Heatmap: Cluster_66 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
one leaf and a bud,4-year-old,no treatment
two leaves and a bud,missing,no treatment
leaf,missing,no treatment
second leaf,missing,no treatment
leaf,5-year-old,missing
mature leaf,missing,no treatment
new shoot leaf,missing,no treatment
two leaves and a bud,missing,missing
leaf,10-year-old,no treatment
0.19 0.53 63.82 3.09 33.37 23.39 0.49 3.74 0.41
0.07 0.96 5.44 1.57 2.98 2.29 0.38 2.55 2.96
0.34 0.22 6.27 1.41 3.41 0.0 0.11 1.39 0.37
0.49 1.13 2.87 1.13 1.87 0.99 0.99 0.55 0.26
ZIJUAN01330 (IRX3)
2.84 2.35 10.92 5.62 5.8 4.88 0.27 4.81 4.81
3.08 29.24 87.01 30.08 58.14 40.87 11.68 48.22 35.3
0.0 0.62 10.76 3.97 2.93 5.23 0.0 1.05 1.88
ZIJUAN01922 (ARA12)
0.0 4.0 17.62 0.78 8.39 20.04 6.1 0.53 0.0
ZIJUAN01953 (BW52)
0.0 0.12 0.82 0.25 0.17 0.2 0.28 0.06 0.5
ZIJUAN02061 (XSP1)
0.0 0.07 1.3 0.21 0.34 1.75 0.24 0.54 0.21
13.58 42.77 144.1 85.99 102.62 65.54 91.65 37.75 7.0
0.0 0.1 4.8 0.1 0.92 2.1 0.36 0.42 0.0
ZIJUAN03035 (TBL19)
0.0 0.07 2.43 0.07 1.14 1.86 0.38 0.3 0.03
ZIJUAN03062 (EXO70G1)
0.05 0.29 2.01 0.35 2.13 1.86 0.23 0.87 0.14
0.23 1.47 141.09 6.59 24.33 21.74 4.13 8.87 0.38
0.06 0.31 1.22 0.79 0.54 0.74 0.01 0.23 0.27
0.55 7.06 27.14 15.95 36.93 37.1 4.18 4.95 3.93
ZIJUAN04326 (LEW2)
1.63 3.35 11.77 5.48 5.56 5.62 0.22 5.09 4.11
2.15 1.07 11.3 4.13 3.34 3.19 0.06 2.83 4.25
0.7 0.54 2.97 2.45 5.8 5.82 0.13 0.74 0.09
0.23 0.04 2.08 1.1 2.82 4.12 0.06 0.0 0.03
ZIJUAN06137 (IRX9)
0.15 0.49 3.58 1.94 1.86 1.45 0.11 1.14 1.16
0.0 0.17 1.88 0.11 0.9 1.77 0.67 0.6 0.03
ZIJUAN06347 (GUT2)
1.29 0.37 3.97 0.85 1.14 0.79 0.26 0.75 2.41
1.72 5.06 35.13 25.55 16.39 15.28 0.65 10.67 18.49
ZIJUAN06884 (CIP7)
2.94 4.22 30.64 5.3 21.47 20.88 6.24 16.81 10.24
0.14 0.53 1.64 0.36 0.92 0.46 0.0 0.78 0.04
0.13 0.06 1.12 0.36 1.04 0.64 0.24 0.62 0.15
3.68 2.77 36.77 11.8 21.03 29.24 2.77 8.12 13.45
ZIJUAN08503 (PHO1;H1)
0.12 0.59 2.97 0.76 0.85 0.64 1.04 0.56 0.54
ZIJUAN09556 (SPX3)
0.53 1.8 9.47 4.22 6.01 1.03 2.03 3.58 1.46
ZIJUAN09857 (MYB103)
0.0 0.0 1.48 0.02 0.26 0.27 0.06 0.03 0.1
ZIJUAN10128 (OFP1)
0.0 0.48 1.45 0.27 1.45 0.65 0.22 0.74 0.55
0.0 0.07 0.61 0.03 0.55 1.75 0.78 0.08 0.0
ZIJUAN11399 (IQD10)
