Heatmap: Cluster_523 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	mature pollen tube,missing,control	mature pollen tube,missing,low-temp treatment	mature pollen tube,missing,NO treatment	leaf,2-year-old,no treatment	leaf,2-year-old,heat stress 2h	leaf,2-year-old,heat stress 12h	leaf,2-year-old,heat stress 6h	leaf,2-year-old,heat stress 24h	leaf,2-year-old,drought stress 2h	leaf,2-year-old,drought stress 12h	leaf,2-year-old,drought stress 24h	leaf,2-year-old,drought stress 48h	first and second leaves,no treatment	first and second leaves,treated 16 mg/L F	leaf,missing,no treatment	leaf,5-year-old,no treatment	leaf,missing,PEG treatment
LJCHANGYE00079	-4.38	-5.23	-7.61	0.13	0.04	-0.4	-0.23	-0.12	0.02	0.42	0.74	0.42	0.54	0.5	0.55	0.32	0.42
LJCHANGYE02879 (CPZ)	-7.92	-10.58	-7.91	0.46	0.22	-0.67	-0.11	-0.94	0.41	0.77	0.17	0.67	0.37	0.05	0.73	0.11	0.63
LJCHANGYE03529 (SR45)	-3.1	-2.99	-3.27	0.58	0.78	0.36	0.45	-0.24	0.01	0.03	0.06	0.19	0.33	0.05	0.38	-0.06	0.26
LJCHANGYE03648 (EBS)	-8.9	-	-	0.4	-0.12	0.16	-0.04	-0.9	0.33	0.3	0.5	0.23	0.68	0.35	0.61	0.38	0.42
LJCHANGYE04041	-7.06	-5.73	-5.84	0.6	0.39	-0.18	0.2	-0.13	0.18	0.09	0.39	0.19	0.58	0.26	0.55	0.07	0.42
LJCHANGYE05120	-3.5	-3.41	-3.51	0.03	-0.1	0.08	0.15	-0.12	0.41	0.04	0.35	0.35	0.42	0.44	0.52	0.29	0.53
LJCHANGYE05877 (CPR30)	-3.31	-3.33	-3.55	0.47	0.47	0.19	0.35	-0.22	0.38	0.44	0.53	0.4	0.03	0.13	0.42	-0.35	0.04
LJCHANGYE06129	-5.04	-5.0	-5.77	0.38	0.24	0.33	0.21	-0.34	0.36	0.51	0.74	0.5	0.38	0.29	0.24	-0.65	0.12
LJCHANGYE06366 (EIF3A)	-3.65	-3.3	-3.72	0.67	0.78	0.51	0.37	-0.31	0.25	0.39	0.31	0.32	0.1	0.14	0.13	-0.34	-0.21
LJCHANGYE06367 (EIF3A)	-3.81	-3.87	-4.23	0.56	0.57	0.41	0.44	-0.36	0.2	0.22	0.25	0.31	0.03	0.06	0.36	-0.05	0.39
LJCHANGYE06690 (PVA12)	-3.57	-3.34	-3.66	0.18	0.07	-0.36	-0.31	-1.02	0.69	0.45	0.54	0.44	0.13	0.23	0.79	0.3	0.55
LJCHANGYE06917 (PHT3;1)	-5.57	-4.73	-5.58	0.34	0.14	-0.08	0.5	-0.6	0.58	0.3	0.49	0.78	-0.06	0.17	0.24	0.28	0.27
LJCHANGYE08376	-	-9.56	-	-0.37	0.33	0.55	0.14	-0.0	0.09	0.62	0.32	0.4	0.24	-0.15	0.43	0.7	0.24
LJCHANGYE09811 (SK 11)	-3.46	-3.68	-3.41	0.2	0.18	0.17	0.08	-0.89	0.31	0.4	0.47	0.41	0.33	0.3	0.64	0.06	0.46
LJCHANGYE09826	-6.81	-	-6.72	0.44	0.21	0.67	0.09	-0.8	0.35	0.34	0.45	0.39	0.41	0.17	0.48	0.15	0.07
