Heatmap: Cluster_187 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
second leaf,natural sun/80% shade
third leaf,2-year-old,no treatment
third leaf,2-year-old,shade treatment
fourth leaf,10-year-old,no treatment
fourth leaf,10-year-old,shading treatment
two leaves and a bud,blue light 15d
two leaves and a bud,blue/red (1:1) light 15d
two leaves and a bud,red light 15d
two leaves and a bud,white light 15d
second leaf,missing,no treatment
leaf,missing,no treatment
two leaves and a bud,missing,no treatment
tender leaf,red/white (2:3) light 10d
tender leaf,white light 10d
0.17 -0.35 -0.16 0.09 -0.87 0.91 -0.36 -0.7 -0.34 0.41 0.34 -0.29 0.08 0.06
0.27 0.33 -0.04 -0.08 -1.15 0.86 -0.24 -0.2 -0.14 0.57 -0.47 -0.66 -0.16 -0.01
-0.04 0.19 -0.14 -0.44 -1.43 1.01 -0.31 -0.99 -0.08 0.54 -0.05 -0.79 0.3 0.46
0.15 0.2 -0.12 -0.42 -1.85 0.79 -0.09 -0.14 -0.06 0.52 0.16 -1.23 0.12 0.25
0.2 -0.39 -0.33 -0.56 -1.16 0.71 -0.17 -0.13 -0.21 0.62 0.51 -0.59 0.13 0.22
0.25 -0.24 0.04 -0.03 -0.77 0.7 -0.27 -0.47 -0.17 0.49 0.01 -0.83 0.19 0.26
0.23 -0.54 -0.3 -0.19 -1.22 0.61 -0.16 -0.17 -0.18 0.44 0.48 -0.16 0.06 0.19
0.03 -1.01 -1.0 0.09 -0.56 1.32 -0.12 -0.15 -0.04 0.26 -0.4 -0.64 0.19 0.28
HUANGJINYA04051 (CSP41A)
0.31 -0.6 -0.51 0.17 -0.84 1.03 -0.06 -0.76 0.28 0.3 -0.17 -1.22 0.21 0.27
HUANGJINYA04090 (HCF164)
0.12 0.63 0.42 -0.27 -1.19 0.79 -0.35 -0.43 -0.52 0.31 -0.26 -0.45 -0.02 0.03
0.19 -0.39 -0.41 0.03 -0.67 0.87 -0.46 -0.24 -0.5 0.64 0.38 -0.89 0.05 0.2
0.1 -0.02 -0.13 -0.27 -1.4 0.61 0.25 0.03 0.02 0.49 -0.38 -1.04 0.26 0.29
0.21 -1.46 -0.97 -0.76 -1.03 0.93 0.23 0.13 0.06 0.2 0.2 -0.31 0.28 0.44
0.27 -0.24 0.21 -0.33 -1.0 1.14 -0.16 -0.18 -0.11 0.69 -0.68 -1.0 -0.07 -0.16
0.07 -0.93 -0.54 -0.2 -0.63 0.96 -0.08 -0.07 -0.02 0.61 -0.2 -0.99 0.27 0.36
0.03 -1.04 -0.33 -0.32 -0.19 0.94 0.06 0.0 0.04 0.32 0.05 -0.88 0.09 0.2
-0.08 -0.82 -0.52 -0.68 -1.33 1.4 -0.01 0.07 0.12 0.22 -0.25 -1.83 0.28 0.58
-0.01 -2.68 -0.02 -1.45 -1.13 1.49 -0.05 -0.44 0.12 0.51 -2.06 -3.13 0.71 1.02
