Heatmap: Cluster_354 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
flower bud,missing,no treatment
flower,missing,no treatment
root,missing,no treatment
seed,missing,no treatment
seedling,missing,no treatment
stem,missing,no treatment
tender shoot,missing,no treatment
young leaf,missing,no treatment
leaf,1-year-old,nitrogen deficiency
leaf,1-year-old,nitrate treatment
leaf,1-year-old,ammonia treatment
leaf,1-year-old,nitric oxide treatment
bud,missing,missing
second leaf,missing,no treatment
shoot,3-year-old,moderate drought
shoot,3-year-old,mild drought
shoot,3-year-old,sever drought
shoot,3-year-old,optimum water content
root,missing,missing
flower,missing,missing
leaf,missing,missing
leaf,5-year-old,missing
two leaves and a bud,missing,missing
leaf,10-year-old,missing
CSA000025.1 (DNMT2)
0.51 -2.66 -0.58 -0.1 -0.35 -0.35 -0.82 0.89 0.28 0.03 0.41 0.01 -0.6 -0.36 0.37 0.42 0.47 0.44 -0.39 -3.01 0.3 -0.17 0.44 0.09
CSA001844.1 (CNBT1)
0.17 -1.74 -0.05 0.02 0.1 0.04 -0.58 -0.88 0.26 0.16 0.27 0.02 -0.19 -0.35 0.59 0.49 0.45 0.23 -0.84 0.17 -0.2 -0.02 0.01 0.14
CSA001928.1 (PFT1)
0.77 -0.56 0.42 0.01 -0.29 -0.07 0.27 0.2 0.7 0.72 0.39 0.74 -0.05 -0.52 -0.41 -0.22 -0.22 -0.11 -0.99 -1.75 0.42 -1.06 -1.01 -0.5
CSA002130.1 (CSA002130)
-1.31 -1.98 0.31 0.91 -0.41 0.23 -1.28 -1.86 0.04 0.05 0.17 -0.41 -0.76 -0.44 0.87 1.07 1.01 1.15 -0.37 -2.5 -0.6 -0.47 -1.01 0.45
CSA003771.1 (CSA003771)
0.35 -1.28 -2.55 0.99 -1.6 0.21 -0.39 -0.65 0.09 0.9 -0.84 -0.4 0.25 -0.81 0.57 0.53 0.82 0.91 -3.15 -0.81 0.53 -0.45 0.14 -0.43
CSA003846.1 (CSA003846)
0.87 -0.95 -0.68 1.8 -0.71 0.56 0.52 0.3 -0.13 0.44 -0.07 -0.4 -0.77 -0.32 -0.18 -0.29 -0.31 -0.47 -2.01 -0.55 0.39 -0.49 -0.47 -0.93
CSA003847.1 (CSA003847)
0.6 -2.3 -0.69 1.52 -0.85 0.28 0.02 -0.18 0.02 0.45 -0.34 -0.28 -0.06 -0.94 0.47 0.41 0.48 0.22 -2.81 -0.69 0.33 -0.43 -0.18 -0.44
CSA004307.1 (CSA004307)
-0.74 -1.37 0.86 - -0.08 1.08 -0.95 -1.09 0.89 0.99 1.14 0.55 -0.21 -0.74 -0.3 0.3 -0.08 0.01 -3.71 -0.64 0.75 -2.72 -1.28 0.28
CSA004626.1 (CSA004626)
