Heatmap: Cluster_291 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	root,3-year-old,no treatment	root,3-year-old,ammonium treatment	leaf,3-year-old,no treatment	leaf,3-year-old,ammonium treatment	pistil,10-year-old,no treatment	old leaf,4-year-old,no treatment	fourth leaf,4-year-old,no treatment	third leaf,4-year-old,no treatment	second leaf,4-year-old,no treatment	one leaf and a bud,4-year-old,no treatment	leaf,9-year-old,no treatment	two leaves and a bud,missing,no treatment	trichome,missing,no treatment	root,missing,no treatment	stem,missing,no treatment	leaf,missing,no treatment	second leaf,missing,no treatment	lateral root,high nitrogen (2.5 mM)	lateral root,control (1 mM)	lateral root,low nitrogen (0.25 mM)	lateral root,high nitrogen(2.5 mM),IBA(0.4 mM)	lateral root,low nitrogen(0.25 mM),NPA(20 uM)	shoot,missing,control	root,missing,organic nitrogen treatment	root,missing,high nitrogen treatment	root,missing,low nitrogen treatment	shoot,missing,organic nitrogen treatment	shoot,missing,high nitrogen treatment	shoot,missing,low nitrogen treatment	root,missing,control	mix nine tissues,no treatment	root,2-year-old,As treatment	root,2-year-old,Cd treatment	root,2-year-old,no treatment
FUDINGDABAI01936 (CSLG2)	0.38	0.26	0.29	0.25	1.0	0.63	0.08	0.07	0.11	0.28	0.26	0.34	0.16	0.16	0.56	0.23	0.09	0.02	0.06	0.11	0.01	0.05	0.17	0.13	0.14	0.14	0.18	0.21	0.11	0.14	0.6	0.48	0.55	0.46
FUDINGDABAI01939 (CSLE1)	0.05	0.05	0.35	0.22	1.0	0.2	0.05	0.02	0.06	0.16	0.23	0.31	0.15	0.03	0.5	0.09	0.14	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.2	0.03	0.02	0.03	0.23	0.27	0.09	0.03	0.1	0.29	0.33	0.17
FUDINGDABAI02009 (TBL10)	0.22	0.16	0.37	0.34	1.0	0.57	0.18	0.21	0.29	0.36	0.43	0.41	0.19	0.72	0.57	0.31	0.24	0.3	0.27	0.28	0.07	0.34	0.45	0.38	0.45	0.46	0.33	0.48	0.38	0.5	0.24	0.47	0.68	0.32
FUDINGDABAI02777	0.32	0.44	0.33	0.31	1.0	0.45	0.29	0.26	0.29	0.31	0.34	0.33	0.24	0.4	0.46	0.45	0.17	0.27	0.26	0.31	0.17	0.28	0.28	0.29	0.32	0.38	0.22	0.3	0.22	0.36	0.21	0.51	0.5	0.43
FUDINGDABAI03946 (SLP2)	0.53	0.48	1.0	0.68	0.91	0.33	0.29	0.33	0.5	0.46	0.57	0.34	0.15	0.88	0.66	0.15	0.43	0.3	0.28	0.41	0.01	0.31	0.29	0.35	0.27	0.3	0.19	0.34	0.24	0.29	0.46	0.65	0.75	0.54
