Heatmap: Cluster_498 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	2 leaves and a bud,no treatment	2 leaves and a bud,MeJA for 12h	2 leaves and a bud,MeJA for 24h	2 leaves and a bud,MeJA for 48h	fourth leaf,10-year-old,no treatment	fourth leaf,10-year-old,shading treatment	leaf,2-year-old,leafhopper-infested	leaf,2-year-old,mechanical damaged	leaf,2-year-old,undamaged	stem regenerated root,no treatment	stem callus,no treatment	stem primary callus,no treatment	leaf callus,no treatment	leaf primary callus,no treatment	stem,no treatment	leaf,no treatment	stem regenerated shoot,no treatment	3 leaves,a bud,missing,leafhopper-infested(48 h)	3 leaves,a bud,missing	leaf,10-year-old,missing
JINXUAN00132	0.58	0.2	0.2	0.47	0.29	0.26	0.38	0.59	0.45	0.38	0.49	0.27	1.0	0.52	0.24	0.34	0.45	0.9	0.74	0.19
JINXUAN01185 (FHY3)	0.72	0.83	0.93	0.53	0.72	0.64	0.66	0.68	0.66	0.88	0.56	0.87	0.94	0.66	0.83	0.98	0.85	1.0	0.84	0.5
JINXUAN01396 (PHYC)	0.76	0.73	0.8	0.38	0.52	0.4	0.43	0.46	0.41	0.75	0.54	0.77	0.82	0.67	0.94	1.0	0.81	0.61	0.51	0.5
JINXUAN01611	0.58	0.59	0.83	0.8	0.4	0.29	0.51	0.6	0.62	0.93	0.57	0.66	0.88	0.53	0.8	0.69	1.0	0.73	0.82	0.19
JINXUAN01666 (ACO3)	0.15	0.38	0.39	0.2	0.13	0.09	0.4	0.29	0.28	0.52	0.2	0.31	0.51	0.48	0.64	1.0	0.57	0.35	0.24	0.13
JINXUAN02015	0.78	0.78	0.89	0.53	0.78	0.76	0.6	0.65	0.62	0.79	0.53	0.65	1.0	0.63	0.93	1.0	0.68	0.74	0.68	0.33
JINXUAN02017 (RLP6)	0.17	0.29	0.38	0.02	0.09	0.14	0.18	0.18	0.09	0.57	0.02	0.24	1.0	0.19	0.73	0.98	0.43	0.12	0.2	0.04
JINXUAN02042	0.31	0.46	0.54	0.23	0.14	0.11	0.33	0.31	0.26	0.91	0.14	0.52	0.76	0.37	0.9	1.0	0.6	0.26	0.36	0.1
JINXUAN02152	0.44	0.5	0.51	0.6	0.72	0.75	0.59	0.59	0.54	0.92	0.52	0.71	0.75	0.72	0.88	0.81	1.0	0.77	0.7	0.51
JINXUAN05789 (RR1)	0.75	0.82	0.83	0.58	0.77	0.67	0.48	0.5	0.47	0.76	0.61	0.89	0.9	0.82	0.8	1.0	0.81	0.88	0.59	0.56
JINXUAN06447	0.66	0.59	0.6	0.27	0.59	0.6	0.55	0.67	0.6	0.85	0.45	0.7	0.98	0.5	0.8	1.0	0.7	0.68	0.68	0.32
JINXUAN06593 (AtATG18a)	0.65	0.56	0.67	0.72	0.61	0.49	0.5	0.56	0.53	0.76	0.5	0.62	1.0	0.64	0.74	0.82	0.92	0.8	0.71	0.22
JINXUAN08896	0.67	0.38	0.35	0.67	0.54	0.57	0.52	0.48	0.4	0.58	0.54	0.57	0.84	0.57	0.51	0.62	1.0	0.46	0.41	0.29
JINXUAN12070	0.33	0.41	0.36	0.3	0.4	0.61	0.4	0.46	0.42	1.0	0.35	0.66	0.76	0.44	0.87	0.44	0.82	0.22	0.26	0.34
JINXUAN13037 (FC1)	0.62	0.58	0.6	0.81	0.6	0.47	0.5	0.51	0.51	0.73	0.48	0.57	0.63	0.61	0.74	0.64	1.0	0.63	0.57	0.39
JINXUAN13373	0.74	0.74	0.71	0.6	0.67	0.66	0.64	0.66	0.64	0.93	0.54	0.78	1.0	0.85	0.88	0.86	0.95	0.89	0.74	0.4
JINXUAN15152	0.61	0.5	0.46	0.4	0.63	0.57	0.52	0.61	0.55	0.78	0.42	0.58	1.0	0.38	0.9	0.95	0.76	0.52	0.52	0.3