0.05 -0.51 -0.54 -0.67 -1.16 1.28 0.06 -0.34 0.08 0.34 0.04 -0.58 0.05 0.23
-0.01 -0.74 -0.47 -0.56 -1.09 1.15 0.02 -0.14 0.04 0.3 -0.26 -0.48 0.3 0.45
0.33 0.42 0.22 -0.13 -1.36 1.37 -1.15 -1.12 -0.83 0.82 -0.29 -1.74 -0.05 0.03
0.12 -1.38 -0.56 -0.69 0.24 1.85 -0.94 -1.25 -0.85 0.5 -2.1 -2.77 0.51 0.78
0.55 -1.14 -0.56 -0.59 -1.08 1.07 -0.4 -0.25 -0.29 0.82 -0.35 -1.47 0.45 0.55
0.01 -0.52 -0.78 -0.44 -1.89 1.63 -0.06 -0.29 0.11 0.46 -0.4 -0.65 -0.04 -0.01
0.12 0.25 0.17 -0.51 -0.58 1.09 -0.03 -0.23 -0.18 0.28 -1.26 -1.83 0.26 0.35
0.15 0.49 0.09 -0.17 -0.86 0.89 -0.18 -0.47 -0.11 0.44 -0.12 -1.51 -0.15 0.09
-0.56 -0.18 -0.62 0.08 -0.57 1.17 0.19 0.39 0.14 0.69 -0.98 -0.28 -0.44 -0.8
0.44 -0.32 -0.48 0.04 -0.76 1.09 -0.9 -0.83 -0.7 0.61 -0.28 -0.67 0.45 0.41
-0.07 -0.91 -0.07 -0.33 -0.62 1.67 -0.41 -0.18 -0.06 0.41 -2.2 -2.2 0.31 0.42
0.21 -0.76 -0.66 0.18 -0.42 0.66 -0.17 -0.19 -0.12 0.5 0.33 -1.03 0.13 0.29
0.07 -0.37 0.06 -0.46 -0.8 0.97 -0.2 -0.31 -0.4 0.7 -0.16 -1.0 0.18 0.36
0.36 -0.65 -0.36 -0.86 -1.06 0.75 -0.03 -0.04 -0.08 0.8 -0.23 -2.02 0.39 0.61
0.04 -0.32 -0.62 0.08 -0.72 0.59 -0.18 -0.36 0.03 0.47 0.24 -0.68 0.22 0.42
0.23 0.46 0.41 -0.54 -1.09 0.79 -0.42 -0.54 -0.39 0.59 0.08 -1.73 0.12 0.11
0.13 -0.72 -0.76 -0.52 -1.25 0.96 -0.11 -0.01 -0.19 0.57 0.01 -0.78 0.36 0.56
0.3 -0.93 -0.9 -0.93 -2.25 1.97 0.02 -0.31 -0.03 0.56 -0.88 -1.52 -0.23 0.05
0.02 0.03 0.22 -0.0 -0.54 0.86 -0.45 -0.42 -0.21 0.14 0.23 -1.25 0.04 0.27
-0.35 0.36 0.16 -0.24 -1.75 1.01 0.14 0.02 0.08 0.46 -0.58 -1.39 -0.02 0.11
-0.24 -0.43 -0.14 -1.37 -1.82 2.0 -0.24 0.2 -0.18 0.31 -2.42 -5.38 0.21 0.44
-0.04 0.03 -0.36 -0.89 -1.82 0.92 0.17 -0.11 0.06 0.29 -0.27 -0.42 0.32 0.46
0.39 -0.53 0.15 -0.42 -0.41 0.87 -0.4 -0.47 -0.45 0.72 -0.37 -0.95 0.27 0.26
0.09 -0.74 -0.59 -0.24 -0.86 0.96 0.22 -0.21 0.06 0.66 -0.23 -0.78 0.09 0.23
0.46 -0.32 -0.31 -0.09 -0.53 0.8 -0.36 -0.51 -0.4 0.58 -0.07 -0.81 0.19 0.32
-0.53 -4.3 -1.4 -3.02 -1.04 1.77 0.55 -0.25 0.73 -0.44 - -4.79 0.85 1.21
0.27 -0.2 -0.11 0.12 -1.2 0.75 -0.65 -1.06 -0.43 0.56 0.0 -0.46 0.37 0.51