-0.08 -1.95 -0.4 -0.0 -1.66 -0.81 -1.22 -0.37 0.15 -0.52 -0.03 -0.03 -0.14 0.18 0.6 0.72 0.67 0.75 -1.37 -0.06 0.28 0.11 0.33 0.84
CSA005364.1 (ARD4)
-4.31 -3.36 -3.07 -6.92 -2.81 -2.43 -1.94 -2.69 1.84 1.5 0.9 1.79 -3.21 -1.13 0.69 0.47 0.64 0.39 -3.82 -1.2 1.21 0.12 -1.8 -0.7
CSA005596.1 (CSA005596)
-0.79 -2.19 -0.39 0.65 -0.57 -0.38 -0.78 -0.36 0.81 1.01 1.08 0.23 -1.32 -0.95 0.24 0.14 0.14 0.16 -2.29 -0.12 0.87 -0.32 0.33 -0.77
CSA007180.1 (CSA007180)
-1.09 -0.12 0.04 -0.21 -0.04 0.26 -0.55 -0.98 0.24 0.18 0.15 0.76 0.14 -0.6 0.46 0.47 0.44 0.32 -0.99 -1.85 0.58 -0.27 -0.41 0.32
CSA007756.1 (CSA007756)
-0.41 -0.28 -1.56 - -3.07 -1.64 0.99 -1.42 0.74 1.15 0.44 1.61 -1.88 -2.92 -0.22 -0.47 -0.02 -0.12 -4.01 -2.22 1.89 -1.83 1.15 -0.73
CSA008475.1 (CSA008475)
-0.6 -1.67 -0.11 0.97 -0.11 0.5 -0.53 -1.11 0.4 0.12 0.3 0.46 -1.01 -0.57 0.37 0.47 0.42 0.52 -0.94 -0.69 0.28 -0.54 -0.26 0.17
CSA008704.1 (CSA008704)
- - - 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.42 - - -
CSA009036.1 (CSA009036)
-0.48 -0.28 -0.03 -1.84 -0.35 -0.33 0.22 -0.69 0.39 0.27 0.26 0.41 0.43 -0.41 0.38 0.46 0.5 0.44 -0.41 -1.75 0.31 -0.18 -0.33 0.35
CSA012436.1 (CSA012436)
0.02 -1.33 -0.12 -0.35 -0.19 -0.02 -0.44 -0.71 0.07 0.23 -0.07 0.54 -0.38 -0.33 0.43 0.46 0.44 0.49 -0.04 -1.79 0.26 -0.3 0.5 0.38
CSA012741.1 (CSA012741)
- -2.65 0.29 3.06 -1.01 -0.62 -2.64 - -0.44 0.08 1.02 -1.65 -2.7 - -1.22 -0.94 -1.1 -1.69 0.73 -1.38 0.99 -0.45 0.91 -1.61
CSA013276.1 (CSA013276)
-3.38 -2.13 -1.93 1.9 -0.98 -0.68 -1.08 -1.26 0.04 0.03 -0.12 0.75 -0.22 -1.44 0.6 0.62 0.58 0.51 -1.49 -2.12 0.74 -0.36 0.72 0.17
CSA013628.1 (CSA013628)
-0.19 -1.82 -0.4 -0.33 -0.44 0.14 -0.3 0.04 0.4 0.31 0.24 0.34 -0.13 -0.31 0.29 0.45 0.31 0.51 0.18 -1.35 0.24 -0.15 -0.22 0.21
CSA013671.1 (RUB1)
0.34 0.29 -0.62 -2.95 -0.12 -0.45 0.0 -0.3 -0.09 -0.07 0.23 0.15 0.27 -0.51 0.37 0.65 0.44 0.55 -1.08 -0.59 0.31 -0.24 -0.14 0.46
CSA013922.1 (VSR2)
0.59 -1.02 0.25 -0.12 0.13 0.29 -1.0 -0.12 0.91 0.86 0.71 0.75 -0.37 -0.48 -0.14 -0.01 0.04 -0.05 -2.17 -1.32 0.24 -1.0 -0.18 -0.8
CSA014161.1 (CSA014161)
