Heatmap: Cluster_297 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	root,3-year-old,no treatment	root,3-year-old,ammonium treatment	leaf,3-year-old,no treatment	leaf,3-year-old,ammonium treatment	pistil,10-year-old,no treatment	old leaf,4-year-old,no treatment	fourth leaf,4-year-old,no treatment	third leaf,4-year-old,no treatment	second leaf,4-year-old,no treatment	one leaf and a bud,4-year-old,no treatment	leaf,9-year-old,no treatment	two leaves and a bud,missing,no treatment	trichome,missing,no treatment	root,missing,no treatment	stem,missing,no treatment	leaf,missing,no treatment	second leaf,missing,no treatment	lateral root,high nitrogen (2.5 mM)	lateral root,control (1 mM)	lateral root,low nitrogen (0.25 mM)	lateral root,high nitrogen(2.5 mM),IBA(0.4 mM)	lateral root,low nitrogen(0.25 mM),NPA(20 uM)	shoot,missing,control	root,missing,organic nitrogen treatment	root,missing,high nitrogen treatment	root,missing,low nitrogen treatment	shoot,missing,organic nitrogen treatment	shoot,missing,high nitrogen treatment	shoot,missing,low nitrogen treatment	root,missing,control	mix nine tissues,no treatment	root,2-year-old,As treatment	root,2-year-old,Cd treatment	root,2-year-old,no treatment
FUDINGDABAI01247 (CVL1)	0.14	0.08	0.53	0.33	0.35	0.14	0.2	0.27	0.29	0.35	0.21	0.4	0.18	0.33	0.58	0.32	0.19	0.21	0.21	0.14	0.02	0.13	0.24	0.19	0.17	0.15	0.18	0.27	0.17	0.18	1.0	0.16	0.27	0.18
FUDINGDABAI01253 (CVL1)	0.11	0.04	0.34	0.22	0.26	0.1	0.15	0.21	0.24	0.28	0.22	0.31	0.13	0.31	0.49	0.35	0.13	0.1	0.16	0.11	0.02	0.1	0.19	0.13	0.11	0.12	0.12	0.18	0.1	0.15	1.0	0.17	0.3	0.14
FUDINGDABAI02500 (SPA3)	0.14	0.21	0.72	0.7	0.52	0.4	0.34	0.36	0.34	0.43	0.58	0.49	0.44	0.2	0.86	1.0	0.17	0.1	0.09	0.1	0.06	0.07	0.32	0.2	0.15	0.16	0.41	0.4	0.3	0.14	0.35	0.24	0.28	0.19
FUDINGDABAI02537	0.12	0.35	0.35	0.51	0.42	0.42	0.39	0.47	0.36	0.42	0.69	0.72	0.19	0.38	0.88	1.0	0.12	0.09	0.08	0.1	0.02	0.04	0.13	0.12	0.12	0.16	0.08	0.25	0.1	0.26	0.77	0.19	0.22	0.13
FUDINGDABAI02666 (HCF107)	0.13	0.39	0.48	0.53	0.33	0.36	0.43	0.4	0.43	0.37	0.3	0.66	0.34	0.33	0.72	0.75	0.25	0.11	0.11	0.14	0.06	0.11	0.21	0.14	0.11	0.12	0.19	0.25	0.18	0.13	1.0	0.12	0.18	0.09
FUDINGDABAI03561 (TT8)	0.14	0.14	0.68	0.48	0.41	0.17	0.22	0.25	0.31	0.33	0.3	0.45	0.26	0.32	0.59	0.29	0.3	0.11	0.09	0.1	0.07	0.09	0.15	0.09	0.1	0.09	0.13	0.14	0.12	0.08	1.0	0.21	0.25	0.21
