 2.07 0.07 1.2 1.8 0.89 4.91 0.58
CSA026381.1 (CRK8)
 4.3 1.99 0.5 0.89 0.5 0.61 2.27 3.63 0.46 0.67 0.28 0.21 2.61 1.06 1.61 2.04 1.76 2.06 0.41 1.34 2.34 1.22 3.56 0.59
CSA026521.1 (CDC48C)
 2.79 0.49 0.82 0.76 0.99 0.74 1.53 2.54 1.27 1.31 1.57 1.06 1.99 1.14 1.75 1.82 1.74 1.38 0.96 0.76 1.52 0.99 2.71 0.78
CSA026708.1 (CSA026708)
 72.18 26.33 0.81 2.28 3.35 6.96 21.67 50.69 21.79 29.38 19.29 16.53 32.56 28.06 37.52 35.05 37.7 33.77 1.75 17.17 34.81 42.95 20.54 27.84
CSA027001.1 (CSA027001)
 11.73 6.51 11.58 6.01 7.43 8.96 15.61 22.63 11.87 12.61 13.22 13.03 11.32 11.15 17.21 20.23 15.15 17.5 3.76 3.85 16.41 14.08 18.96 15.53
CSA027405.1 (ABIL1)
 40.83 11.45 26.06 11.03 12.55 11.62 15.27 41.79 14.18 13.81 15.49 12.93 12.52 20.59 27.51 29.39 26.71 26.56 14.6 15.21 14.46 15.95 21.43 19.48
CSA027926.1 (CRK8)
 8.32 6.5 3.12 3.69 4.67 2.2 8.73 11.56 4.33 6.36 2.89 2.18 10.78 3.76 6.58 6.39 6.44 5.25 1.02 3.82 4.45 3.76 10.33 2.41
CSA028439.1 (CSA028439)
 40.01 2.43 0.0 0.0 9.78 14.86 5.57 40.34 4.63 7.84 2.69 6.48 8.19 2.16 19.28 19.42 21.32 19.35 2.89 0.5 6.46 6.76 21.19 12.52
CSA028572.1 (MGT4)
 16.32 6.28 1.29 0.95 1.48 2.68 2.07 6.16 5.66 5.4 5.76 8.03 4.74 5.07 9.11 9.59 9.59 9.43 0.44 4.01 3.59 5.21 5.85 5.2
CSA028908.1 (AFB5)
 30.09 7.45 24.13 8.35 24.17 34.9 14.5 30.85 16.35 17.25 14.53 14.16 13.31 16.9 18.99 19.61 17.92 21.19 6.88 10.27 13.22 15.23 21.25 16.32
CSA029309.1 (CSA029309)
 2.53 1.27 1.16 0.35 0.61 0.2 1.24 3.59 1.31 1.26 1.02 0.58 2.63 1.04 2.46 2.82 2.34 2.31 0.5 1.17 1.43 1.74 3.96 1.3
CSA029637.1 (CSA029637)
 1.32 0.47 0.56 0.18 0.55 0.45 0.88 2.84 0.38 0.46 0.3 0.53 1.17 0.42 0.73 0.64 0.84 0.6 0.18 0.7 0.37 0.78 1.75 0.49
CSA029915.1 (SQE3)
 17.84 13.89 9.5 4.93 5.17 6.17 27.34 16.95 10.66 15.48 9.46 5.03 8.97 10.08 13.26 13.52 13.31 12.94 5.12 14.47 10.08 7.96 19.95 8.68
CSA030102.1 (CSA030102)
 5.53 4.15 1.43 3.44 2.71 2.48 0.42 7.79 0.97 1.82 1.13 0.15 1.16 1.12 2.44 2.29 2.25 2.28 0.97 1.94 0.96 1.21 1.99 1.37
CSA030156.1 (CSA030156)
 9.16 0.39 0.3 0.28 0.0 1.71 3.93 2.09 2.55 3.87 1.29 3.32 0.25 1.29 8.44 3.91 7.65 4.24 0.23 0.46 4.83 3.9 6.22 2.39
CSA030216.1 (CSA030216)
 1.36 0.09 0.07 0.13 0.0 0.19 0.91 0.83 0.34 0.15 0.11 0.11 0.24 0.33 0.37 0.28 0.38 0.44 0.02 0.5 0.19 0.22 0.76 0.22
CSA030255.1 (emb1381)
 10.8 3.88 5.08 3.36 4.99 5.13 6.68 9.41 5.95 5.33 5.16 7.69 4.94 5.19 8.43 9.29 8.49 9.79 3.54 1.95 7.7 5.62 9.72 8.28
CSA031205.1 (CSA031205)
 4.31 1.76 0.46 0.11 0.58 0.22 2.4 6.58 0.6 0.46 0.58 0.34 2.68 0.95 1.8 1.39 1.57 1.59 0.1 1.28 0.51 0.77 5.59 0.58
CSA031207.1 (CSA031207)
 11.04 6.0 0.36 0.34 0.74 0.52 3.84 9.59 0.45 1.3 1.05 0.52 4.17 1.61 4.06 3.7 3.39 4.1 0.17 1.97 1.07 1.12 10.86 1.65
CSA033295.1 (SDH5)
 13.66 2.46 2.08 0.96 6.18 7.35 2.05 11.51 1.5 3.26 2.38 0.17 2.55 2.38 4.93 4.07 4.87 5.6 0.55 1.43 3.12 3.43 5.75 2.84
CSA033408.1 (CSA033408)
 1.03 0.61 1.36 0.21 0.42 0.5 0.66 1.26 0.22 0.22 0.11 0.05 1.05 0.71 1.4 1.4 1.24 1.17 0.11 0.18 0.09 0.96 2.07 0.63
CSA034735.1 (CVL1)
 5.37 0.23 2.61 0.52 2.74 3.06 2.57 8.63 3.44 4.39 3.1 3.3 2.88 3.15 4.27 5.14 4.2 5.09 0.16 1.0 1.73 2.83 5.12 3.75
CSA035550.1 (CSA035550)
 1.58 0.45 1.79 0.64 1.61 1.36 1.41 0.97 1.02 1.69 0.87 1.55 1.33 1.04 1.97 2.02 1.95 2.24 0.85 0.68 2.07 1.47 3.11 1.31
CSA035909.1 (ARF16)
 5.96 1.24 2.59 1.93 1.5 2.31 7.18 6.33 3.13 2.68 3.0 2.89 0.68 3.92 5.06 5.32 5.05 5.21 0.82 2.02 4.34 3.45 5.53 2.98

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)