1.51 2.74 16.5 6.36 8.83 7.41 0.7 6.21 6.96
0.0 0.09 0.85 0.14 0.93 1.14 0.26 0.11 0.0
0.14 0.16 0.63 0.41 0.58 0.56 0.08 0.19 0.29
ZIJUAN13240 (BAG4)
0.37 1.31 4.73 1.49 2.72 2.45 0.12 1.6 2.64
ZIJUAN14320 (XTH10)
0.0 0.05 1.41 0.1 0.28 0.54 0.21 0.12 0.06
ZIJUAN14493 (AHP4)
0.07 0.4 1.04 0.07 0.08 0.21 0.0 0.11 0.39
3.54 4.26 25.85 4.97 12.84 23.0 3.03 6.48 4.78
ZIJUAN15790 (LAC17)
3.67 0.82 5.14 1.54 2.47 2.04 0.01 1.34 2.26
0.11 2.14 3.8 0.81 3.41 5.98 1.12 0.8 1.65
0.0 0.08 1.49 0.03 0.13 0.1 0.0 0.1 0.54
ZIJUAN15899 (MYB103)
0.0 0.0 2.75 0.04 0.33 0.91 0.1 0.4 1.95
ZIJUAN16319 (EXO70G1)
0.0 0.16 1.6 0.31 1.56 1.35 0.03 0.71 0.25
0.57 0.82 1.96 2.23 0.43 0.23 0.35 0.44 0.11
0.55 2.02 10.54 2.87 4.87 3.61 2.22 7.38 3.5
ZIJUAN17313 (LAC4)
1.54 0.53 13.37 1.19 1.99 2.91 0.11 1.22 4.3
0.32 0.86 3.49 1.1 1.53 0.42 0.0 2.84 0.69
ZIJUAN18170 (ULI3)
0.04 0.14 0.97 0.17 0.26 0.15 0.0 0.81 0.05
1.23 0.18 2.22 0.82 1.32 1.19 0.0 0.52 0.62
ZIJUAN19182 (BGLU11)
0.0 0.16 0.48 0.2 0.39 0.56 0.12 0.18 0.1
0.13 0.37 3.69 0.16 1.43 0.1 0.0 0.34 0.4
0.0 0.21 2.86 0.06 0.93 0.29 0.37 0.29 0.13
ZIJUAN19747 (CAH1)
0.17 0.32 8.11 0.67 1.82 2.7 0.46 0.75 0.33
ZIJUAN19748 (CAH1)
0.0 0.31 7.32 0.58 1.07 2.41 0.13 1.08 0.23
0.33 1.35 6.89 2.02 4.39 2.48 0.95 1.68 1.31
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
ZIJUAN20149 (TBL33)
1.8 1.75 9.28 3.64 5.36 3.38 0.2 3.52 2.07
ZIJUAN20239 (SPX3)
0.0 0.22 12.98 0.29 2.19 0.0 0.61 0.58 0.0
ZIJUAN20240 (SPX3)
0.0 0.16 4.67 0.0 0.61 0.0 0.0 1.52 0.0
ZIJUAN20241 (SPX3)
0.0 3.34 40.5 1.3 7.99 0.09 1.29 4.16 0.55
ZIJUAN20243 (SPX3)
0.0 0.0 2.84 0.21 1.29 0.0 0.49 0.2 0.32
ZIJUAN20545 (STP1)
12.3 33.95 92.15 60.23 56.82 43.26 4.21 18.08 18.2
1.25 2.11 20.25 3.04 8.13 4.99 2.98 11.81 6.76
ZIJUAN20626 (BMY8)
9.27 21.76 87.81 47.68 59.17 60.54 42.32 3.6 5.15
ZIJUAN20946 (PRR1)
0.52 0.2 4.19 0.85 0.37 0.94 1.1 0.42 1.61
ZIJUAN21604 (IRX6)
1.39 2.91 10.52 1.82 3.78 5.25 0.88 3.12 2.75
0.01 0.54 3.0 2.71 5.19 7.11 0.15 1.48 0.03
0.0 0.21 1.33 0.25 1.1 0.74 0.0 0.77 0.11
0.0 0.0 0.58 0.18 0.11 0.92 0.0 0.08 0.28
ZIJUAN22319 (PAP17)
0.52 4.1 31.82 7.47 21.87 0.18 0.93 13.65 2.2
0.19 0.43 4.63 0.17 0.23 1.01 0.24 1.59 0.86
ZIJUAN22375 (LGT6)