JINXUAN15614 (GTE4)	0.64	0.73	0.69	0.54	0.53	0.47	0.47	0.54	0.53	0.68	0.46	0.63	0.87	0.52	0.71	1.0	0.62	0.63	0.57	0.36
JINXUAN16888	0.56	0.64	0.6	0.52	0.78	0.75	0.66	0.67	0.64	0.92	0.59	0.85	0.83	0.75	0.92	0.81	1.0	0.73	0.63	0.59
JINXUAN17079	0.51	0.57	0.48	0.68	0.54	0.51	0.55	0.55	0.54	0.85	0.45	0.58	0.85	0.52	0.65	0.71	1.0	0.46	0.48	0.2
JINXUAN18418 (CARB)	0.66	0.7	0.73	0.37	0.39	0.38	0.37	0.42	0.47	0.97	0.49	0.73	1.0	0.66	0.85	0.84	0.8	0.75	0.74	0.61
JINXUAN18974	0.45	0.58	0.65	0.45	0.67	0.42	0.5	0.59	0.53	0.73	0.49	0.5	0.96	0.52	0.29	0.49	0.81	1.0	0.65	0.29
JINXUAN21453 (ftsh4)	0.81	0.81	0.95	0.51	0.57	0.41	0.61	0.72	0.7	1.0	0.61	0.78	0.93	0.67	0.94	0.98	0.94	0.9	0.8	0.48
JINXUAN27355	0.15	0.16	0.05	0.08	0.05	0.07	0.06	0.03	0.04	0.1	0.22	0.39	1.0	0.05	0.0	0.17	0.06	0.03	0.15	0.0
JINXUAN30174	0.64	0.12	0.28	0.12	0.17	0.23	0.14	0.14	0.19	0.24	0.35	0.49	1.0	0.29	0.13	0.26	0.31	0.3	0.37	0.19
JINXUAN30192	0.74	0.12	0.25	0.21	0.12	0.17	0.12	0.2	0.13	0.34	0.34	0.41	1.0	0.41	0.16	0.21	0.43	0.37	0.2	0.11
JINXUAN30193	0.76	0.08	0.16	0.18	0.23	0.27	0.18	0.2	0.22	0.27	0.53	0.66	1.0	0.47	0.34	0.28	0.38	0.46	0.46	0.28
JINXUAN30308	0.46	0.04	0.25	0.22	0.15	0.23	0.1	0.17	0.07	0.27	0.61	0.6	1.0	0.28	0.24	0.17	0.54	0.41	0.41	0.24
JINXUAN31744	0.31	0.24	0.27	0.19	0.39	0.51	0.38	0.54	0.46	1.0	0.15	0.42	0.98	0.27	0.8	0.72	0.93	0.24	0.17	0.03
JINXUAN31753	0.18	0.28	0.2	0.15	0.22	0.31	0.42	0.44	0.44	0.87	0.13	0.51	0.99	0.29	0.96	0.74	1.0	0.23	0.18	0.05
JINXUAN33046 (RIN4)	0.53	0.54	0.43	0.6	0.77	0.5	0.42	0.33	0.31	0.69	0.44	0.62	1.0	0.46	0.49	0.76	0.87	0.89	0.54	0.56
JINXUAN33111	0.86	0.57	0.6	0.44	0.69	0.72	0.6	0.62	0.63	0.9	0.61	0.84	0.95	0.79	0.99	0.89	0.95	1.0	0.76	0.51
JINXUAN33528	0.23	0.12	0.15	0.0	0.0	0.03	0.14	0.16	0.09	0.13	0.18	0.17	1.0	0.15	0.13	0.13	0.24	0.23	0.38	0.07
JINXUAN33648	0.62	0.47	0.36	0.71	0.55	0.57	0.58	0.65	0.56	0.63	0.58	0.54	1.0	0.63	0.54	0.44	0.7	0.87	0.74	0.3
JINXUAN34128	1.0	0.75	0.87	0.85	0.67	0.63	0.6	0.58	0.56	0.82	0.62	0.74	0.92	0.79	0.81	0.77	0.82	0.9	0.78	0.44
JINXUAN34542 (FBP7)	0.47	0.56	0.61	0.72	0.69	0.6	0.63	0.65	0.6	1.0	0.48	0.74	0.98	0.69	0.88	0.8	0.97	0.67	0.63	0.22
JINXUAN34590	0.36	0.14	0.12	0.43	0.24	0.25	0.58	0.3	0.29	0.39	0.33	0.36	1.0	0.31	0.18	0.53	0.58	0.98	0.36	0.1
JINXUAN34655	0.66	0.41	0.6	0.38	0.32	0.47	0.55	0.57	0.56	0.84	0.28	0.39	1.0	0.37	0.82	0.63	0.77	0.73	0.7	0.18
JINXUAN36315	0.69	0.63	0.68	0.56	0.45	0.38	0.53	0.63	0.61	0.73	0.52	0.58	1.0	0.47	0.75	0.91	0.83	0.79	0.69	0.25
JINXUAN37331	0.0	0.04	0.0	0.0	0.05	0.04	0.06	0.0	0.0	0.0	0.31	0.36	1.0	0.05	0.0	0.12	0.14	0.11	0.0	0.11
