Heatmap: Cluster_262 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
flower bud,missing,no treatment
flower,missing,no treatment
root,missing,no treatment
seed,missing,no treatment
seedling,missing,no treatment
stem,missing,no treatment
tender shoot,missing,no treatment
young leaf,missing,no treatment
leaf,1-year-old,nitrogen deficiency
leaf,1-year-old,nitrate treatment
leaf,1-year-old,ammonia treatment
leaf,1-year-old,nitric oxide treatment
bud,missing,missing
second leaf,missing,no treatment
shoot,3-year-old,moderate drought
shoot,3-year-old,mild drought
shoot,3-year-old,sever drought
shoot,3-year-old,optimum water content
root,missing,missing
flower,missing,missing
leaf,missing,missing
leaf,5-year-old,missing
two leaves and a bud,missing,missing
leaf,10-year-old,missing
CSA000212.1 (CSA000212)
1.61 -1.28 -2.61 -0.59 -2.07 -1.42 0.55 0.79 -0.36 -0.49 -0.32 -0.42 -0.71 -0.34 0.88 0.41 0.86 0.49 -2.04 -2.39 0.39 0.13 0.43 -0.18
CSA000213.1 (CSA000213)
0.52 -1.18 -3.37 -0.72 -1.55 -1.29 0.27 0.51 -0.16 -0.26 -0.08 -0.04 -0.57 0.14 1.09 0.71 0.92 0.57 -2.44 -1.95 0.53 0.32 0.55 -0.2
CSA000540.1 (CSA000540)
1.56 -0.78 - 0.17 0.79 0.2 -1.18 0.93 -0.73 -0.24 -1.13 -2.19 -0.98 -0.69 0.63 0.74 0.78 0.77 -0.4 -4.46 -1.05 -0.57 0.21 0.13
CSA000846.1 (CSA000846)
1.35 -0.9 -0.27 -0.56 -0.87 -0.28 0.35 0.9 -0.08 -0.15 -0.2 -0.24 0.18 -0.27 0.25 0.3 0.25 0.3 -0.63 -0.83 -0.72 -0.65 0.4 -0.37
CSA001474.1 (CSA001474)
1.04 -1.66 -1.66 - -0.65 -1.72 -0.44 0.04 -1.55 -1.14 -0.59 -0.4 0.7 -0.61 0.78 0.13 0.91 0.22 -1.4 0.34 0.15 0.31 1.76 -0.19
CSA003577.1 (CSA003577)
-1.04 0.31 - - - - 1.02 1.54 -1.58 -2.99 -3.97 - 0.85 -1.32 1.03 1.1 1.16 0.88 -3.28 -3.41 -0.71 -1.78 1.86 0.7
CSA003687.1 (CSA003687)
1.19 -0.67 -1.49 0.34 -1.91 -0.48 -0.52 1.16 0.31 -0.18 -0.31 -0.76 -0.74 -0.3 0.45 0.37 0.2 0.36 -1.41 0.2 -0.05 -0.64 0.79 -0.6
CSA004263.1 (CSA004263)
0.86 0.16 -1.98 -3.2 -2.08 -1.88 -0.45 -0.53 -0.09 0.13 -0.27 -0.02 -0.12 -0.36 0.92 0.9 0.9 0.76 -1.59 -1.05 0.42 0.42 0.29 0.27
CSA004354.1 (CSA004354)