1.99 1.48 6.87 2.56 2.85 2.72 0.95 2.63 2.96
2.6 3.68 8.36 3.66 4.62 5.53 0.6 1.35 0.77
ZIJUAN22814 (XTH32)
0.11 0.44 2.82 0.25 0.33 0.51 0.25 0.18 0.06
ZIJUAN23427 (RLP22)
0.0 0.0 0.51 0.11 0.05 0.0 0.11 0.09 0.21
0.98 2.37 4.18 1.89 3.59 2.87 0.27 1.5 1.67
ZIJUAN24387 (CTL2)
12.06 16.18 60.25 45.3 31.86 34.57 1.75 22.61 28.9
3.73 5.52 12.35 7.97 11.04 15.05 6.57 6.62 6.41
1.88 5.99 54.19 7.2 40.03 1.93 1.39 12.87 0.23
0.52 2.71 4.83 3.32 5.16 3.89 0.61 2.14 1.94
ZIJUAN25474 (ROP7)
0.0 1.25 6.19 2.01 4.5 4.24 0.92 2.15 1.34
ZIJUAN27019 (PGM3)
4.96 21.6 45.95 17.68 34.19 21.14 15.32 19.77 23.1
ZIJUAN27389 (SRG3)
4.12 11.61 121.54 11.81 57.69 2.23 9.19 66.98 6.8
0.0 0.11 2.44 0.71 1.71 1.75 0.07 1.29 1.09
0.2 2.96 11.01 2.15 7.14 10.21 1.42 4.18 0.0
0.07 0.03 1.29 0.21 0.67 0.6 0.0 0.83 0.19
ZIJUAN29474 (TBL3)
0.19 0.43 2.7 1.22 1.32 0.74 0.01 0.62 0.64
0.09 0.06 2.11 0.4 1.18 1.11 0.7 0.18 0.09
ZIJUAN31955 (SQD2)
8.1 11.41 27.93 12.8 18.16 11.87 11.64 15.37 15.79
1.23 0.57 2.79 0.99 0.66 0.75 0.84 0.27 0.69
0.95 1.82 5.34 1.43 1.75 2.35 2.02 0.88 0.99
0.28 0.0 1.0 0.2 0.7 0.77 0.0 0.39 0.15
0.0 0.0 0.96 0.22 0.28 0.45 0.0 0.07 0.0
0.0 0.2 2.38 0.25 1.33 2.63 0.06 0.13 0.12
0.22 0.51 1.94 0.63 1.04 1.09 0.28 0.78 0.37
ZIJUAN35828 (NST1)
1.02 0.14 4.11 0.64 2.17 1.55 1.12 0.69 0.51
0.0 2.54 27.38 4.42 12.82 22.93 2.03 14.26 1.92
ZIJUAN36427 (LAC17)
0.49 0.89 2.4 1.33 2.21 1.75 0.12 0.34 0.34
ZIJUAN36428 (LAC17)
6.03 1.82 13.25 9.92 7.66 6.94 0.11 4.55 4.31
ZIJUAN36508 (XTH16)
13.24 52.0 156.43 62.51 48.1 34.16 6.25 42.22 40.79
ZIJUAN37021 (MRH1)
5.42 2.09 9.98 6.42 5.92 4.64 0.12 3.76 5.15
0.05 0.6 3.8 0.41 0.87 1.1 0.36 1.18 0.44
0.0 1.26 4.64 0.36 0.71 1.92 0.52 1.99 0.73
0.41 0.73 5.68 1.95 1.47 1.92 0.06 1.59 1.92
4.76 8.8 14.38 2.91 7.26 15.21 10.77 4.71 3.56
3.0 28.73 131.39 35.69 128.0 109.16 29.84 34.63 36.24
0.0 0.13 1.52 0.18 0.41 0.47 0.0 1.71 0.32
ZIJUAN40338 (SPX3)
1.16 9.63 40.41 6.93 22.37 2.96 6.4 15.8 6.0
ZIJUAN42212 (IRX9)
0.33 0.52 2.28 1.13 1.18 1.03 0.04 0.98 1.14
17.95 0.04 20.9 10.21 14.16 12.3 0.4 3.89 2.79
11.97 2.5 24.01 12.91 20.24 12.82 0.03 6.29 5.73
0.0 0.74 4.27 0.93 2.19 6.57 2.08 1.69 0.29
0.2 132.52 844.08 60.38 265.57 529.01 110.47 450.19 2.74