LJCHANGYE09859	-	-4.47	-4.18	0.82	-0.66	-1.01	-0.2	-0.2	0.4	0.38	0.77	-0.29	0.37	0.7	0.51	0.1	0.77
LJCHANGYE11835	-8.57	-8.77	-8.57	0.51	0.45	-0.03	0.4	-0.26	0.34	0.29	0.63	0.75	0.29	0.35	0.26	-0.53	-0.07
LJCHANGYE12460 (LIS)	-7.52	-8.09	-7.26	0.61	0.37	0.12	0.0	-0.79	0.25	0.27	0.39	0.66	0.43	0.06	0.53	0.02	0.44
LJCHANGYE12889 (LINC2)	-2.83	-3.16	-3.05	0.28	-0.39	-0.08	-0.69	1.01	0.31	0.26	0.6	0.36	0.41	0.06	0.45	-0.34	0.39
LJCHANGYE14394	-4.47	-4.26	-4.38	0.27	0.38	0.32	0.4	-0.06	0.02	0.19	0.35	0.12	0.46	0.49	0.48	0.09	0.09
LJCHANGYE14737 (NUDX14)	-2.56	-2.27	-2.94	0.25	0.09	0.35	0.27	0.03	0.25	0.01	0.44	0.07	0.36	0.18	0.43	0.17	0.34
LJCHANGYE15965	-7.51	-7.11	-9.36	0.38	0.22	-0.22	0.05	0.36	0.48	0.44	0.5	0.32	0.2	0.46	0.25	-0.07	0.34
LJCHANGYE16117	-6.74	-6.05	-7.16	0.15	0.12	0.4	0.03	0.58	0.31	0.45	0.39	0.46	0.43	0.12	0.52	-0.71	0.22
LJCHANGYE16550 (TSA1)	-7.19	-8.22	-7.97	0.26	0.21	-0.06	0.18	-0.17	0.65	0.56	0.23	0.68	0.08	0.21	0.27	0.26	0.29
LJCHANGYE16620 (PKP1)	-4.71	-4.39	-4.95	0.31	0.61	0.24	0.68	-0.4	0.21	0.41	0.42	0.6	0.18	0.37	0.18	-0.36	-0.14
LJCHANGYE17824 (RS41)	-4.9	-5.37	-5.06	0.27	0.46	0.11	0.1	-0.24	0.39	0.24	0.04	0.13	0.4	0.29	0.45	0.53	0.44
LJCHANGYE18468 (CSN6A)	-2.92	-2.76	-2.58	0.38	0.5	0.08	-0.07	0.05	0.1	-0.07	0.12	0.15	0.62	0.33	0.36	0.51	0.11
LJCHANGYE18527	-2.71	-2.4	-2.94	0.46	0.58	-0.01	0.24	-0.19	0.06	-0.11	-0.06	-0.06	0.53	0.41	0.49	0.22	0.45
LJCHANGYE19154	-4.85	-4.95	-5.04	0.47	0.63	-0.08	0.08	-0.32	0.41	0.6	0.36	0.37	0.32	0.39	0.5	-0.54	0.12
LJCHANGYE20068 (EMB1691)	-3.72	-3.31	-3.77	0.66	0.05	-0.51	-0.21	-1.43	0.54	0.29	0.42	0.46	0.36	0.28	0.7	0.17	0.64
LJCHANGYE21259 (AL1)	-3.03	-2.81	-3.0	0.33	0.36	0.14	-0.06	-0.39	0.1	0.29	0.55	0.36	0.47	0.25	0.38	0.27	0.18
LJCHANGYE21732	-5.2	-5.47	-5.74	0.41	0.43	0.14	0.02	-0.13	0.45	0.4	0.04	0.16	0.3	0.22	0.38	0.38	0.48
LJCHANGYE21745 (MBD11)	-4.22	-4.35	-4.31	0.62	0.11	0.13	0.43	0.01	0.31	0.27	0.73	0.28	0.29	-0.02	0.39	-0.65	0.39
LJCHANGYE23203 (TPL)	-2.73	-2.54	-2.86	0.25	-0.46	-0.31	0.01	0.14	0.29	0.56	0.42	0.13	0.4	0.39	0.37	-0.03	0.73
LJCHANGYE23474	-1.37	-1.35	-1.42	0.28	0.46	0.41	0.01	-0.31	0.07	0.22	0.23	-0.04	0.38	0.18	0.41	-0.15	0.13
LJCHANGYE23523 (DRD2)	-7.1	-6.57	-7.34	0.6	0.18	-0.08	0.06	-1.04	0.37	0.7	0.6	0.58	0.32	0.05	0.65	-0.22	0.28