1.3 0.34 -0.11 -0.69 -1.08 -1.01 0.79 0.62 -0.49 -0.29 -0.54 -0.6 0.51 -0.61 0.28 0.16 0.31 0.16 -2.38 -1.19 -0.25 -0.29 0.88 -0.51
CSA005139.1 (CSA005139)
0.37 -1.64 - -0.02 -0.6 -0.67 -0.04 1.58 -0.37 0.35 -1.18 -0.65 1.21 -0.93 0.38 0.7 0.45 -0.03 -2.66 -0.61 -0.12 -1.44 1.28 -1.41
CSA005535.1 (CSA005535)
1.17 0.17 0.5 -1.59 - -1.57 -0.2 0.69 - -0.03 - -2.94 1.63 -1.14 -0.4 0.31 0.65 0.83 - -1.1 -0.52 -0.62 1.86 -0.73
CSA005757.1 (IDD4)
0.3 -1.28 -2.71 -0.74 -3.3 -1.88 0.5 1.77 0.05 -0.19 -0.03 -0.14 -1.16 0.29 0.76 0.66 0.53 0.66 -4.45 -2.84 0.18 0.22 0.49 -0.42
CSA006023.1 (DDB2)
0.22 -1.91 0.29 -2.3 -0.27 0.29 0.16 0.08 -0.22 -0.07 -0.19 -0.15 -0.6 -0.29 0.48 0.51 0.41 0.46 -0.93 -1.71 0.28 -0.03 0.94 0.46
CSA006410.1 (CSA006410)
1.16 -1.31 0.66 -0.31 -0.47 -0.28 -0.1 0.4 -0.0 -0.06 -0.39 -0.12 0.79 -0.58 0.12 -0.1 0.0 0.23 -1.41 -2.18 -0.68 -0.08 1.04 -0.46
CSA006436.1 (CSA006436)
1.32 -1.37 0.38 -2.54 0.28 -0.1 -0.62 1.33 -0.15 -0.37 0.05 -0.49 -1.03 -0.24 0.31 0.3 0.29 0.22 -1.08 -1.57 -0.2 -0.14 0.34 -0.22
CSA007974.1 (CSA007974)
0.26 1.97 - - - - 0.51 0.25 - - -2.49 - 1.93 -0.48 0.49 0.43 1.05 0.44 - -1.19 - -1.61 1.92 -0.24
CSA008696.1 (PAP10)
1.52 -0.32 -2.08 -2.41 -1.48 -1.17 -0.22 0.28 0.02 -0.0 0.01 -0.29 -0.61 0.16 0.46 0.42 0.39 0.43 -2.54 -2.75 -0.05 0.87 0.72 0.34
CSA008900.1 (SCO2)
0.72 0.88 -1.6 -2.2 -1.51 -1.36 -0.19 -0.11 -0.28 -0.72 -0.61 -0.62 -0.11 0.07 0.58 0.66 0.63 0.58 -1.91 -1.83 0.38 0.73 0.77 0.47
CSA009527.1 (CSA009527)
1.24 -0.63 -0.66 -1.43 0.53 -1.73 -0.73 0.92 -0.75 -0.38 -0.33 -1.61 0.38 -0.99 0.6 0.39 0.63 0.65 -0.14 -1.09 -0.17 -1.36 0.7 0.3
CSA010095.1 (CSA010095)
1.12 0.37 -1.28 -1.36 -0.69 -0.53 1.37 1.29 -0.5 -0.68 -0.33 -0.49 0.69 -0.69 0.21 -0.06 -0.07 0.02 -1.75 -1.23 -0.55 -0.74 0.7 -0.73
CSA010227.1 (CSA010227)
1.93 -2.8 -0.32 -0.41 -0.99 -1.38 -0.73 1.59 0.1 -1.08 0.16 -0.35 0.13 -1.73 0.16 -0.11 0.58 0.16 -2.22 -1.36 -0.09 -0.97 0.72 -0.33
CSA011601.1 (CSA011601)
0.6 -1.69 0.35 -2.13 0.2 0.54 -0.26 1.02 -0.13 -0.09 -0.3 -0.01 -0.62 -0.46 0.24 0.41 0.14 0.53 -1.26 -0.96 -0.05 -0.2 0.36 0.09