FUDINGDABAI03619 (DCP5)	0.08	0.08	0.28	0.24	0.27	0.13	0.19	0.17	0.15	0.19	0.29	0.54	0.14	0.3	0.52	0.43	0.04	0.08	0.06	0.1	0.03	0.03	0.15	0.07	0.06	0.07	0.15	0.18	0.09	0.06	1.0	0.07	0.12	0.06
FUDINGDABAI03826	0.26	0.4	0.46	0.46	0.49	0.44	0.51	0.55	0.57	0.62	0.58	0.67	0.51	0.43	0.68	0.83	0.39	0.26	0.22	0.33	0.07	0.31	0.49	0.42	0.44	0.44	0.42	0.5	0.29	0.46	1.0	0.44	0.46	0.39
FUDINGDABAI04711	0.25	0.13	0.51	0.43	0.49	0.34	0.48	0.51	0.45	0.44	0.47	0.41	0.32	0.4	0.62	0.7	0.55	0.1	0.07	0.15	0.08	0.12	0.3	0.2	0.19	0.23	0.27	0.33	0.15	0.25	1.0	0.22	0.25	0.24
FUDINGDABAI04712	0.3	0.22	0.58	0.41	0.64	0.3	0.41	0.37	0.36	0.32	0.57	0.41	0.36	0.48	0.65	0.72	0.53	0.19	0.15	0.19	0.17	0.19	0.46	0.31	0.3	0.31	0.37	0.44	0.34	0.28	1.0	0.35	0.38	0.39
FUDINGDABAI09352	0.1	0.11	0.13	0.1	0.18	0.09	0.15	0.15	0.12	0.12	0.2	0.39	0.11	0.21	0.29	0.22	0.06	0.1	0.09	0.11	0.03	0.07	0.16	0.1	0.11	0.12	0.13	0.15	0.08	0.08	1.0	0.16	0.19	0.12
FUDINGDABAI09548	0.41	0.32	0.42	0.37	0.57	0.18	0.31	0.38	0.35	0.34	0.42	0.37	0.24	0.28	0.66	0.38	0.28	0.11	0.09	0.17	0.02	0.12	0.29	0.19	0.22	0.24	0.27	0.28	0.24	0.24	1.0	0.37	0.4	0.27
FUDINGDABAI13513 (PGP1)	0.55	0.47	0.99	0.89	0.9	0.63	0.93	0.81	0.85	0.73	0.83	0.66	0.46	0.64	0.95	1.0	0.84	0.5	0.44	0.49	0.33	0.46	0.69	0.51	0.53	0.51	0.66	0.65	0.57	0.47	0.92	0.59	0.66	0.61
FUDINGDABAI14151	0.19	0.24	0.22	0.08	0.18	0.09	0.19	0.18	0.12	0.15	0.21	0.42	0.11	0.27	0.22	0.24	0.09	0.02	0.0	0.1	0.0	0.02	0.15	0.1	0.06	0.08	0.07	0.1	0.07	0.11	1.0	0.06	0.08	0.15
FUDINGDABAI14762	0.18	0.24	0.42	0.43	0.44	0.41	0.42	0.44	0.39	0.45	0.57	0.37	0.4	0.3	0.57	0.87	0.38	0.16	0.13	0.2	0.14	0.11	0.42	0.36	0.35	0.37	0.34	0.38	0.26	0.4	1.0	0.28	0.27	0.26
FUDINGDABAI15089	0.17	0.17	0.32	0.24	0.25	0.26	0.39	0.36	0.32	0.35	0.32	0.37	0.22	0.37	0.55	0.55	0.36	0.14	0.1	0.2	0.17	0.19	0.21	0.14	0.13	0.17	0.15	0.26	0.11	0.15	1.0	0.13	0.14	0.13
FUDINGDABAI15494	0.09	0.09	0.25	0.23	0.22	0.2	0.19	0.22	0.27	0.22	0.28	0.19	0.13	0.23	0.48	0.25	0.26	0.06	0.09	0.05	0.03	0.05	0.2	0.07	0.08	0.09	0.16	0.14	0.15	0.08	1.0	0.11	0.08	0.12
FUDINGDABAI16207 (SPA3)	0.05	0.06	0.44	0.37	0.38	0.26	0.15	0.16	0.19	0.23	0.3	0.25	0.3	0.1	0.71	1.0	0.12	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.19	0.15	0.08	0.11	0.31	0.2	0.17	0.07	0.4	0.13	0.12	0.11