-3.5 -2.26 -2.22 - -3.07 -1.03 0.92 -0.41 1.23 1.2 1.34 1.33 -1.48 -1.32 0.24 0.18 0.32 -0.09 -3.71 -3.3 1.61 -0.96 0.07 -1.03
CSA014338.1 (CSA014338)
-1.76 -1.91 0.73 2.54 0.54 -0.16 0.02 -0.64 0.18 -0.48 -0.12 -0.21 -1.11 -1.52 -0.62 -0.69 -0.2 -0.78 0.08 -2.15 0.12 -1.19 0.57 -1.0
CSA014374.1 (CSA014374)
0.13 -1.25 0.2 0.31 0.16 0.32 -0.22 -0.0 0.41 0.69 0.14 0.62 0.3 -0.61 -0.04 0.2 0.15 0.13 -0.89 -1.45 0.24 -0.46 -0.63 -0.69
CSA014892.1 (CSA014892)
-1.63 -0.4 -0.67 0.68 -0.36 -0.11 -0.34 0.35 0.36 0.29 -0.02 0.8 -0.04 -1.01 0.29 0.45 0.26 0.46 -0.42 -2.27 0.16 -0.45 -0.15 0.45
CSA016367.1 (emb2742)
0.31 -1.43 0.46 0.17 -0.87 0.43 -0.29 -0.01 0.74 0.58 0.28 0.65 -0.03 -0.77 -0.01 -0.08 -0.13 -0.06 -0.88 -1.51 0.2 -0.37 0.1 -0.04
CSA016634.1 (CSA016634)
-0.55 -0.06 -0.55 -0.26 0.03 0.01 0.06 -1.11 0.21 0.09 -0.07 0.22 -0.32 -0.24 0.34 0.41 0.42 0.47 0.07 -2.12 0.12 0.01 0.25 0.55
CSA017412.1 (CSA017412)
-0.48 -0.41 -1.74 -2.44 0.07 -0.26 -0.66 -0.32 0.33 0.43 0.6 0.53 1.08 -0.65 0.51 0.62 0.45 0.55 -1.4 -1.13 0.56 -1.14 -0.39 0.15
CSA017575.1 (ACHT4)
-0.09 -1.49 -0.94 0.21 -0.48 -0.31 -0.11 -1.0 0.93 0.89 0.77 0.72 -0.67 -0.88 0.45 0.28 0.5 0.12 -1.84 -1.04 0.95 -0.74 -0.24 -0.87
CSA018710.1 (NF-YB13)
-0.43 -0.74 0.22 -0.04 0.46 0.01 0.22 -0.63 -0.0 0.06 0.12 0.3 0.01 -0.46 0.19 0.37 0.29 0.29 -0.12 -0.25 0.03 -0.89 -0.06 0.14
CSA019201.1 (CSA019201)
0.71 -0.54 -0.31 -1.36 0.13 0.33 -0.46 -0.31 0.44 0.45 0.4 0.43 0.33 -0.73 -0.05 0.17 0.05 0.05 -0.3 -0.59 0.3 -0.66 -0.44 0.11
CSA019506.1 (CSA019506)
0.4 -0.77 -0.72 0.25 -0.26 0.11 -0.2 -0.18 0.55 0.49 0.3 0.45 -0.3 -0.6 0.08 0.16 0.06 0.14 -0.78 -0.14 0.39 -0.69 -0.04 -0.02
-0.21 -1.99 -0.18 -0.18 0.09 0.11 -0.88 -0.15 0.83 0.85 1.03 0.9 -1.06 -0.53 -0.04 0.0 0.04 0.01 -1.36 -1.38 0.7 -0.36 -0.02 -0.55
CSA020645.1 (RBL15)
0.59 -0.08 -0.95 -0.15 -0.66 -0.6 -0.46 -1.18 -0.02 -0.2 0.13 -0.02 -0.69 -0.2 0.52 0.7 0.5 0.7 -0.26 0.34 0.07 -0.42 -0.18 0.43
CSA020725.1 (CSA020725)
-0.13 -1.63 -0.22 -0.06 -0.67 -0.72 -1.24 -0.08 0.54 0.11 0.54 0.2 0.02 -0.04 0.53 0.56 0.53 0.43 -0.75 0.18 0.38 -0.46 -0.19 -0.19