LJCHANGYE23848 (RPT6A)	-4.06	-4.66	-4.29	0.2	-0.02	-0.16	-0.23	-0.51	0.26	0.25	0.71	0.64	0.4	0.41	0.57	0.35	0.35
LJCHANGYE24165	-2.56	-2.39	-2.6	0.28	0.03	0.04	0.39	-1.41	0.3	0.28	0.12	0.25	0.53	0.35	0.54	0.43	0.37
LJCHANGYE24196 (CK1)	-6.78	-6.31	-7.12	0.4	0.27	-0.13	-0.05	-0.86	0.38	0.6	0.57	0.28	0.31	0.45	0.59	0.02	0.47
LJCHANGYE25709	-5.64	-4.94	-5.25	0.45	0.43	0.16	0.13	0.45	0.5	0.13	0.53	0.49	0.28	0.04	0.4	-0.77	0.17
LJCHANGYE26573 (ATU2AF35A)	-1.35	-1.4	-1.31	0.46	0.47	0.09	0.48	-0.16	0.01	-0.19	-0.4	-0.6	0.25	0.36	0.45	0.29	0.43
LJCHANGYE27025	-5.87	-5.81	-5.63	0.49	-0.03	-0.52	0.45	-0.53	0.3	0.25	0.32	0.52	0.06	0.51	0.52	0.63	0.34
LJCHANGYE27171	-8.06	-8.24	-8.51	0.56	0.15	-0.08	-0.16	-1.33	0.47	0.47	0.4	0.36	0.21	0.28	0.81	0.18	0.64
LJCHANGYE27282	-9.69	-10.32	-10.06	0.57	0.66	0.01	-0.03	-0.13	0.6	0.17	0.15	0.32	0.5	0.29	0.42	-0.05	0.12
LJCHANGYE28154 (OEP16-3)	-2.42	-2.48	-2.44	0.28	0.56	0.13	0.0	-0.33	0.36	0.51	0.4	0.6	-0.32	0.02	0.27	0.22	0.19
LJCHANGYE28681	-	-	-	0.47	0.21	-0.35	-0.3	-0.59	0.41	0.5	0.48	0.28	0.4	0.34	0.86	-0.07	0.57
LJCHANGYE28709 (ADL2)	-3.5	-3.54	-3.5	0.37	0.25	0.01	0.23	-0.13	0.52	0.42	0.23	0.28	0.39	0.43	0.37	-0.17	0.2
LJCHANGYE30151	-6.42	-5.6	-7.15	0.47	-0.09	0.03	0.56	-0.08	0.19	0.67	0.27	0.32	0.44	0.11	0.37	-0.27	0.52
LJCHANGYE31508 (KEU)	-	-	-8.81	0.31	0.19	-0.05	-0.37	-0.11	0.48	0.46	0.32	-0.06	0.6	0.57	0.6	-0.05	0.58
LJCHANGYE33395	-6.41	-5.37	-6.05	0.47	0.06	0.25	-0.24	0.83	0.06	0.19	0.53	0.49	0.44	0.07	0.46	-0.6	0.3
LJCHANGYE33421 (U2AF35B)	-6.11	-6.24	-6.44	0.31	0.45	0.1	0.18	-0.1	0.26	0.16	0.33	0.12	0.35	0.19	0.49	0.24	0.64
LJCHANGYE33659	-5.07	-5.35	-5.29	0.11	0.04	0.03	-0.06	0.1	0.41	0.44	0.69	0.6	0.57	0.29	0.43	-0.63	0.3
LJCHANGYE33881	-6.85	-7.0	-7.28	0.39	0.29	0.1	0.1	0.01	0.08	0.05	0.31	0.21	0.6	0.17	0.59	0.21	0.58
LJCHANGYE34044	-3.6	-3.79	-3.56	0.48	-0.26	-0.49	0.55	-0.31	0.71	0.08	0.64	0.55	0.2	0.07	0.48	0.08	0.25
LJCHANGYE35172 (KEU)	-	-	-	0.5	0.46	-0.04	-0.09	-0.09	0.49	0.3	0.37	-0.22	0.49	0.39	0.5	-0.15	0.63
LJCHANGYE35401	-5.72	-5.45	-5.64	0.04	0.53	0.32	0.17	-0.21	0.32	0.69	0.27	0.47	0.22	-0.04	0.46	0.03	0.31
LJCHANGYE36059	-8.67	-	-	0.19	0.06	-0.15	0.1	0.13	0.21	0.68	0.68	0.3	0.38	0.28	0.53	-0.08	0.31
LJCHANGYE36133 (SC35)	-4.77	-4.71	-4.93	0.28	0.21	0.22	0.12	-0.65	0.4	0.04	0.23	0.27	0.61	0.42	0.51	0.42	0.33