CSA011892.1 (CSA011892)
-0.03 -0.37 -0.65 -0.74 - -1.31 -0.5 0.75 -0.84 -0.98 -0.88 -1.58 1.37 -0.56 0.73 0.43 0.79 0.5 -1.59 -0.62 -0.09 -1.24 1.64 0.48
CSA012290.1 (CSA012290)
-0.25 -0.74 0.22 -0.98 0.21 0.12 0.31 0.58 0.08 0.07 -0.03 0.02 -1.14 -0.91 0.41 0.51 0.35 0.47 -0.42 -0.7 0.03 -0.32 0.12 0.18
CSA013058.1 (XI-I)
0.61 -0.71 -0.62 -0.78 -0.16 -0.38 0.88 0.65 -0.24 -0.32 -0.36 -0.72 0.69 -0.55 0.2 0.3 0.26 0.29 -1.14 -0.27 -0.23 -0.42 0.63 -0.01
CSA014021.1 (AFB2)
1.14 -1.36 0.88 -1.38 0.74 0.14 -0.78 0.97 -0.37 -0.47 -0.4 -0.56 -0.49 -0.07 0.01 -0.02 -0.08 0.09 -0.86 -0.8 -0.45 -0.08 0.66 -0.2
CSA014249.1 (WAV2)
0.48 -0.34 -0.44 -0.44 -0.48 -0.15 0.38 0.9 -0.28 -0.31 -0.43 -0.49 -0.33 -0.36 0.27 0.44 0.28 0.44 -0.75 -0.49 0.01 -0.16 0.41 0.28
CSA015098.1 (CSA015098)
1.44 -1.33 -0.42 0.63 -0.66 -0.49 -0.24 1.27 -0.27 0.03 -0.19 -0.58 -0.4 -0.23 0.2 0.42 0.29 0.2 -1.22 -2.23 -0.5 -0.63 0.24 -0.08
CSA015219.1 (CSA015219)
0.94 -0.55 0.08 -1.09 -0.22 -0.28 -0.64 1.01 -0.12 -0.09 -0.14 -0.49 -0.34 0.11 0.12 0.17 0.16 0.16 -0.1 -0.13 0.06 -0.22 0.04 -0.09
CSA015999.1 (CSA015999)
0.13 -0.73 0.23 -1.51 0.19 0.1 0.31 -0.2 -0.27 -0.64 -0.63 -0.81 0.12 -0.19 0.35 0.53 0.25 0.2 -0.83 -0.04 0.34 -0.24 1.04 0.05
CSA016714.1 (CSA016714)
1.78 -0.73 0.63 -2.79 -2.56 0.05 -0.22 1.82 -0.89 -1.21 0.64 -1.05 0.51 -0.83 -0.48 0.08 0.27 -0.31 -1.42 -1.68 -0.91 -0.62 0.49 -0.7
CSA017278.1 (SDD1)
1.79 0.22 - - - -0.1 - 1.63 - -1.51 - - -0.13 -2.62 -0.01 1.24 1.29 0.45 -1.68 - -0.13 -0.47 1.93 -0.03
CSA017424.1 (TAF11)
0.32 -0.61 -0.51 -1.06 -0.22 -0.85 -0.14 1.03 0.08 -0.24 0.1 0.1 -0.12 -0.16 0.44 0.46 0.36 0.4 -1.28 -0.17 -0.37 0.0 0.17 0.19
CSA017582.1 (CSA017582)
2.35 - -1.71 - - -2.78 -0.6 0.71 -0.3 -0.34 -1.93 -1.53 0.68 -0.01 1.17 0.77 0.9 0.7 -5.31 -3.01 -1.66 -0.95 0.96 -0.03
CSA018380.1 (CSA018380)
-0.79 -0.54 -0.92 -1.2 -0.66 -0.73 0.94 1.34 -1.79 -0.87 -1.9 -1.08 0.23 -0.45 0.88 0.68 1.02 0.65 -0.66 -1.76 -0.23 -0.84 1.2 -0.12
CSA019840.1 (CSA019840)