ZIJUAN43853 (LAC4)
12.26 3.96 29.66 11.76 10.31 11.66 0.56 8.15 11.78
ZIJUAN44039 (XTH7)
0.16 8.22 422.56 20.37 235.85 221.65 0.87 39.42 0.83
0.12 0.6 3.49 0.69 0.7 0.75 0.0 0.2 0.25
ZIJUAN45238 (GLZ1)
1.19 0.06 1.82 0.25 0.21 0.49 0.0 0.05 0.34
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
ZIJUAN45799 (LAC12)
0.51 3.88 19.46 8.07 12.68 11.91 0.13 9.21 6.74
ZIJUAN45818 (PAP17)
0.46 3.88 62.25 10.23 43.13 0.47 1.55 17.56 3.82
0.24 0.36 3.23 0.13 0.54 1.39 0.22 0.95 0.49
0.11 0.23 5.34 1.44 3.19 0.0 0.2 1.58 0.3
0.0 0.0 2.27 0.84 2.89 0.0 0.42 0.72 0.13
0.15 10.82 50.33 25.73 29.67 67.19 0.69 0.32 6.53
0.0 0.09 1.93 0.64 2.67 2.46 0.0 0.37 0.12
1.36 16.23 102.4 22.82 47.27 4.46 6.39 18.43 2.49
0.69 0.65 2.76 1.17 1.26 1.25 0.26 0.77 1.13
0.0 0.47 1.43 0.85 1.03 0.56 0.04 0.54 0.53
5.5 26.58 50.6 21.63 47.61 62.79 11.26 14.95 16.62
0.22 0.47 5.52 2.74 7.38 9.45 0.94 1.56 0.28
ZIJUAN47325 (ARA12)
0.0 0.7 3.72 0.32 1.8 2.25 0.38 0.08 0.0
ZIJUAN47326 (SBT1.3)
0.0 0.74 5.45 0.2 2.67 3.02 0.76 0.15 0.0
ZIJUAN48022 (TBL3)
0.47 1.24 3.72 1.58 1.75 1.47 0.0 1.18 1.66
0.12 0.4 4.39 2.54 6.72 7.87 0.49 1.58 2.29
ZIJUAN49400 (PPCK1)
2.83 6.8 26.55 6.97 12.71 10.9 1.57 10.88 6.65
ZIJUAN49402 (NWS2)
6.37 3.4 18.39 9.13 8.37 9.93 1.36 6.37 8.27
ZIJUAN49689 (FPF1)
0.0 0.54 3.57 0.73 1.88 0.49 0.79 0.32 0.0
0.0 7.77 27.53 5.82 28.71 44.63 5.5 0.05 0.0
0.0 0.37 3.05 0.67 1.52 0.04 0.0 2.33 1.06
2.77 3.85 30.82 9.29 17.11 11.38 2.99 5.69 6.34
ZIJUAN51525 (MYB61)
4.02 1.5 11.19 2.22 5.31 3.37 0.04 3.56 6.23
3.32 7.63 19.57 11.68 15.96 25.36 5.14 3.29 10.98
ZIJUAN52712 (ARA12)
0.09 1.03 4.21 0.28 2.24 2.3 0.14 1.03 0.3
0.19 1.25 6.85 0.82 3.03 3.46 1.3 4.02 0.67
ZIJUAN53704 (PAP17)
1.61 9.8 64.05 13.99 40.25 0.63 4.05 49.98 7.1
7.47 0.92 10.57 2.41 4.59 3.66 0.14 2.54 2.88
0.8 0.43 19.59 4.11 18.85 23.2 0.53 3.44 1.16
0.0 3.87 13.75 4.56 3.59 1.29 5.66 6.06 1.24
ZIJUAN56382 (MGD2)
1.58 4.3 24.69 4.67 12.54 2.42 1.63 8.34 3.42
0.55 0.91 3.03 0.85 1.78 1.76 0.66 2.24 0.57
0.63 1.63 25.46 1.14 6.19 4.62 0.03 1.95 3.27
ZIJUAN59021 (RLP6)
0.0 0.49 2.04 0.43 1.11 2.59 1.07 0.17 0.13
ZIJUAN59023 (RLP6)
0.18 0.51 1.18 0.25 0.43 1.87 0.04 0.12 0.33

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)