0.11 -0.18 -0.01 -0.8 -1.55 0.98 0.16 -0.04 -0.04 0.44 -0.12 -1.84 0.24 0.43
-0.23 -0.13 -0.18 -0.27 -0.87 1.19 0.05 -0.15 0.2 0.13 0.03 -0.52 -0.26 -0.03
0.23 0.4 0.01 -0.75 -1.25 0.95 0.01 0.07 0.16 0.02 0.02 -1.14 -0.14 -0.01
HUANGJINYA19002 (SYCO ARATH)
-0.02 -0.25 0.03 -0.23 -1.24 1.02 -0.22 -0.08 -0.26 0.52 0.32 -0.75 0.01 -0.13
HUANGJINYA19005 (SYCO ARATH)
0.16 -0.25 -0.12 -0.31 -1.06 0.59 -0.15 -0.28 -0.13 0.38 0.29 0.02 0.13 0.07
0.34 -1.26 -1.13 -0.05 -0.83 0.85 -0.21 0.01 -0.21 0.15 0.19 -0.26 0.37 0.5
0.27 -0.91 -0.21 -0.61 -0.74 1.0 0.12 0.04 -0.03 0.3 0.18 -1.87 0.19 0.34
-0.16 -0.55 0.01 -0.34 -0.6 1.14 0.11 -0.1 0.07 0.14 -1.15 -1.7 0.39 0.6
0.15 0.1 0.12 -0.36 -1.03 1.52 -0.17 -0.6 -0.08 0.28 -0.41 -1.32 -0.31 -0.13
0.36 0.14 -0.47 0.08 -1.94 1.54 -0.71 -0.53 -0.55 0.83 -0.44 -1.2 -0.33 -0.09
-0.1 0.35 0.21 -0.54 -1.05 0.7 -0.11 -0.12 -0.03 0.25 0.02 -0.71 0.13 0.13
0.19 -0.78 -0.55 -0.1 -0.41 0.86 -0.17 -0.08 -0.2 0.37 0.32 -0.77 0.11 0.25
0.26 -0.97 -0.55 -0.27 -0.94 1.15 -0.28 -0.12 -0.32 1.13 -0.79 -1.16 0.26 0.1
0.26 -1.34 -1.01 -0.59 -1.06 1.06 0.06 0.24 -0.1 0.45 -0.08 -1.17 0.35 0.59
-0.35 0.0 -0.16 -0.47 -1.36 1.26 0.31 -0.23 0.35 0.28 -0.25 -1.37 -0.06 0.05
0.28 -0.73 -0.42 -0.42 -1.03 1.56 -0.46 -0.15 -0.43 0.42 -0.44 -0.88 0.13 0.23
0.22 -0.46 -0.29 -0.23 -1.15 0.67 -0.23 -0.36 -0.12 0.83 0.28 -0.77 0.12 0.23
0.1 -0.46 0.05 -0.67 -0.82 1.22 -0.35 -0.0 -0.7 0.42 -0.24 -1.75 0.4 0.54
0.47 -0.46 -0.67 -0.88 -1.4 1.16 -0.38 -0.59 -0.45 0.81 0.11 -0.73 0.29 0.34
0.08 -0.11 -0.08 0.02 -0.51 0.77 -0.44 -0.32 -0.05 0.41 0.26 -0.64 0.01 -0.03
0.31 -0.61 -0.63 0.09 -0.88 1.13 -0.3 -0.38 -0.52 0.42 0.16 -0.48 0.06 0.22
-0.01 -0.83 -0.36 -1.03 -2.31 1.74 -0.04 -0.37 0.22 0.15 -0.34 -0.29 0.04 -0.04
-0.55 -0.06 -0.45 -0.34 -0.7 1.68 -0.58 -0.36 -0.09 0.81 -1.1 -2.22 0.03 0.23
HUANGJINYA28393 (YLMG1-2)
0.12 -0.77 -0.36 -0.52 -0.79 0.84 -0.04 -0.07 -0.02 0.44 0.74 -1.13 -0.04 0.14
HUANGJINYA28902 (emb1513)
0.26 -0.45 -0.13 -0.37 -0.89 0.76 -0.33 -0.37 -0.38 0.71 -0.06 -0.98 0.47 0.41