0.93 0.27 -1.07 -0.46 -1.43 -0.98 0.2 0.71 -0.9 -0.67 -0.85 -0.97 0.61 -0.05 0.4 0.11 0.62 0.56 -1.64 -0.71 -0.58 -0.54 1.47 -0.25
CSA019957.1 (CSA019957)
1.29 -0.38 -0.54 -0.49 -0.78 -0.16 -0.16 0.68 -0.1 -0.28 -0.08 -0.38 0.77 -0.03 0.26 0.3 0.33 0.18 -1.02 -0.69 -0.81 -0.22 0.38 -0.77
CSA020356.1 (CSA020356)
1.42 -0.31 -1.32 -3.0 -2.89 -1.38 0.62 1.17 -0.24 -0.52 -1.38 -1.51 1.2 -1.03 0.07 0.79 0.67 0.46 -3.46 -1.63 -1.01 -0.1 1.15 -0.3
CSA020545.1 (CSA020545)
2.01 -0.41 0.42 -1.99 -1.48 -1.96 1.37 1.0 -0.92 0.04 -0.26 -1.59 -0.33 -0.72 -0.1 0.02 -0.05 0.09 -4.47 -1.7 -0.02 -1.5 1.11 -1.18
CSA021337.1 (CSA021337)
1.26 -0.96 0.34 0.23 -0.14 0.04 0.18 1.14 -0.32 -0.34 -0.32 -0.72 -0.1 -0.49 -0.02 -0.16 -0.07 -0.06 -0.44 -0.57 -0.39 -0.42 0.33 -0.4
CSA021699.1 (CSA021699)
1.34 -1.57 -1.82 0.47 -1.79 0.11 -0.62 0.94 -1.34 -0.9 -0.67 -1.75 0.47 -0.37 0.57 0.14 0.65 0.19 -1.85 0.32 -0.48 -0.53 0.9 0.53
CSA021810.1 (CSA021810)
1.65 -2.66 -0.88 -7.32 -1.44 -0.31 -0.74 1.09 -0.6 -0.05 -0.41 -0.85 -0.41 -0.5 0.58 0.78 0.51 0.82 -3.32 -4.13 0.04 -0.21 0.69 0.83
CSA021991.1 (CSA021991)
1.11 -1.85 - - -1.46 - 0.61 2.24 -0.24 0.42 -2.22 0.02 1.03 -0.81 -1.01 0.31 -0.48 0.64 -2.28 -0.02 -0.84 -2.75 1.45 -1.79
1.44 0.1 -1.84 -3.07 -2.51 -1.53 -0.28 0.43 -0.29 0.1 -0.13 -0.02 -0.23 -0.22 0.72 0.54 0.61 0.66 -3.22 -0.66 0.12 0.06 0.34 0.38
CSA022885.1 (CDC2)
0.85 -1.57 -0.46 -1.07 -0.69 -1.26 -0.22 1.19 -0.79 -0.42 -0.49 -0.87 0.38 -0.7 0.63 0.64 0.76 0.71 -1.71 -0.08 -0.56 -0.77 1.06 -0.09
CSA023193.1 (CSA023193)
0.9 -0.05 -1.15 -0.98 -0.54 -1.58 0.96 1.03 -0.6 -0.38 -0.77 -0.59 0.16 -0.23 0.29 0.39 0.3 0.34 -1.35 -0.89 -0.24 -0.03 1.06 -0.55
CSA025047.1 (CSA025047)
0.89 -0.19 -0.37 -1.15 0.22 -0.18 -0.17 1.27 -0.5 -0.38 -0.21 -1.07 -0.11 -0.53 0.42 0.37 0.31 0.36 -1.41 -0.92 -0.26 -0.12 0.48 0.1
CSA025255.1 (CSA025255)
2.29 - -1.23 - - - -1.85 2.14 -0.21 - - - -0.38 - 0.85 1.04 1.06 0.83 - -3.61 -0.11 -1.32 1.24 -0.22
CSA025564.1 (VPS33)
0.37 -2.3 -0.09 -0.47 -0.13 -0.29 -0.73 0.79 -0.2 -0.11 -0.19 0.05 -0.37 0.04 0.35 0.4 0.34 0.44 -1.35 -1.3 0.59 0.21 0.6 0.11