LJCHANGYE36377	-7.96	-7.69	-7.07	0.62	-0.01	0.05	0.55	-0.5	0.72	0.32	0.11	0.21	0.13	0.51	0.29	0.35	0.13
LJCHANGYE36570 (SLT1)	-3.32	-3.97	-3.41	0.41	0.09	0.71	-0.03	0.63	0.16	0.11	0.47	0.11	0.27	0.01	0.41	-0.42	0.32
LJCHANGYE36697	-3.72	-3.98	-4.13	0.77	0.3	0.07	0.4	-0.77	0.17	0.58	0.31	0.23	0.47	0.08	0.29	-0.11	0.35
LJCHANGYE37690	-3.35	-3.55	-3.52	0.21	0.2	-0.06	-0.01	-0.21	0.1	0.38	0.64	0.58	0.29	0.28	0.46	0.12	0.36
LJCHANGYE38853	-4.34	-5.17	-4.1	0.35	0.11	-0.28	-0.16	-0.9	0.67	0.32	0.75	0.31	0.28	0.14	0.79	0.31	0.28
LJCHANGYE38970	-4.7	-4.53	-4.74	0.35	0.36	0.01	0.51	-0.5	0.32	0.34	0.36	0.51	-0.0	0.19	0.44	0.47	0.1
LJCHANGYE39727	-6.64	-6.62	-7.0	0.19	0.38	0.23	0.14	-0.48	0.34	0.6	-0.05	0.33	0.58	0.12	0.53	0.38	0.27
LJCHANGYE39916	-2.36	-2.58	-2.5	0.31	0.48	0.15	0.06	-0.27	0.21	0.12	0.25	0.06	0.23	0.25	0.56	0.17	0.5
LJCHANGYE39930 (FLU)	-5.3	-4.9	-4.58	0.24	0.44	0.15	0.17	-0.29	0.48	0.53	0.27	0.61	0.13	0.47	0.27	0.19	-0.11
LJCHANGYE40082 (MBD10)	-8.94	-8.92	-8.01	0.04	-0.14	0.17	-0.04	0.49	0.25	0.37	0.59	0.62	0.52	0.14	0.41	-0.01	0.24
LJCHANGYE41163	-2.99	-2.91	-3.21	0.13	0.24	-0.15	-0.16	-0.37	0.3	0.25	0.71	0.25	0.18	0.52	0.54	0.15	0.5
LJCHANGYE42268	-4.53	-4.8	-5.0	0.41	0.5	0.14	0.11	-0.38	0.19	0.56	0.44	0.49	0.23	0.18	0.44	-0.16	0.34
LJCHANGYE42460 (DegP9)	-4.05	-4.13	-3.99	0.23	0.34	-0.01	0.13	-0.04	0.31	0.09	0.38	0.36	0.48	0.35	0.46	0.41	0.08
LJCHANGYE44638	-6.91	-5.94	-6.74	0.5	0.56	0.42	0.32	-0.23	0.12	0.25	0.18	0.25	0.43	0.22	0.41	0.02	0.25
LJCHANGYE45622 (ATSRL1)	-4.35	-4.12	-4.56	0.25	0.09	0.04	-0.08	-0.34	0.15	0.29	0.67	0.48	0.35	0.39	0.55	-0.1	0.6
LJCHANGYE45835 (AR401)	-6.15	-6.22	-6.64	0.26	0.13	0.43	0.27	0.11	0.55	0.19	0.29	0.44	-0.02	0.05	0.31	0.3	0.47
LJCHANGYE47183 (TOC64-III)	-9.29	-9.88	-	0.59	0.21	0.22	0.68	-0.7	0.29	0.57	0.17	0.37	0.33	0.1	0.23	0.03	0.39
LJCHANGYE47215 (HON5)	-10.52	-10.79	-10.46	0.26	0.13	0.93	-0.12	0.05	0.22	0.39	0.23	0.25	0.29	0.07	0.61	-0.19	0.43
LJCHANGYE47414 (DRT111)	-2.89	-2.65	-2.84	0.38	0.04	-0.16	-0.13	-0.28	0.49	-0.05	0.5	0.39	0.53	0.33	0.51	0.15	0.35
LJCHANGYE48650 (RABA4a)	-6.38	-6.13	-6.23	0.33	0.4	-0.3	-0.27	-0.56	0.0	-0.05	0.87	0.57	0.45	0.55	0.57	0.2	0.41
LJCHANGYE49301	-4.44	-4.15	-4.59	0.27	0.11	-0.23	-0.49	-0.06	0.22	0.31	0.82	0.62	0.5	0.24	0.42	0.17	0.36