0.22 -0.56 -0.44 -0.22 -1.44 0.69 -0.23 -0.42 -0.19 0.73 0.11 -0.82 0.4 0.56
-0.15 -0.19 -0.49 0.09 -0.69 0.77 0.26 0.2 0.14 0.27 -0.19 0.02 -0.44 -0.24
0.31 -0.13 -0.85 0.14 -0.82 1.44 -0.7 -0.42 -0.62 0.64 -1.3 -0.38 0.11 0.1
0.24 -0.05 -0.42 0.15 -0.86 1.23 -1.11 -1.6 -0.75 0.65 0.08 -0.63 0.21 0.36
-0.3 -0.21 -0.08 -0.74 -0.34 1.32 0.27 0.2 0.12 0.11 -1.08 -1.15 -0.15 0.19
0.13 -1.25 -0.71 -0.53 -0.31 0.74 0.1 0.27 0.12 0.12 0.02 -0.37 0.28 0.32
0.18 -0.46 -0.75 -0.81 -2.01 1.72 -0.02 0.04 -0.02 0.55 -0.23 -1.63 -0.27 -0.04
-0.02 -0.35 -0.23 -1.01 -1.21 1.12 0.02 0.22 -0.07 0.15 -0.26 -0.92 0.31 0.52
0.21 -0.15 -0.35 -0.3 -1.67 1.36 -0.4 -0.82 -0.25 0.9 -0.02 -2.71 0.1 0.28
0.27 -0.83 -0.73 -0.63 -1.2 0.85 -0.03 0.17 -0.22 0.51 0.24 -0.45 0.28 0.29
HUANGJINYA34246 (EMB1006)
0.29 -0.53 -0.17 -0.58 -1.68 0.79 -0.1 -0.08 -0.22 0.59 0.32 -0.42 0.12 0.22
0.27 -0.78 -0.82 -0.05 -0.99 1.24 -0.61 -1.02 -0.24 0.49 0.18 -0.84 0.36 0.53
HUANGJINYA34915 (CYP71A21)
-0.35 0.26 -0.01 -1.13 -2.62 1.6 -0.18 -1.45 0.35 0.26 0.04 -5.1 0.42 0.33
-0.39 0.39 0.02 -0.73 -1.16 1.76 0.29 -1.11 0.88 -0.01 -0.13 -5.51 -0.87 -1.05
0.35 -1.04 -0.61 -0.9 -2.12 1.25 -0.26 -0.02 -0.17 0.63 -0.05 -0.7 0.25 0.51
-0.48 -1.0 -0.3 -1.1 -1.02 1.56 0.17 0.2 0.28 0.4 -0.7 -2.15 0.24 0.29
0.08 0.41 0.19 -0.42 -1.2 0.88 -0.05 -0.11 0.15 0.3 -0.48 -1.21 0.02 0.06
0.38 -0.63 -0.18 -0.53 -1.52 0.78 -0.52 0.3 -0.29 0.85 -0.1 -1.92 0.2 0.61
0.35 -0.04 -0.24 0.05 -0.51 0.81 -0.82 -0.83 -0.59 0.42 -0.41 -0.38 0.43 0.51
0.1 0.51 0.29 -0.41 -1.32 0.87 -0.19 -0.03 0.06 -0.01 -0.32 -0.9 0.07 0.05
0.28 -0.31 -0.38 -0.06 -0.69 0.71 -0.18 -0.12 -0.01 0.38 -0.26 -0.91 0.31 0.35
0.14 0.36 -0.05 -1.3 -1.93 0.92 0.08 0.31 -0.13 -0.05 0.09 -1.31 0.22 0.36
0.23 -0.51 -0.07 -0.4 -1.12 0.93 -0.37 -0.57 -0.21 0.66 0.25 -0.52 0.21 0.16
0.19 -1.2 -0.8 -0.41 -0.82 0.9 0.33 -0.13 0.23 0.37 -0.54 -0.62 0.44 0.42
0.27 -0.75 -0.21 -0.35 -0.6 0.9 0.16 -0.16 0.16 0.49 -0.64 -0.55 0.07 0.16
0.07 -0.62 -0.72 0.19 -0.49 0.91 0.01 -0.37 0.27 0.16 0.04 -1.19 0.18 0.36