FUDINGDABAI04207 (KNAT6)	0.05	0.07	0.05	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.0	0.0	0.18	0.32	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.09	0.11	0.09	0.01	0.01	0.01	0.07	0.1	0.28	0.31	0.22
FUDINGDABAI06190 (RGS1)	0.28	0.42	0.38	0.27	1.0	0.35	0.29	0.34	0.38	0.38	0.35	0.47	0.31	0.35	0.42	0.46	0.29	0.23	0.14	0.28	0.12	0.17	0.29	0.28	0.31	0.33	0.29	0.34	0.24	0.36	0.36	0.44	0.42	0.42
FUDINGDABAI07976 (PDLP6)	0.45	0.44	0.56	0.5	1.0	0.06	0.19	0.24	0.26	0.24	0.3	0.24	0.06	0.83	0.61	0.13	0.75	0.2	0.15	0.19	0.03	0.11	0.14	0.14	0.16	0.16	0.1	0.17	0.1	0.12	0.39	0.98	0.9	0.91
FUDINGDABAI08095 (ARABIDILLO1)	0.58	0.62	0.5	0.41	1.0	0.68	0.54	0.45	0.5	0.54	0.52	0.33	0.33	0.52	0.59	0.54	0.38	0.37	0.33	0.4	0.36	0.33	0.34	0.51	0.53	0.58	0.33	0.42	0.34	0.58	0.57	0.6	0.55	0.52
FUDINGDABAI08302	0.08	0.36	0.3	0.3	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.08	0.03	0.09	0.18	0.04	0.06	0.08	0.06	0.07	0.09	0.06	0.04	0.1	0.09	0.07	0.04	0.05	0.05	0.07	0.09	0.19	0.13	0.16
FUDINGDABAI08330 (ARF6)	0.25	0.48	0.37	0.29	1.0	0.16	0.26	0.25	0.27	0.33	0.32	0.31	0.21	0.45	0.57	0.23	0.45	0.23	0.22	0.26	0.04	0.18	0.28	0.22	0.23	0.24	0.2	0.31	0.19	0.23	0.07	0.37	0.33	0.26
FUDINGDABAI08614 (TAA1)	0.29	0.07	0.0	0.0	1.0	0.2	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.16	0.02	0.01	0.2	0.15	0.25	0.09	0.18	0.03	0.19	0.21	0.1	0.05	0.02	0.02	0.18	0.27	0.25	0.06	0.07
FUDINGDABAI10444	0.12	0.16	0.31	0.28	1.0	0.43	0.19	0.16	0.18	0.19	0.36	0.26	0.13	0.19	0.31	0.32	0.34	0.15	0.11	0.13	0.14	0.1	0.27	0.09	0.1	0.1	0.16	0.26	0.24	0.1	0.33	0.44	0.36	0.25
FUDINGDABAI11705	0.47	0.38	0.72	0.49	1.0	0.18	0.26	0.29	0.35	0.45	0.82	0.59	0.43	0.85	0.72	0.62	0.28	0.42	0.67	0.34	0.14	0.39	0.45	0.39	0.55	0.67	0.41	0.41	0.62	0.47	0.55	0.69	0.8	0.75
FUDINGDABAI13906	0.33	0.21	0.48	0.32	1.0	0.22	0.23	0.26	0.32	0.39	0.36	0.29	0.15	0.33	0.45	0.28	0.32	0.11	0.15	0.14	0.06	0.15	0.25	0.19	0.46	0.21	0.15	0.19	0.09	0.25	0.67	0.28	0.43	0.29
FUDINGDABAI18631	0.16	0.17	0.03	0.02	1.0	0.07	0.05	0.03	0.04	0.03	0.08	0.01	0.03	0.31	0.3	0.05	0.01	0.17	0.24	0.23	0.11	0.16	0.24	0.18	0.24	0.19	0.16	0.16	0.15	0.22	0.06	0.27	0.43	0.27
FUDINGDABAI21409	0.18	0.07	0.19	0.13	1.0	0.23	0.04	0.05	0.06	0.09	0.11	0.09	0.08	0.54	0.55	0.28	0.16	0.1	0.07	0.12	0.04	0.04	0.12	0.15	0.1	0.13	0.22	0.19	0.17	0.11	0.39	0.15	0.14	0.17