FUDINGDABAI16930 (VIIIA)	0.15	0.13	0.31	0.3	0.4	0.23	0.35	0.34	0.34	0.34	0.37	0.39	0.38	0.26	0.67	0.69	0.23	0.11	0.08	0.12	0.07	0.06	0.27	0.2	0.2	0.22	0.29	0.26	0.19	0.21	1.0	0.14	0.19	0.15
FUDINGDABAI17705 (UGT85A5)	0.01	0.02	0.36	0.21	0.13	0.27	0.09	0.1	0.11	0.12	0.26	0.13	0.08	0.03	0.35	0.28	0.12	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.1	0.01	0.01	0.02	0.16	0.16	0.16	0.01	1.0	0.01	0.01	0.01
FUDINGDABAI18356 (ckl10)	0.13	0.19	0.09	0.11	0.09	0.27	0.24	0.24	0.22	0.24	0.24	0.18	0.18	0.24	0.45	0.23	0.07	0.03	0.04	0.07	0.04	0.05	0.11	0.07	0.09	0.1	0.08	0.12	0.05	0.14	1.0	0.05	0.07	0.07
FUDINGDABAI20724 (CRK8)	0.1	0.31	0.26	0.46	0.44	0.32	0.23	0.28	0.18	0.24	0.41	0.5	0.14	0.32	0.69	1.0	0.09	0.01	0.0	0.06	0.07	0.04	0.15	0.13	0.09	0.1	0.16	0.18	0.06	0.12	0.55	0.09	0.21	0.15
FUDINGDABAI20990	0.49	0.48	0.72	0.61	0.56	0.57	0.52	0.58	0.61	0.63	0.83	0.73	0.54	0.7	0.82	0.96	0.37	0.45	0.38	0.43	0.27	0.37	0.62	0.48	0.48	0.53	0.52	0.58	0.46	0.49	1.0	0.55	0.63	0.46
FUDINGDABAI21334	0.55	0.53	0.65	0.6	0.68	0.51	0.45	0.38	0.37	0.44	0.52	0.5	0.39	0.52	0.49	0.57	0.62	0.33	0.28	0.32	0.18	0.23	0.52	0.44	0.47	0.47	0.45	0.54	0.53	0.44	1.0	0.41	0.46	0.33
FUDINGDABAI22430	0.22	0.26	0.32	0.31	0.4	0.39	0.31	0.32	0.31	0.36	0.41	0.51	0.43	0.33	0.67	0.52	0.25	0.19	0.16	0.23	0.14	0.18	0.33	0.28	0.29	0.32	0.29	0.35	0.24	0.3	1.0	0.27	0.29	0.23
FUDINGDABAI23630 (NTRC)	0.24	0.15	0.31	0.49	0.14	0.28	0.31	0.28	0.31	0.21	0.27	0.34	0.1	0.11	0.29	1.0	0.21	0.01	0.03	0.02	0.0	0.04	0.3	0.04	0.06	0.05	0.19	0.25	0.14	0.03	0.09	0.03	0.17	0.06
FUDINGDABAI24506	0.07	0.06	0.13	0.14	0.48	0.38	0.28	0.26	0.19	0.15	0.43	0.28	0.18	0.13	0.67	1.0	0.27	0.06	0.06	0.08	0.05	0.06	0.33	0.1	0.1	0.11	0.32	0.36	0.3	0.11	0.78	0.05	0.05	0.06
FUDINGDABAI24529 (MGD1)	0.11	0.1	0.13	0.25	0.29	0.15	0.14	0.27	0.22	0.22	0.27	0.5	0.23	0.2	0.61	1.0	0.11	0.02	0.0	0.06	0.01	0.01	0.22	0.08	0.09	0.09	0.2	0.24	0.12	0.09	0.78	0.08	0.16	0.08
FUDINGDABAI27024 (RH1)	0.27	0.19	0.27	0.25	0.34	0.43	0.32	0.28	0.34	0.34	0.47	0.44	0.31	0.52	0.57	0.45	0.22	0.34	0.21	0.21	0.11	0.14	0.36	0.25	0.29	0.28	0.27	0.42	0.35	0.32	1.0	0.35	0.29	0.27
FUDINGDABAI27439	0.09	0.07	0.24	0.21	0.16	0.18	0.25	0.26	0.29	0.29	0.28	0.29	0.19	0.19	0.68	0.35	0.35	0.07	0.06	0.07	0.03	0.07	0.18	0.08	0.08	0.08	0.15	0.18	0.12	0.07	1.0	0.08	0.09	0.06