CSA020864.1 (NRPB7)
-0.08 -0.27 -0.88 -0.98 -0.06 -0.39 0.12 -0.17 0.45 0.26 0.27 0.49 0.09 -0.4 0.19 0.23 0.38 0.34 0.01 -0.92 0.14 -0.76 -0.18 0.57
CSA021469.1 (VPS26B)
0.13 -1.31 -0.04 0.03 0.05 -0.47 -0.52 -0.52 0.12 0.03 0.18 0.05 -0.35 0.01 0.4 0.5 0.34 0.51 -0.57 -0.33 0.02 -0.16 0.21 0.43
CSA021641.1 (BPM2)
-0.18 -1.02 -0.28 0.35 0.21 0.24 -0.25 -0.41 0.45 0.32 0.4 0.17 -0.04 -0.37 0.07 0.25 0.17 0.33 -0.72 0.02 0.05 -0.69 -0.52 0.28
CSA021851.1 (CSA021851)
0.41 -1.03 -0.4 0.03 -0.1 0.42 -0.8 -0.6 0.5 0.53 0.4 0.72 -0.28 -0.3 0.12 0.11 0.12 0.15 -1.06 -0.61 0.37 -0.17 -0.25 -0.13
CSA022969.1 (CSA022969)
0.52 -1.23 0.97 -2.98 -0.59 -0.12 -0.11 -1.13 1.12 0.83 0.98 0.61 -0.32 -0.76 0.04 0.19 -0.25 0.14 -1.71 -1.78 0.39 -0.99 -0.33 -0.11
CSA022973.1 (JOSL)
0.57 -0.24 -0.68 -0.05 -0.92 -0.75 -0.25 -0.88 -0.15 -0.15 -0.0 -0.01 0.24 -0.38 0.69 0.67 0.53 0.73 -0.59 0.07 -0.14 -0.45 -0.05 0.27
CSA023475.1 (CSA023475)
- -1.68 -1.79 2.84 -2.11 -1.49 -0.18 -0.92 -0.38 -0.32 -0.67 -0.03 0.02 -0.83 0.16 0.07 0.27 -0.31 -1.12 -1.82 1.37 -0.85 0.07 -1.5
CSA023783.1 (CSA023783)
0.14 -1.04 -1.45 0.22 -0.23 0.03 -1.42 -1.87 0.2 0.05 0.32 0.27 -0.89 -0.25 0.89 0.64 0.5 0.74 -1.77 0.45 -0.13 -0.05 0.13 0.28
CSA024423.1 (CSA024423)
-4.91 -2.71 - -6.43 - -6.41 -1.6 0.58 1.47 1.48 1.64 0.94 -2.63 -1.18 0.56 0.25 0.38 -0.3 -4.5 -0.26 0.96 0.31 0.54 -1.08
CSA024994.1 (UPF3)
0.64 -2.0 -0.35 0.13 -0.03 0.12 -1.08 -0.42 0.6 0.8 0.47 0.44 -0.2 -0.75 0.21 0.29 0.24 0.27 -0.91 -0.68 0.14 -0.72 0.21 -0.38
CSA025189.1 (CSA025189)
-0.03 -0.22 -0.21 0.97 -1.32 -0.82 0.09 -0.97 0.06 -0.16 0.28 -0.08 0.37 -0.45 0.59 0.57 0.38 0.35 -0.11 -0.98 0.22 -0.84 0.26 -0.42
CSA025755.1 (AMY2)
0.71 -1.15 0.21 0.88 -0.53 -0.11 0.46 -0.04 -0.12 -0.15 0.15 -0.31 -0.65 -0.26 0.21 0.37 0.21 0.35 -0.42 -1.38 0.02 -0.73 0.24 -0.09
0.01 -0.47 0.06 -2.4 0.26 -0.32 -0.39 -0.26 0.31 0.3 0.33 0.41 0.23 -0.33 0.09 0.23 0.17 0.2 0.47 -1.62 0.43 -0.56 -0.14 0.34
CSA026147.1 (CSA026147)
-0.2 -0.43 -0.83 -0.54 -0.47 -0.34 -0.12 -0.5 0.59 0.57 0.63 0.45 -0.46 -0.23 0.31 0.15 0.28 0.14 -0.59 -0.21 0.48 -0.18 -0.06 0.11