JINXUAN37756	0.68	0.35	0.3	0.58	0.36	0.38	0.25	0.23	0.24	1.0	0.31	0.65	0.97	0.58	0.86	0.76	0.45	0.65	0.38	0.28
JINXUAN39243	0.91	0.74	0.84	0.84	0.76	0.68	0.71	0.74	0.65	0.76	0.66	0.78	0.88	0.82	0.85	0.94	1.0	0.85	0.73	0.44
JINXUAN39995	0.56	0.56	0.47	0.57	0.71	0.63	0.42	0.43	0.4	0.6	0.43	0.58	1.0	0.43	0.74	0.84	0.8	0.62	0.65	0.27
JINXUAN40697	0.41	0.08	0.15	0.27	0.04	0.07	0.11	0.03	0.06	0.11	0.14	0.31	1.0	0.14	0.03	0.14	0.19	0.48	0.4	0.14
JINXUAN40890	0.26	0.06	0.1	0.03	0.27	0.21	0.25	0.17	0.25	0.14	0.12	0.41	1.0	0.19	0.09	0.15	0.44	0.57	0.42	0.05
JINXUAN41381	0.47	0.5	0.43	0.56	0.47	0.42	0.51	0.55	0.52	0.62	0.47	0.61	1.0	0.5	0.49	0.73	0.75	0.84	0.65	0.29
JINXUAN42032	0.69	0.75	0.66	0.58	0.75	0.7	0.49	0.45	0.46	0.87	0.41	0.84	1.0	0.62	0.96	0.88	0.8	0.9	0.73	0.61
JINXUAN43269	0.79	0.89	0.96	0.81	0.49	0.5	0.59	0.47	0.45	0.99	0.74	0.68	1.0	0.71	0.87	0.94	0.96	0.92	0.75	0.41
JINXUAN44215	0.77	0.68	0.75	0.48	0.58	0.49	0.49	0.46	0.47	0.88	0.61	0.71	0.89	0.79	1.0	0.86	0.75	0.76	0.61	0.58
JINXUAN45498 (FRI)	1.0	0.77	0.84	0.76	0.76	0.65	0.63	0.67	0.65	0.67	0.64	0.76	0.89	0.72	0.74	0.84	0.82	0.84	0.69	0.57
JINXUAN45824	0.53	0.5	0.45	0.54	0.71	0.65	0.67	0.58	0.55	0.85	0.48	0.61	1.0	0.61	0.86	0.87	0.81	0.8	0.62	0.36
JINXUAN46145	0.3	0.37	0.44	0.42	0.21	0.13	0.19	0.26	0.24	0.37	0.12	0.26	0.56	0.33	0.46	1.0	0.62	0.5	0.31	0.11
JINXUAN48674 (SYN4)	0.69	0.67	0.7	0.31	0.6	0.63	0.5	0.51	0.5	0.8	0.54	0.82	0.86	0.66	0.81	1.0	0.83	1.0	0.75	0.62
JINXUAN53164 (HY8)	0.47	0.57	0.63	0.2	0.28	0.28	0.15	0.17	0.16	0.86	0.39	0.66	0.92	0.45	1.0	0.93	0.67	0.46	0.58	0.39
JINXUAN53658	0.75	0.7	0.71	0.61	0.58	0.45	0.72	0.69	0.61	0.84	0.67	0.74	0.96	0.68	0.58	0.87	1.0	0.85	0.51	0.32
JINXUAN55134	0.03	0.0	0.0	0.05	0.23	0.18	0.08	0.06	0.09	0.24	0.22	0.47	1.0	0.27	0.09	0.04	0.23	0.38	0.39	0.17
JINXUAN59013 (SPL1)	0.95	0.91	0.79	0.67	0.56	0.6	0.51	0.51	0.43	0.71	0.57	0.67	1.0	0.55	0.66	0.78	0.68	0.76	0.74	0.43
JINXUAN63498	0.51	0.66	0.66	0.5	0.65	0.46	0.38	0.29	0.2	0.78	0.2	0.5	0.97	0.33	0.56	0.92	1.0	0.8	0.55	0.11
JINXUAN63682 (STP1)	0.57	0.32	0.22	0.59	0.13	0.1	0.51	0.45	0.32	0.47	0.3	0.33	1.0	0.2	0.19	0.42	0.7	0.64	0.34	0.07
JINXUAN63684 (STP1)	0.48	0.26	0.18	0.48	0.18	0.14	0.46	0.39	0.26	0.47	0.29	0.31	1.0	0.15	0.1	0.32	0.6	0.95	0.57	0.04
JINXUAN63766	0.83	0.81	0.9	1.0	0.79	0.85	0.72	0.7	0.72	0.9	0.56	0.74	0.92	0.83	0.94	1.0	0.88	0.96	0.8	0.42
JINXUAN65869	0.78	0.36	0.24	0.8	0.51	0.54	0.39	0.31	0.34	0.75	0.43	0.66	1.0	0.45	0.7	0.56	0.4	0.64	0.67	0.26
JINXUAN65956 (FRS3)	0.6	0.62	0.64	0.32	0.5	0.46	0.5	0.53	0.51	0.73	0.46	0.66	0.69	0.57	0.87	1.0	0.67	0.65	0.53	0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)