FUDINGDABAI28430	0.24	0.14	0.2	0.14	0.25	0.36	0.42	0.57	0.43	0.46	0.49	0.7	0.38	0.38	0.76	1.0	0.11	0.07	0.01	0.05	0.01	0.02	0.19	0.12	0.13	0.18	0.2	0.33	0.08	0.29	0.78	0.11	0.23	0.02
FUDINGDABAI28461 (ftsh9)	0.36	0.43	0.56	0.47	0.47	0.52	0.41	0.38	0.41	0.43	0.46	0.44	0.32	0.38	0.51	0.66	0.43	0.22	0.21	0.29	0.15	0.23	0.41	0.36	0.36	0.39	0.39	0.44	0.3	0.39	1.0	0.31	0.25	0.29
FUDINGDABAI33312 (ATB BETA)	0.21	0.18	0.39	0.28	0.55	0.45	0.25	0.36	0.36	0.35	0.39	0.56	0.46	0.29	0.64	0.88	0.28	0.08	0.06	0.09	0.04	0.07	0.32	0.12	0.1	0.12	0.34	0.39	0.26	0.1	1.0	0.18	0.21	0.17
FUDINGDABAI34274	0.08	0.09	0.37	0.37	0.16	0.26	0.3	0.32	0.32	0.3	0.32	0.36	0.22	0.14	0.51	0.54	0.51	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.17	0.09	0.08	0.1	0.21	0.24	0.18	0.09	1.0	0.08	0.06	0.07
FUDINGDABAI34852	0.04	0.06	0.33	0.36	0.09	0.31	0.19	0.21	0.17	0.09	0.35	0.41	0.18	0.17	0.38	1.0	0.22	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.28	0.06	0.02	0.06	0.43	0.28	0.23	0.07	0.69	0.03	0.14	0.02
FUDINGDABAI34879 (SSI2)	0.45	0.17	0.84	0.75	0.58	0.5	0.83	0.57	0.56	0.44	0.95	0.42	0.35	0.44	0.65	0.78	0.61	0.27	0.28	0.22	0.08	0.13	0.6	0.28	0.29	0.32	0.69	0.56	0.52	0.36	1.0	0.36	0.39	0.38
FUDINGDABAI38692	0.12	0.13	0.11	0.14	0.13	0.37	0.24	0.19	0.17	0.13	0.31	0.31	0.16	0.18	0.33	0.33	0.17	0.04	0.01	0.04	0.04	0.13	0.18	0.11	0.06	0.04	0.09	0.16	0.06	0.1	1.0	0.07	0.08	0.09
FUDINGDABAI39073 (IAA16)	0.07	0.05	0.21	0.11	0.22	0.27	0.08	0.12	0.22	0.38	0.15	0.17	0.3	0.19	0.62	0.3	0.35	0.04	0.05	0.04	0.12	0.04	0.07	0.08	0.04	0.06	0.16	0.06	0.09	0.05	1.0	0.03	0.03	0.02
FUDINGDABAI39975	0.45	0.36	0.58	0.46	0.51	0.55	0.39	0.4	0.41	0.4	0.51	0.47	0.29	0.48	0.58	0.55	0.47	0.34	0.28	0.3	0.09	0.23	0.46	0.37	0.4	0.41	0.37	0.46	0.41	0.41	1.0	0.37	0.43	0.34
FUDINGDABAI40775 (ATSRL1)	0.19	0.2	0.32	0.3	0.31	0.26	0.27	0.3	0.33	0.28	0.41	0.54	0.35	0.36	0.58	0.77	0.16	0.04	0.03	0.06	0.02	0.02	0.25	0.14	0.12	0.15	0.19	0.23	0.21	0.09	1.0	0.19	0.29	0.2
FUDINGDABAI40850 (NRP2)	0.49	0.37	0.45	0.4	0.41	0.38	0.4	0.42	0.48	0.5	0.55	0.51	0.41	0.68	0.62	0.54	0.31	0.32	0.29	0.26	0.16	0.26	0.41	0.34	0.39	0.35	0.28	0.39	0.36	0.35	1.0	0.42	0.46	0.37
FUDINGDABAI41581	0.16	0.19	0.64	0.57	0.35	0.2	0.24	0.27	0.28	0.31	0.29	0.27	0.38	0.2	0.8	1.0	0.15	0.07	0.07	0.07	0.02	0.08	0.15	0.17	0.1	0.11	0.38	0.2	0.23	0.08	0.22	0.13	0.14	0.12