CSA026570.1 (TXR1)
0.5 0.08 -0.8 -0.41 -0.03 -1.86 -0.35 -0.27 -0.3 -0.21 0.24 -1.61 0.29 -0.83 0.68 0.87 0.7 0.78 -1.02 -0.09 -0.52 -0.43 0.35 0.53
CSA027830.1 (CKB4)
0.46 -1.15 -0.56 0.28 -0.37 -0.34 -0.68 -0.73 0.3 0.02 0.27 0.02 0.05 -0.11 0.45 0.58 0.46 0.53 -0.28 -0.25 -0.11 -0.31 -0.1 0.08
CSA028302.1 (CSA028302)
-1.69 -1.61 -1.46 2.54 -0.89 -1.2 -0.84 -1.3 0.44 0.72 0.9 0.88 -1.34 -1.1 -0.72 -1.13 -0.97 -1.16 -0.4 -1.43 1.34 -0.22 -0.19 -1.96
CSA028485.1 (CSA028485)
0.36 -0.38 -0.36 0.82 -0.43 -0.37 0.36 -0.22 -0.25 -0.22 -0.21 -0.66 0.23 -0.22 0.39 0.43 0.27 0.34 -0.11 -0.06 -0.26 -0.58 -0.2 0.18
CSA028663.1 (CSA028663)
-0.5 -0.49 -2.19 3.01 -3.48 -2.26 0.27 -0.88 0.34 0.16 0.33 -0.81 -2.28 -0.91 -0.93 -1.07 -0.86 -1.17 0.09 -2.32 0.69 -0.94 0.55 -1.18
CSA030441.1 (DOF2)
-0.62 -0.75 -0.06 0.42 -1.06 -0.06 0.42 0.39 0.01 -0.01 0.04 -0.18 -0.35 -0.27 0.58 0.92 0.62 0.84 -3.63 -1.59 -0.08 -0.21 -0.09 -0.06
CSA030554.1 (CSA030554)
-0.15 -2.37 -0.28 0.81 -0.46 -0.33 -1.27 -1.36 0.19 -0.17 0.25 -0.09 0.12 -0.08 0.72 1.2 0.62 0.99 -2.49 -1.08 0.01 -0.53 -0.19 0.15
CSA032138.1 (CSA032138)
-3.59 -2.77 -3.37 2.35 0.5 -1.63 -0.66 -0.8 0.35 0.57 -0.02 0.82 0.34 -0.61 -0.1 0.16 0.09 0.03 -4.64 -3.71 1.16 -1.33 -0.64 -0.62
CSA032179.1 (CSA032179)
-0.14 -1.14 -0.16 0.12 -0.66 -0.06 -0.17 -0.04 0.28 0.15 0.34 0.07 0.03 -0.19 0.45 0.4 0.52 0.41 -0.23 -0.47 0.1 -0.52 -0.16 -0.02
CSA032636.1 (CSA032636)
-1.79 -2.56 -0.43 - -0.5 -0.08 -0.25 -2.42 1.25 1.15 1.2 0.94 -1.21 -0.26 0.45 1.0 0.37 0.52 -1.44 -1.2 1.02 -0.99 -2.71 -1.08
CSA032713.1 (CSA032713)
0.32 -1.32 -0.59 -1.93 -0.18 -0.4 -0.37 -0.28 0.14 -0.04 0.39 0.04 0.67 -0.32 0.6 0.59 0.65 0.64 -0.05 -0.81 -0.22 -0.23 0.02 -0.05
CSA036043.1 (DAL1)
0.16 -0.98 -0.62 0.45 0.08 -0.07 -1.02 0.05 0.7 0.68 0.49 0.66 -0.19 -0.44 -0.0 0.0 0.05 0.07 -1.0 -0.15 0.39 -0.37 -0.58 -0.42
CSA036126.1 (CSA036126)
- - -1.96 1.95 - - -0.78 0.14 -0.27 -0.23 -0.55 -0.73 -2.26 -1.64 0.85 1.04 1.27 0.75 -2.67 -5.2 0.05 1.04 1.29 0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.