LJCHANGYE50030	-2.35	-2.38	-2.56	0.42	0.39	0.18	0.12	-0.22	0.22	0.36	0.05	-0.08	0.4	0.19	0.37	0.31	0.36
LJCHANGYE51182	-3.66	-3.46	-4.28	0.22	0.17	0.28	0.61	-0.58	0.57	0.55	0.28	0.66	0.16	0.2	0.22	-0.06	-0.07
LJCHANGYE51643	-3.74	-3.44	-3.48	0.24	-0.11	-0.23	0.05	-0.98	0.2	0.54	0.66	0.56	0.19	0.3	0.73	0.08	0.58
LJCHANGYE53947 (PAB8)	-2.94	-2.69	-3.1	0.7	-0.13	-0.38	-0.02	-1.44	0.68	0.57	0.14	0.56	0.24	0.33	0.52	-0.08	0.53
LJCHANGYE55115 (HAP15)	-4.01	-4.18	-4.1	0.37	0.03	-0.2	-0.54	-0.78	0.16	0.24	0.81	0.62	0.39	0.38	0.58	0.4	0.44
LJCHANGYE55257	-	-7.36	-	0.62	0.82	-0.32	-0.07	-0.85	0.69	0.56	0.37	0.54	0.39	0.27	0.45	-0.41	-0.11
LJCHANGYE55516 (MAP1A)	-4.29	-4.53	-4.66	0.21	0.18	0.18	0.37	-0.18	0.49	0.25	0.38	0.33	0.31	0.29	0.29	0.28	0.27
LJCHANGYE55745 (BBR)	-8.77	-	-	0.25	0.44	0.14	-0.09	-0.87	0.42	0.4	0.58	0.41	0.57	0.33	0.47	0.03	0.32
LJCHANGYE55798	-2.97	-2.59	-2.53	0.36	0.46	-0.18	-0.33	0.04	0.31	0.21	0.23	0.2	0.39	0.37	0.42	0.24	0.4
LJCHANGYE56048 (CPR30)	-5.23	-4.63	-3.79	0.72	-0.66	-0.27	0.58	-1.07	0.63	0.42	0.51	0.5	0.4	-0.0	0.48	0.3	0.15
LJCHANGYE56358 (PDV2)	-5.05	-4.66	-5.79	0.43	0.24	0.43	0.44	-0.55	0.45	0.74	0.27	0.21	0.36	0.02	0.24	0.07	0.09
LJCHANGYE56544	-5.61	-5.96	-5.45	0.52	0.16	-0.37	-0.62	-0.02	0.29	0.38	0.46	0.37	0.48	0.41	0.49	0.34	0.48
LJCHANGYE56554 (XRI)	-3.59	-3.41	-3.41	0.16	0.05	0.15	0.22	-1.33	0.55	0.62	0.44	0.47	0.4	0.16	0.48	0.26	0.18
LJCHANGYE59149 (U2AF35B)	-3.18	-2.95	-3.15	0.0	0.84	0.76	-0.14	0.5	0.26	0.2	-0.28	0.53	0.17	-0.14	0.42	-0.68	0.29
LJCHANGYE61325	-6.14	-6.13	-5.85	0.28	0.27	0.06	0.63	-0.58	0.49	0.4	0.45	0.42	0.09	0.05	0.54	0.15	0.24
LJCHANGYE61372 (MGP1)	-2.4	-2.47	-2.45	0.38	0.04	-0.28	-0.17	-0.71	0.35	0.36	0.46	0.65	0.36	0.28	0.48	0.1	0.41
LJCHANGYE61709 (OGG1)	-	-8.33	-6.76	-0.04	0.67	0.42	-0.18	-0.42	0.38	0.38	0.39	0.27	0.56	0.21	0.41	0.51	-0.08
LJCHANGYE61710 (OGG1)	-5.97	-	-6.15	0.39	0.42	-0.09	0.24	0.12	0.22	-0.49	0.46	0.2	0.6	0.46	0.38	0.1	0.53
LJCHANGYE65212	-8.19	-8.28	-8.46	0.15	0.69	0.59	-0.11	-0.37	0.21	0.36	0.16	0.58	0.05	0.01	0.44	0.36	0.41
LJCHANGYE65426	-5.98	-6.3	-6.64	0.11	0.01	-0.23	0.08	-0.04	0.25	0.29	0.6	0.18	0.46	0.42	0.66	0.14	0.62
LJCHANGYE65975 (PUR ALPHA-1)	-3.95	-4.05	-4.1	0.41	0.58	0.2	0.12	-0.32	0.29	0.08	0.65	0.36	-0.07	0.24	0.41	0.18	0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.