FUDINGDABAI43480	0.14	0.15	0.4	0.33	0.19	0.22	0.33	0.27	0.29	0.34	0.33	0.41	0.28	0.26	0.45	0.32	0.38	0.22	0.21	0.18	0.14	0.14	0.33	0.17	0.18	0.2	0.25	0.27	0.24	0.19	1.0	0.2	0.21	0.22
FUDINGDABAI44663 (LSF1)	0.22	0.22	0.08	0.48	0.39	0.3	0.2	0.32	0.25	0.21	0.31	0.68	0.2	0.45	0.65	0.72	0.06	0.03	0.04	0.19	0.05	0.02	0.3	0.07	0.03	0.15	0.18	0.24	0.24	0.06	1.0	0.11	0.19	0.0
FUDINGDABAI44801	0.38	0.39	0.61	0.45	0.67	0.53	0.47	0.46	0.55	0.56	0.74	0.75	0.63	0.68	0.87	0.71	0.43	0.39	0.33	0.38	0.33	0.28	0.62	0.46	0.51	0.56	0.47	0.65	0.52	0.54	1.0	0.4	0.39	0.4
FUDINGDABAI50340	0.67	0.43	0.79	0.79	0.35	0.39	0.39	0.37	0.42	0.53	0.76	0.71	0.43	0.73	0.68	0.73	0.35	0.35	0.31	0.33	0.19	0.33	0.55	0.39	0.4	0.46	0.46	0.51	0.45	0.51	1.0	0.48	0.59	0.41
FUDINGDABAI53673	0.05	0.05	0.16	0.15	0.24	0.11	0.11	0.11	0.13	0.13	0.22	0.36	0.15	0.38	0.5	0.28	0.03	0.06	0.03	0.08	0.03	0.03	0.16	0.07	0.05	0.08	0.14	0.15	0.12	0.08	1.0	0.07	0.11	0.11
FUDINGDABAI54076 (TZP)	0.01	0.06	0.72	0.66	0.41	0.28	0.28	0.3	0.32	0.38	0.38	0.46	0.47	0.01	0.8	1.0	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.33	0.23	0.14	0.15	0.46	0.34	0.3	0.09	0.7	0.0	0.0	0.0
FUDINGDABAI57926	0.15	0.22	0.7	0.69	0.53	0.43	0.6	0.63	0.55	0.62	0.6	0.52	0.3	0.5	0.78	1.0	0.62	0.09	0.09	0.08	0.02	0.1	0.49	0.22	0.17	0.14	0.3	0.56	0.19	0.25	0.8	0.3	0.2	0.18
FUDINGDABAI57927	0.23	0.34	0.61	0.57	0.56	0.39	0.4	0.39	0.44	0.42	0.67	0.48	0.38	0.41	0.65	0.59	0.64	0.26	0.22	0.21	0.06	0.2	0.6	0.33	0.41	0.4	0.49	0.62	0.46	0.43	1.0	0.43	0.41	0.44
FUDINGDABAI59424	0.24	0.29	0.67	0.55	0.68	0.42	0.4	0.41	0.43	0.44	0.56	0.36	0.27	0.34	0.44	0.52	0.68	0.19	0.19	0.2	0.13	0.23	0.48	0.39	0.33	0.32	0.37	0.43	0.35	0.41	1.0	0.38	0.29	0.32
FUDINGDABAI60271 (FUS1)	0.14	0.15	0.5	0.46	0.43	0.51	0.4	0.37	0.34	0.32	0.44	0.49	0.35	0.16	0.66	1.0	0.33	0.09	0.09	0.1	0.11	0.11	0.38	0.22	0.17	0.21	0.36	0.39	0.34	0.16	0.77	0.14	0.13	0.12
FUDINGDABAI60399 (ORF102)	0.37	0.46	0.59	0.47	0.49	0.52	0.36	0.49	0.5	0.5	0.61	0.87	0.31	0.4	0.95	1.0	0.18	0.2	0.17	0.25	0.06	0.06	0.2	0.21	0.13	0.18	0.17	0.16	0.13	0.23	0.7	0.33	0.27	0.28
FUDINGDABAI60604	0.25	0.27	0.33	0.37	0.55	0.46	0.48	0.49	0.44	0.49	0.57	0.61	0.55	0.6	0.78	0.86	0.18	0.11	0.1	0.17	0.22	0.09	0.36	0.3	0.29	0.36	0.33	0.4	0.18	0.42	1.0	0.43	0.43	0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)