FUDINGDABAI21645 (UBP24)	0.29	0.36	0.33	0.27	1.0	0.31	0.26	0.28	0.33	0.41	0.39	0.56	0.38	0.29	0.37	0.31	0.14	0.3	0.27	0.3	0.21	0.23	0.4	0.4	0.46	0.46	0.35	0.42	0.33	0.42	0.28	0.4	0.42	0.36
FUDINGDABAI22173 (LYC)	0.29	0.1	0.01	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.1	0.06	0.01	0.01	0.05	0.05	0.09	0.1	0.05	0.01	0.16	0.15	0.22	0.0	0.01	0.0	0.13	0.2	0.33	0.31	0.21
FUDINGDABAI22794 (LRP1)	0.19	0.04	0.16	0.14	1.0	0.05	0.05	0.05	0.05	0.13	0.11	0.18	0.41	0.09	0.32	0.18	0.06	0.24	0.25	0.13	0.03	0.08	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.07	0.02	0.12	0.28	0.26
FUDINGDABAI22915	0.24	0.43	0.22	0.17	1.0	0.3	0.12	0.12	0.15	0.21	0.2	0.12	0.18	0.29	0.22	0.12	0.24	0.17	0.11	0.12	0.12	0.17	0.27	0.2	0.25	0.17	0.15	0.27	0.15	0.31	0.15	0.26	0.43	0.34
FUDINGDABAI23524	0.14	0.11	0.06	0.06	1.0	0.24	0.15	0.19	0.23	0.35	0.14	0.24	0.25	0.21	0.3	0.19	0.05	0.14	0.09	0.15	0.06	0.12	0.09	0.12	0.12	0.16	0.07	0.09	0.07	0.18	0.1	0.34	0.39	0.22
FUDINGDABAI23678	0.25	0.16	0.3	0.23	1.0	0.12	0.22	0.26	0.32	0.37	0.25	0.2	0.19	0.43	0.4	0.24	0.32	0.19	0.18	0.2	0.09	0.27	0.16	0.3	0.27	0.32	0.15	0.15	0.13	0.34	0.75	0.2	0.25	0.2
FUDINGDABAI23837	0.84	0.98	0.55	0.47	1.0	0.68	0.57	0.57	0.57	0.58	0.59	0.57	0.55	0.61	0.58	0.48	0.56	0.5	0.42	0.58	0.37	0.61	0.57	0.63	0.67	0.69	0.52	0.58	0.49	0.65	0.74	0.77	0.7	0.65
FUDINGDABAI25739	0.41	0.37	0.38	0.33	1.0	0.45	0.58	0.47	0.43	0.42	0.51	0.42	0.57	0.49	0.71	0.5	0.56	0.47	0.41	0.49	0.23	0.49	0.51	0.49	0.52	0.57	0.47	0.51	0.4	0.62	0.43	0.52	0.6	0.44
FUDINGDABAI26432	0.32	0.25	0.49	0.29	1.0	0.24	0.18	0.23	0.37	0.45	0.61	0.31	0.16	0.91	0.61	0.2	0.2	0.32	0.29	0.36	0.06	0.28	0.39	0.36	0.38	0.37	0.21	0.35	0.37	0.28	0.27	0.44	0.58	0.5
FUDINGDABAI29764	0.16	0.01	0.07	0.06	1.0	0.0	0.07	0.08	0.11	0.12	0.08	0.03	0.06	0.4	0.36	0.05	0.2	0.26	0.22	0.3	0.08	0.16	0.12	0.29	0.24	0.27	0.09	0.07	0.08	0.26	0.17	0.34	0.46	0.42
FUDINGDABAI30310	0.46	0.25	0.11	0.11	1.0	0.21	0.1	0.1	0.09	0.15	0.1	0.16	0.24	0.29	0.37	0.13	0.05	0.25	0.3	0.29	0.07	0.19	0.19	0.22	0.26	0.18	0.1	0.11	0.17	0.22	0.25	0.25	0.36	0.42
FUDINGDABAI30311	0.44	0.27	0.18	0.14	1.0	0.21	0.14	0.11	0.1	0.17	0.19	0.19	0.16	0.43	0.7	0.25	0.09	0.19	0.22	0.21	0.05	0.2	0.16	0.24	0.3	0.28	0.15	0.19	0.15	0.33	0.56	0.34	0.51	0.48