CSA025652.1 (CRK8)
0.8 -0.71 -0.76 -1.15 -0.89 -1.49 -0.63 1.46 -0.5 -0.23 -0.77 -0.54 0.49 -0.38 0.54 0.74 0.51 0.64 -2.58 -0.59 -0.41 -0.34 1.1 -0.52
CSA025868.1 (CSA025868)
0.07 -0.42 -0.57 -0.08 -0.15 -0.43 0.4 0.88 -0.38 -0.17 -0.75 -0.64 0.44 -0.58 0.47 0.65 0.48 0.45 -1.38 -1.85 -0.09 -0.37 0.66 0.24
CSA026251.1 (ORF240B)
0.41 -0.7 0.51 - - -0.74 -0.04 0.37 0.67 -0.68 - - 0.05 -1.6 0.7 0.88 0.86 0.68 -4.11 -0.1 0.48 -0.54 1.93 -1.14
CSA026381.1 (CRK8)
1.48 0.37 -1.62 -0.79 -1.62 -1.34 0.56 1.24 -1.73 -1.19 -2.43 -2.87 0.76 -0.54 0.07 0.41 0.2 0.42 -1.91 -0.2 0.61 -0.33 1.21 -1.38
CSA026521.1 (CDC48C)
1.0 -1.52 -0.77 -0.86 -0.5 -0.91 0.14 0.87 -0.13 -0.09 0.17 -0.39 0.52 -0.29 0.33 0.39 0.33 -0.01 -0.54 -0.87 0.13 -0.49 0.96 -0.83
CSA026708.1 (CSA026708)
1.48 0.02 -5.0 -3.51 -2.95 -1.89 -0.26 0.97 -0.25 0.18 -0.42 -0.65 0.33 0.12 0.54 0.44 0.54 0.38 -3.88 -0.59 0.43 0.73 -0.33 0.11
CSA027001.1 (CSA027001)
-0.12 -0.97 -0.14 -1.09 -0.78 -0.51 0.29 0.83 -0.11 -0.02 0.05 0.03 -0.17 -0.19 0.43 0.66 0.25 0.46 -1.76 -1.73 0.36 0.14 0.57 0.28
CSA027405.1 (ABIL1)
1.06 -0.78 0.41 -0.83 -0.65 -0.76 -0.36 1.09 -0.47 -0.51 -0.34 -0.6 -0.65 0.07 0.49 0.58 0.44 0.44 -0.43 -0.37 -0.44 -0.3 0.13 -0.01
CSA027926.1 (CRK8)
0.62 0.27 -0.79 -0.55 -0.21 -1.29 0.69 1.1 -0.32 0.24 -0.9 -1.31 1.0 -0.52 0.29 0.24 0.26 -0.04 -2.4 -0.5 -0.28 -0.52 0.94 -1.16
CSA028439.1 (CSA028439)
1.81 -2.23 - - -0.23 0.38 -1.04 1.82 -1.3 -0.54 -2.09 -0.82 -0.48 -2.41 0.75 0.76 0.9 0.76 -1.98 -4.52 -0.82 -0.76 0.89 0.13
CSA028572.1 (MGT4)
1.55 0.17 -2.12 -2.56 -1.92 -1.06 -1.43 0.14 0.02 -0.05 0.05 0.53 -0.24 -0.14 0.71 0.78 0.78 0.76 -3.65 -0.48 -0.64 -0.1 0.07 -0.1
CSA028908.1 (AFB5)
0.76 -1.26 0.44 -1.09 0.44 0.97 -0.3 0.79 -0.12 -0.05 -0.3 -0.33 -0.42 -0.08 0.09 0.14 0.01 0.25 -1.37 -0.8 -0.43 -0.23 0.25 -0.13
CSA029309.1 (CSA029309)
0.65 -0.35 -0.48 -2.21 -1.41 -2.99 -0.38 1.15 -0.31 -0.36 -0.66 -1.47 0.7 -0.64 0.61 0.8 0.53 0.51 -1.69 -0.47 -0.17 0.1 1.29 -0.31
CSA029637.1 (CSA029637)