-0.25 0.01 0.24 -0.41 -1.07 1.08 0.04 -0.26 0.13 0.31 -0.14 -1.37 0.01 0.18
-0.01 -0.34 -0.21 -0.05 -0.6 0.66 -0.37 -0.4 -0.36 0.75 -0.18 -0.86 0.4 0.5
0.06 -0.79 -0.79 -0.28 -0.99 0.89 -0.17 0.34 -0.27 0.8 -0.01 -1.14 0.14 0.43
0.14 -0.42 -0.46 0.25 -0.36 0.42 -0.05 -0.23 -0.02 0.32 0.16 -0.81 0.25 0.25
-0.08 0.21 0.16 -0.22 -0.62 0.84 -0.01 -0.04 0.19 -0.17 -0.92 -0.59 0.1 0.28
-0.11 -0.72 -0.62 0.46 -0.9 1.22 -0.73 -0.1 -0.35 0.4 -0.36 -0.99 0.28 0.55
0.31 -1.29 -0.99 -0.45 -0.76 0.91 -0.2 -0.41 -0.1 0.98 0.19 -1.0 0.22 0.41
0.13 -0.47 -0.02 0.1 -0.83 0.84 -0.33 -0.82 -0.33 0.78 0.04 -0.66 0.11 0.21
0.45 0.07 -0.06 -0.24 -1.34 0.76 -0.35 -1.01 -0.12 0.69 -0.15 -0.92 0.29 0.29
0.39 -1.0 -0.73 -0.55 -0.88 0.82 -0.31 -0.33 -0.19 0.94 0.4 -0.94 0.19 0.29
-0.12 0.19 -0.13 -0.17 -0.74 0.98 -0.28 -0.24 -0.24 0.33 -0.33 -1.09 0.27 0.4
-0.32 -0.05 0.09 -0.38 -0.78 0.84 -0.02 -0.4 0.37 0.23 0.34 -0.96 -0.04 0.09
0.09 -0.76 -0.71 0.17 -0.75 0.35 0.07 -0.09 0.1 0.41 0.05 -0.4 0.37 0.34
0.14 -0.69 -0.63 -0.27 -1.09 0.64 -0.03 0.16 -0.01 0.51 0.41 -1.13 0.22 0.37
0.12 -0.15 -0.25 0.35 -0.98 1.07 -0.7 -1.11 -0.48 0.93 -0.52 -0.92 0.23 0.25
-0.14 -0.59 -0.18 0.03 -0.56 0.97 0.38 -0.05 0.07 0.37 -0.45 -1.23 0.03 0.11
-0.65 -0.12 0.14 -0.43 -1.15 1.49 -0.35 -0.46 0.08 1.07 -0.36 -3.09 -0.41 0.06
-0.05 -0.11 0.14 -0.01 -0.55 1.09 -0.81 -0.99 -0.33 0.73 -0.34 -1.23 0.29 0.31
0.38 -0.12 -0.41 -0.33 -0.99 1.19 -0.26 -0.48 -0.09 0.27 0.33 -1.45 -0.01 0.19
0.24 -0.41 -0.29 0.01 -0.64 0.85 -0.67 -0.96 -0.41 0.7 -0.1 -0.72 0.47 0.43
0.27 -0.37 -0.52 -0.62 -1.85 1.1 -0.18 -0.25 -0.28 0.53 0.78 -0.81 -0.17 0.13
-0.0 -0.57 -0.66 -0.61 -1.16 1.33 0.25 -0.21 0.28 0.24 -0.07 -0.81 -0.02 0.18
HUANGJINYA48138 (NF-YA7)
0.03 -1.03 -0.53 0.23 -0.24 0.78 0.12 -0.22 0.12 0.05 -0.06 -0.61 0.08 0.39
0.14 -0.82 -0.43 -0.35 -0.72 0.77 -0.04 -0.35 -0.07 0.67 -0.0 -1.32 0.4 0.56
HUANGJINYA48723 (TLP18.3)
0.38 -0.32 -0.07 -0.35 -1.11 1.44 -0.45 -0.65 -0.26 0.36 -0.04 -1.15 0.03 0.06