FUDINGDABAI30353 (SRS5)	0.14	0.0	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.24	0.0	0.0	0.11	0.06	0.11	0.04	0.03	0.0	0.09	0.1	0.08	0.0	0.0	0.0	0.11	0.05	0.17	0.4	0.19
FUDINGDABAI30362 (SRS1)	0.09	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.15	0.15	0.0	0.0	0.2	0.16	0.12	0.05	0.07	0.0	0.1	0.06	0.12	0.01	0.01	0.0	0.11	0.0	0.24	0.58	0.15
FUDINGDABAI30363 (SRS7)	0.05	0.07	0.01	0.02	1.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.04	0.0	0.2	0.15	0.1	0.08	0.06	0.0	0.04	0.06	0.05	0.0	0.02	0.01	0.08	0.0	0.18	0.35	0.17
FUDINGDABAI43284 (SUVR4)	0.22	0.22	0.23	0.29	1.0	0.6	0.17	0.12	0.12	0.1	0.53	0.24	0.24	0.53	0.39	0.39	0.19	0.09	0.08	0.12	0.2	0.11	0.23	0.1	0.11	0.1	0.13	0.25	0.2	0.11	0.2	0.3	0.35	0.27
FUDINGDABAI43699	0.46	0.37	0.56	0.46	1.0	0.63	0.43	0.42	0.48	0.51	0.38	0.35	0.42	0.4	0.5	0.52	0.4	0.31	0.34	0.33	0.25	0.2	0.27	0.27	0.35	0.37	0.39	0.46	0.31	0.37	0.22	0.47	0.59	0.46
FUDINGDABAI44618 (PLP6)	0.36	0.18	0.3	0.25	1.0	0.06	0.09	0.12	0.18	0.26	0.19	0.29	0.28	0.27	0.18	0.05	0.26	0.25	0.28	0.28	0.14	0.19	0.13	0.32	0.26	0.31	0.08	0.09	0.08	0.26	0.22	0.35	0.32	0.32
FUDINGDABAI44960	0.22	0.19	0.25	0.22	1.0	0.22	0.25	0.24	0.25	0.25	0.24	0.25	0.22	0.37	0.67	0.3	0.54	0.29	0.3	0.28	0.23	0.37	0.26	0.31	0.32	0.31	0.27	0.26	0.25	0.32	0.11	0.31	0.3	0.28
FUDINGDABAI45668	0.12	0.02	0.31	0.17	1.0	0.0	0.01	0.02	0.06	0.2	0.18	0.07	0.04	0.57	0.51	0.02	0.04	0.04	0.03	0.07	0.0	0.04	0.01	0.08	0.12	0.11	0.02	0.03	0.02	0.16	0.1	0.1	0.4	0.53
FUDINGDABAI48043	0.0	0.07	0.14	0.13	1.0	0.12	0.07	0.1	0.07	0.11	0.04	0.03	0.06	0.07	0.32	0.3	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.31	0.06	0.05
FUDINGDABAI48835	0.97	0.77	0.57	0.49	1.0	0.61	0.35	0.3	0.38	0.45	0.51	0.43	0.29	0.52	0.36	0.42	0.32	0.33	0.3	0.33	0.12	0.28	0.35	0.45	0.49	0.5	0.26	0.33	0.3	0.51	0.46	0.56	0.47	0.57
FUDINGDABAI51553 (SRS1)	0.1	0.03	0.05	0.0	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.05	0.04	0.01	0.11	0.11	0.31	0.0	0.01	0.21	0.14	0.12	0.09	0.08	0.01	0.13	0.09	0.11	0.0	0.01	0.0	0.08	0.0	0.27	0.37	0.22
FUDINGDABAI52061 (GTA2)	0.33	0.33	0.4	0.34	1.0	0.55	0.24	0.24	0.27	0.32	0.35	0.3	0.28	0.4	0.56	0.39	0.24	0.2	0.17	0.2	0.32	0.16	0.24	0.24	0.24	0.25	0.18	0.25	0.18	0.24	0.69	0.45	0.37	0.38