0.85 -0.65 -0.39 -2.06 -0.41 -0.71 0.26 1.96 -0.96 -0.67 -1.27 -0.47 0.68 -0.8 0.0 -0.2 0.19 -0.29 -1.99 -0.07 -0.99 0.08 1.25 -0.57
CSA029915.1 (SQE3)
0.61 0.25 -0.3 -1.25 -1.18 -0.92 1.22 0.53 -0.13 0.4 -0.31 -1.22 -0.38 -0.21 0.18 0.21 0.19 0.15 -1.19 0.31 -0.21 -0.56 0.77 -0.43
CSA030102.1 (CSA030102)
1.35 0.94 -0.6 0.67 0.32 0.19 -2.38 1.85 -1.17 -0.25 -0.94 -3.89 -0.9 -0.95 0.17 0.08 0.05 0.07 -1.17 -0.16 -1.17 -0.84 -0.12 -0.67
CSA030156.1 (CSA030156)
1.6 -2.96 -3.34 -3.43 - -0.83 0.38 -0.54 -0.25 0.35 -1.23 0.13 -3.61 -1.23 1.48 0.37 1.34 0.48 -3.72 -2.73 0.67 0.37 1.04 -0.34
CSA030216.1 (CSA030216)
1.98 -1.88 -2.35 -1.44 - -0.83 1.41 1.27 -0.01 -1.22 -1.64 -1.68 -0.49 -0.07 0.11 -0.31 0.13 0.36 -3.89 0.54 -0.83 -0.67 1.15 -0.62
CSA030255.1 (emb1381)
0.73 -0.75 -0.36 -0.95 -0.38 -0.35 0.03 0.53 -0.13 -0.29 -0.34 0.24 -0.4 -0.33 0.37 0.51 0.38 0.59 -0.88 -1.74 0.24 -0.21 0.58 0.35
CSA031205.1 (CSA031205)
1.48 0.18 -1.76 -3.86 -1.43 -2.83 0.63 2.09 -1.38 -1.76 -1.41 -2.19 0.79 -0.71 0.22 -0.15 0.02 0.04 -3.95 -0.28 -1.61 -1.01 1.85 -1.42
CSA031207.1 (CSA031207)
1.85 0.97 -3.08 -3.17 -2.06 -2.57 0.32 1.64 -2.75 -1.24 -1.55 -2.57 0.44 -0.93 0.4 0.27 0.14 0.42 -4.21 -0.64 -1.52 -1.45 1.82 -0.9
CSA033295.1 (SDH5)
1.79 -0.69 -0.93 -2.05 0.64 0.89 -0.95 1.54 -1.4 -0.28 -0.73 -4.53 -0.64 -0.73 0.32 0.04 0.3 0.5 -2.85 -1.47 -0.35 -0.21 0.54 -0.48
CSA033408.1 (CSA033408)
0.48 -0.28 0.89 -1.79 -0.8 -0.57 -0.15 0.78 -1.71 -1.73 -2.79 -3.9 0.51 -0.05 0.93 0.93 0.75 0.68 -2.71 -2.05 -3.1 0.38 1.49 -0.22
CSA034735.1 (CVL1)
0.7 -3.84 -0.34 -2.67 -0.27 -0.11 -0.36 1.39 0.06 0.41 -0.09 -0.0 -0.2 -0.07 0.37 0.64 0.35 0.63 -4.4 -1.73 -0.93 -0.22 0.63 0.18
CSA035550.1 (CSA035550)
0.12 -1.69 0.29 -1.19 0.14 -0.1 -0.05 -0.58 -0.51 0.22 -0.74 0.09 -0.13 -0.48 0.43 0.47 0.42 0.62 -0.78 -1.11 0.5 0.01 1.09 -0.15
CSA035909.1 (ARF16)
0.75 -1.52 -0.45 -0.88 -1.24 -0.62 1.02 0.84 -0.18 -0.4 -0.24 -0.3 -2.37 0.15 0.51 0.59 0.51 0.55 -2.11 -0.81 0.29 -0.04 0.64 -0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.