-0.05 -0.68 -0.41 -0.42 -1.22 1.0 0.17 0.22 0.25 0.68 -0.8 -0.5 0.11 0.04
0.21 -0.06 -0.28 0.11 -0.85 0.36 -0.07 -0.28 -0.38 0.43 0.35 -0.11 0.03 0.06
-0.17 -0.33 0.13 -0.17 -0.6 0.95 -0.06 -0.23 0.1 0.35 -0.52 -1.04 0.19 0.33
0.2 -0.36 -0.41 -0.09 -0.88 1.41 -0.18 -0.15 -0.26 0.51 -0.76 -1.46 0.04 0.19
-0.04 -1.19 -0.62 0.08 -0.44 0.79 0.08 0.12 0.26 0.25 -0.04 -0.9 0.22 0.27
0.05 -1.09 -0.64 -0.25 -0.17 0.55 0.41 -0.08 0.16 0.65 -0.04 -0.72 0.06 0.1
-0.11 0.16 0.21 -0.58 -1.02 0.89 0.2 0.09 0.06 -0.1 -0.12 -0.6 -0.05 0.09
-0.19 -0.33 -0.07 -0.31 -1.3 1.35 0.21 -0.02 0.16 0.26 -1.0 -1.52 0.0 0.37
0.48 -0.59 -0.65 -0.3 -2.03 1.2 -0.67 -1.14 -0.49 1.29 -0.29 -0.79 0.2 0.23
HUANGJINYA52404 (CDSP32)
0.52 0.03 -0.1 -0.45 -1.05 1.34 -0.5 -0.52 -0.55 0.68 -0.45 -1.56 0.0 0.14
0.26 -1.07 -0.82 -0.69 -0.79 0.8 0.1 0.09 -0.03 0.3 -0.16 -0.36 0.35 0.61
0.33 -0.57 -0.6 -0.36 -1.09 0.51 -0.21 0.02 -0.2 0.57 0.6 -1.09 0.21 0.44
-0.01 -0.9 0.44 -0.5 -0.39 1.89 -0.74 -1.69 -0.86 -0.22 -1.02 -2.69 0.07 0.95
-0.31 -1.76 0.41 -0.71 -0.07 1.66 -1.72 -1.7 -1.37 0.5 -0.95 -2.46 0.44 1.25
-0.05 -1.35 0.15 -1.26 0.02 2.04 -4.32 -2.63 -2.0 -0.06 -1.28 -3.97 0.61 1.37
0.09 -1.06 -0.58 -1.25 -1.1 1.89 -0.38 0.02 -0.44 -0.21 -2.13 -3.32 0.76 0.84
0.13 -0.19 -0.28 -0.08 -1.08 0.77 -0.53 -0.69 -0.37 0.53 0.29 -0.34 0.28 0.41
0.22 0.42 0.1 -0.21 -1.55 1.04 -0.25 -0.61 -0.25 0.74 -0.7 -1.23 -0.05 0.19
0.31 -0.59 -0.24 -0.35 -1.15 1.08 -0.44 -0.66 -0.45 0.85 0.02 -0.57 0.18 0.25
0.29 0.05 -0.36 -0.43 -0.95 1.2 -0.3 -0.39 -0.24 0.39 -0.2 -0.73 0.1 0.16
-0.01 0.47 0.35 -0.52 -0.96 0.51 -0.05 -0.09 -0.14 0.49 0.0 -1.74 0.07 0.18
0.44 -0.69 -0.26 -0.73 -0.75 0.99 0.08 -0.03 0.07 0.41 -0.27 -1.47 0.18 0.33
0.28 -0.88 -0.51 -0.27 -0.57 0.97 -0.29 -0.39 -0.16 0.54 0.05 -0.72 0.32 0.33
0.23 -0.84 -0.71 -1.08 -0.58 1.34 -0.39 0.05 -0.8 0.29 0.11 -1.81 0.34 0.81
0.3 -1.07 -0.28 -0.84 -0.83 1.16 0.26 0.03 0.24 0.8 -1.05 -2.09 0.23 0.12
0.36 0.79 0.33 -0.63 -2.36 1.04 -0.29 -0.41 -0.11 0.39 -0.24 -1.51 -0.09 -0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.