FUDINGDABAI52403 (ORF102)	0.15	0.21	0.07	0.12	1.0	0.14	0.14	0.09	0.1	0.08	0.14	0.41	0.31	0.14	0.19	0.26	0.06	0.18	0.13	0.12	0.09	0.18	0.09	0.09	0.15	0.13	0.09	0.11	0.07	0.13	0.09	0.25	0.3	0.23
FUDINGDABAI52684 (BIR1)	0.06	0.05	0.35	0.23	1.0	0.27	0.13	0.15	0.13	0.17	0.15	0.17	0.04	0.16	0.16	0.22	0.31	0.06	0.03	0.08	0.01	0.03	0.0	0.13	0.06	0.06	0.02	0.03	0.01	0.1	0.09	0.23	0.36	0.19
FUDINGDABAI53003	0.21	0.13	0.16	0.13	1.0	0.09	0.21	0.16	0.2	0.15	0.26	0.19	0.13	0.23	0.35	0.21	0.21	0.27	0.26	0.25	0.27	0.27	0.28	0.22	0.18	0.19	0.18	0.22	0.24	0.18	0.07	0.29	0.28	0.22
FUDINGDABAI53596	0.45	0.58	0.47	0.41	1.0	0.39	0.29	0.31	0.35	0.39	0.44	0.49	0.42	0.47	0.43	0.43	0.31	0.35	0.34	0.4	0.24	0.25	0.34	0.36	0.39	0.38	0.3	0.37	0.26	0.36	0.3	0.48	0.48	0.41
FUDINGDABAI56661 (ARF6)	0.16	0.19	0.35	0.24	1.0	0.08	0.12	0.12	0.13	0.16	0.21	0.23	0.11	0.35	0.51	0.23	0.21	0.21	0.19	0.22	0.08	0.18	0.23	0.33	0.31	0.3	0.16	0.2	0.16	0.28	0.2	0.36	0.43	0.32
FUDINGDABAI56662 (ARF6)	0.22	0.28	0.42	0.32	1.0	0.21	0.25	0.27	0.3	0.35	0.28	0.37	0.22	0.44	0.68	0.34	0.29	0.18	0.18	0.25	0.07	0.21	0.23	0.31	0.36	0.35	0.19	0.26	0.13	0.37	0.32	0.35	0.42	0.3
FUDINGDABAI56847	0.14	0.41	0.12	0.1	1.0	0.25	0.14	0.16	0.18	0.0	0.05	0.08	0.09	0.23	0.0	0.29	0.02	0.05	0.0	0.02	0.05	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.08	0.0	0.34	0.0	0.07
FUDINGDABAI57617 (CYP76C4)	0.05	0.15	0.32	0.26	1.0	0.44	0.1	0.07	0.07	0.08	0.31	0.18	0.11	0.03	0.17	0.06	0.4	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.12	0.08	0.09	0.12	0.17	0.3	0.2	0.12	0.27	0.3	0.17	0.34
FUDINGDABAI57799 (LSH4)	0.06	0.06	0.32	0.22	1.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.07	0.02	0.02	0.28	0.63	0.03	0.08	0.19	0.11	0.11	0.26	0.07	0.04	0.14	0.08	0.06	0.02	0.03	0.03	0.05	0.14	0.3	0.35	0.24
FUDINGDABAI58116 (BZIP53)	0.35	0.29	0.19	0.2	1.0	0.25	0.15	0.17	0.21	0.37	0.21	0.29	0.5	0.2	0.14	0.09	0.09	0.2	0.23	0.25	0.24	0.16	0.15	0.27	0.26	0.29	0.13	0.13	0.12	0.24	0.0	0.35	0.38	0.25
FUDINGDABAI60772	0.89	0.01	0.1	0.09	1.0	0.0	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.01	0.02	0.14	0.17	0.03	0.02	0.05	0.1	0.11	0.0	0.12	0.0	0.03	0.09	0.08	0.02	0.01	0.01	0.12	0.08	0.03	0.19	0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)